PDB-5ept: Crystal Structure of S. cerevisiae TSA2 in the disulfide state

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ept

タイトル

Crystal Structure of S. cerevisiae TSA2 in the disulfide state

要素

Peroxiredoxin TSA2

キーワード

OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) /

Peroxiredoxin (ペルオキシレドキシン) /

Peroxidase (ペルオキシダーゼ) /

Oxidative Stress (酸化ストレス)

機能・相同性

機能・相同性情報

NFE2L2 regulating anti-oxidant/detoxification enzymes / TP53 Regulates Metabolic Genes / thioredoxin-dependent peroxiredoxin / thioredoxin peroxidase activity /

peroxiredoxin activity / cell redox homeostasis / hydrogen peroxide catabolic process /

フォールディング / cellular response to oxidative stress / response to oxidative stress ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 5 Å

データ登録者

Nielsen, M.H. / Kidmose, R.T. / Jenner, L.B.

引用

ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2016
タイトル: Structure of TSA2 reveals novel features of the active-site loop of peroxiredoxins.
著者: Nielsen, M.H. / Kidmose, R.T. / Jenner, L.B.

履歴

登録	2015年11月12日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2016年1月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年3月2日	Group: Database references
改定 1.2	2019年2月20日	Group: Advisory / Data collection / Derived calculations カテゴリ: pdbx_data_processing_status / pdbx_validate_close_contact ...pdbx_data_processing_status / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_conn_type
改定 1.3	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5ept.cif.gz	724.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5ept.ent.gz	608.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5ept.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ep/5ept ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ep/5ept	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5dvbSC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4fh8-d 5dvb-d 4l0u-d 3vwu-d 3tjb-1 1yex-1 4kw6-1 3tjj-1 6utl-d 3tjg-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

H: Peroxiredoxin TSA2

B: Peroxiredoxin TSA2

C: Peroxiredoxin TSA2

A: Peroxiredoxin TSA2

G: Peroxiredoxin TSA2

I: Peroxiredoxin TSA2

D: Peroxiredoxin TSA2

E: Peroxiredoxin TSA2

J: Peroxiredoxin TSA2

F: Peroxiredoxin TSA2

242 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	83.460, 167.210, 221.810
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Peroxiredoxin TSA2 / Cytoplasmic thiol peroxidase 2 / cTPx 2 / Thiol-specific antioxidant protein 2 / Thioredoxin peroxidase 2 分子量: 24212.541 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) 遺伝子: TSA2, YDR453C, D9461.38 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q04120, ペルオキシレドキシン

#1: タンパク質

Peroxiredoxin TSA2 / Cytoplasmic thiol peroxidase 2 / cTPx 2 / Thiol-specific antioxidant protein 2 / Thioredoxin peroxidase 2

分子量: 24212.541 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
遺伝子: TSA2, YDR453C, D9461.38 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q04120,

ペルオキシレドキシン

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.92 Å³/Da / 溶媒含有率: 68.62 %
結晶化	温度: 291.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5 / 詳細: 6% (w/v) PEG20K, 0.2 M MgCl2, 0.1M NaCitrate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ESRF

/ ビームライン: ID23-2 / 波長: 0.8729 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS3 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年4月16日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.8729 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 5→46.4 Å / Num. obs: 13476 / % possible obs: 50.6 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 20 % / B_iso Wilson estimate: 195.25 Å² / R_merge(I) obs: 0.129 / Net I/σ(I): 13.98 / Num. measured all: 13476

反射シェル

解像度 (Å)	Num. measured obs	Num. possible	Num. unique obs	Diffraction-ID	% possible all
5-5.2	39	1897	39	1	99.9
4.12-4.24	93	1897	93	1	4.9
4.24-4.36	159	1855	159	1	8.6
4.36-4.49	220	1765	220	1	12.5
4.49-4.64	301	1775	301	1	17
4.64-4.8	382	1647	382	1	23.2
4.8-4.98	488	1620	488	1	30.1
4.98-5.19	651	1584	651	1	41.1
5.19-5.42	846	1492	846	1	56.7
5.42-5.68	1005	1458	1005	1	68.9
5.68-5.99	1109	1370	1109	1	80.9
5.99-6.35	1222	1298	1222	1	94.1
6.35-6.79	1231	1231	1231	1	100
6.79-7.34	1154	1154	1154	1	100
7.34-8.04	1066	1066	1066	1	100
8.04-8.98	964	964	964	1	100
8.98-10.37	887	887	887	1	100
10.37-12.71	727	727	727	1	100
12.71-17.97	592	592	592	1	100
17.97-46.4	340	362	340	1	93.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX		精密化
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
XDS		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5DVB

