登録情報 | データベース: PDB / ID: 6a6j |
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タイトル | Crystal structure of Zebra fish Y-box protein1 (YB-1) Cold-shock domain in complex with 6mer m5C RNA |
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要素 | - RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*(5MC)P*U)-3')
- Zebra fish Y-box protein1 (YB-1)
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN/RNA / OB-fold / RNA BINDING PROTEIN-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
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生物種 | Danio rerio (ゼブラフィッシュ) Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2.255 Å |
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データ登録者 | Zhang, M.M. / Wu, B.X. / Huang, Y. / Ma, J.B. |
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引用 | ジャーナル: Mol.Cell / 年: 2019 タイトル: RNA 5-Methylcytosine Facilitates the Maternal-to-Zygotic Transition by Preventing Maternal mRNA Decay. 著者: Yang, Y. / Wang, L. / Han, X. / Yang, W.L. / Zhang, M. / Ma, H.L. / Sun, B.F. / Li, A. / Xia, J. / Chen, J. / Heng, J. / Wu, B. / Chen, Y.S. / Xu, J.W. / Yang, X. / Yao, H. / Sun, J. / Lyu, C. ...著者: Yang, Y. / Wang, L. / Han, X. / Yang, W.L. / Zhang, M. / Ma, H.L. / Sun, B.F. / Li, A. / Xia, J. / Chen, J. / Heng, J. / Wu, B. / Chen, Y.S. / Xu, J.W. / Yang, X. / Yao, H. / Sun, J. / Lyu, C. / Wang, H.L. / Huang, Y. / Sun, Y.P. / Zhao, Y.L. / Meng, A. / Ma, J. / Liu, F. / Yang, Y.G. |
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履歴 | 登録 | 2018年6月28日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2019年6月19日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年6月26日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: entity / entity_name_com ...entity / entity_name_com / entity_src_gen / struct_ref / struct_ref_seq Item: _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_fragment ..._entity.pdbx_description / _entity.pdbx_fragment / _entity_name_com.name / _entity_src_gen.gene_src_common_name / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name / _struct_ref.db_code / _struct_ref.pdbx_align_begin / _struct_ref.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession |
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改定 1.2 | 2019年8月14日 | Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: audit_author / citation / citation_author Item: _audit_author.name / _citation.country ..._audit_author.name / _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.4 | 2019年10月2日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.5 | 2024年3月27日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id |
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