PDBj Mine

• 検索サービス
• PDBj Mine

PDBj Mine はPDBjで開発した、PDBエントリーの検索サービスです。以下のような特徴があります。

1. PDBj Mine は関係データベース（PortgreSQL）を使っています。
2. 簡易検索（キーワード検索）、詳細検索、SQL検索などの検索方法を提供しています。後に挙げた検索方法の方がより詳細な検索に向いています。
3. 各種検索語には日本語が使え、自動的に英語に変換して検索が行われます。
4. 結果はウェブページで得られる他、各種フォーマットでダウンロードすることもできます。
5. REST APIを使って検索を行い、結果を得ることもできます。

各検索方法については以下をご覧ください。

• 簡易検索
• 詳細検索
• XPath検索
• Cif Query検索
• SQL検索

その他関連情報

• 文献：
  PDBj Mine: Design and implementation of relational database interface for Protein Data Bank Japan.
  Kinjo AR, Yamashita R, Nakamura H.
  Database, 2010:baq021 (2010) PubMed:20798081 DOI:10.1093/database/BAQ021
• PDBj Mineの使い方を紹介した対話型チュートリアル
• PDBj Mine:ローカルインストール PDBj Mineの関係データベースをローカルにインストールする方法について