配列「TVSFSWNKFVPKQPNMILQGDAIVTSSGKLQLNKVDENGTPKPSSLGR」を含み、かつ由来生物種がダイズ（Glycine max）である構造のPDBID＋ChainID（auth_asym_id）を得る

• 検索サービス
• PDBj Mine
• SQL検索
• 配列「TVSFSWNKFVPKQPNMILQGDAIVTSSGKLQLNKVDENGTPKPSSLGR」を含み、かつ由来生物種がダイズ（Glycine max）である構造のPDBID＋ChainID（auth_asym_id）を得る

検索はこちら

SELECT b.pdbid, e.pdbx_strand_id FROM entity_poly e
LEFT JOIN brief_summary b ON e.pdbid=b.pdbid
WHERE e.pdbx_seq_one_letter_code LIKE '%TVSFSWNKFVPKQPNMILQGDAIVTSSGKLQLNKVDENGTPKPSSLGR%'
AND b.biol_species LIKE '%Glycine max%'

• 由来生物種情報は分子の採取方法によって情報を記載するカテゴリが異なるため、それらをまとめたbrief_summary.biol_speciesを使った方が検索SQL文が簡単になります。
• ChainIDが必要ないのであれば、エントリー内各分子の配列情報を結合したbrief_summary.aaseqを参照することもできます。

要素	内容
entity_src_nat	分子を由来生物種から直接採取した場合の由来生物種情報
entity_src_nat	由来生物種の遺伝子を他の宿主生物に導入し発現させてつくった場合の由来生物種や宿主生物種の情報
pdbx_entity_src_syn	由来生物種の遺伝子情報に基づき人工的に合成して分子を得た場合の由来生物種の情報
brief_summary.biol_species	エントリー内各分子の由来生物種名（学名、一般名）をつなげたもの
entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code	エントリー内各高分子のアミノ酸・核酸配列情報
brief_summary.aaseq	エントリー内各高分子のアミノ酸・核酸配列情報をつなげたもの