mmjsonフォーマットについて
"PDBx/mmJSON"は、"PDBx/mmCIF"をJSON形式で表現した、PDBjが開発したファイルフォーマットです。
以下のサービスでは、mmJSON形式を使用しています。
PDBjはまた、PDBや、化合物(chem_comp)、化合物モデル、PRD/BIRDエントリーを、 PDBjデータサイトから提供しており、 rsync等を利用して、以下の場所から取得して頂けます。
- Mine PDBエクスプローラ
- Mine CIF クエリサービス
- Molmil
- CIF ツリーツール
PDBjはまた、PDBや、化合物(chem_comp)、化合物モデル、PRD/BIRDエントリーを、 PDBjデータサイトから提供しており、 rsync等を利用して、以下の場所から取得して頂けます。
PDBエントリー | all | https://data.pdbjlc1.pdbj.org/pdbjplus/data/pdb/mmjson/ |
noatom | https://data.pdbjlc1.pdbj.org/pdbjplus/data/pdb/mmjson-noatom/ | |
add only | https://data.pdbjlc1.pdbj.org/pdbjplus/data/pdb/mmjson-plus/ | |
化合物(Chem_comp)エントリー | https://data.pdbjlc1.pdbj.org/pdbjplus/data/cc/mmjson/ | |
化合物(Chem_comp)モデルエントリー | https://data.pdbjlc1.pdbj.org/pdbjplus/data/ccmodel/mmjson/ | |
PRD/BIRDエントリー | https://data.pdbjlc1.pdbj.org/pdbjplus/data/prd/mmjson/ |
作成日: 2018-09-26 (最終更新日: more than 1 year ago)