5dvb

解像度: 5→46.351 Å / SU ML: 0.79 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 48.86 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.3748	1171	10.04 %
R_work	0.2737	10488	-
obs	0.284	11659	83.19 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 609.03 Å² / B_iso mean: 350.0008 Å² / B_iso min: 214.05 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 5→46.351 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13616	0	0	0	13616
残基数	-	-	-	-	1743

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	13924
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.129	18869
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.066	2128
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.008	2414
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.132	8498

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 8

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
5.0002-5.2275	0.4004	74	0.3226	664	738	43
5.2275-5.5027	0.4817	102	0.3087	915	1017	60
5.5027-5.8468	0.4303	129	0.338	1148	1277	74
5.8468-6.2972	0.4147	155	0.3601	1377	1532	89
6.2972-6.9291	0.4213	174	0.3343	1564	1738	100
6.9291-7.9274	0.4118	174	0.3346	1563	1737	99
7.9274-9.9713	0.3347	176	0.2578	1579	1755	100
9.9713-46.3529	0.3537	187	0.2269	1678	1865	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.1779	1.3119	-3.3097	1.4661	-0.0024	4.6113	-0.156	2.6491	-0.0727	-0.3915	0.4153	0.5661	-3.3058	-3.2844	0.7305	0.1905	-0.132	0.3847	6.3022	-0.5467	3.6072	49.3539	-39.3019	-20.519
2	2.1368	-2.7292	-0.955	9.0175	7.3386	6.8822	1.9777	-2.1178	-0.0132	4.3452	0.3472	1.9672	1.7574	1.5692	0.9954	-1.2105	-1.9492	2.0533	2.26	0.3749	2.8237	64.1102	-43.6059	-20.8484
3	8.1063	1.9665	-4.5913	2.2518	2.2913	9.2654	-0.2436	-2.3439	3.6764	-0.1734	0.2957	2.0461	0.1215	3.3368	-0.2262	4.0218	0.3188	0.2139	3.6763	0.1626	3.4734	70.7755	-49.1798	-25.8789
4	3.5798	-1.6926	-0.4259	4.9663	-1.5808	2.9805	-2.2094	-0.8923	-0.3658	0.8169	0.4841	-0.5491	-2.4663	-2.3429	0.8968	2.844	-0.3671	-0.3547	3.0561	0.4775	2.8891	57.8064	-33.3919	-17.5088
5	4.7878	-4.4653	-2.9727	4.7758	1.7866	5.3556	-1.4171	-2.3796	-3.5031	-1.2153	1.1332	1.9244	3.5946	3.3286	1.1524	4.7994	1.8438	-1.2925	4.3208	0.3638	3.8162	53.7809	-45.1393	-1.9889
6	5.0956	5.0649	1.3298	7.0233	1.0705	1.3827	-2.4688	2.7901	4.6654	1.5757	1.6587	-1.7802	2.4892	2.8408	1.2131	4.3446	2.1054	-0.4378	6.1018	-0.4002	2.8735	53.3952	-44.4022	7.6378
7	6.7211	1.3799	-4.5907	3.037	2.3723	6.2764	-0.8472	-3.291	-1.0147	3.4859	-1.875	-2.7226	0.3054	1.4056	1.3274	3.8058	0.0433	0.2225	2.536	0.4825	3.6387	12.6011	9.8574	-51.6475
8	8.9194	3.1227	-4.1044	7.7449	2.9083	6.5134	-0.2941	0.0136	0.1879	-1.0986	1.7974	2.2249	0.3288	-0.1672	0.3352	2.9477	0.4625	-1.3291	3.8543	0.6417	4.0845	12.6383	18.3544	-60.986
9	3.2353	-2.6177	4.1518	2.4737	-3.8472	6.0033	-4.0999	-10.5888	1.8209	7.0431	2.1897	0.6742	-8.7014	2.2249	1.274	7.5105	1.6126	-0.1359	6.1785	-0.4302	2.6602	6.9912	26.6503	-51.0196
10	1.6881	-2.7038	-2.6991	2.6533	-3.871	5.6334	-0.1263	1.3779	0.1685	-1.7264	0.0181	1.1567	-3.4225	1.7165	0.5675	3.3288	0.5162	-0.2613	3.5318	0.243	2.9116	18.6426	14.4364	-60.7216
11	3.5136	-0.6931	0.6904	9.0547	-5.4557	3.0484	1.7981	1.0244	0.6102	0.9673	-1.9185	-0.2385	-2.4996	1.417	0.3295	4.952	0.7349	-0.1839	3.7333	0.1052	2.9138	17.9103	35.661	-31.2702
12	1.1171	2.5758	-2.0365	7.9261	-7.8015	8.492	8.0426	7.9916	10.9267	-8.8878	1.6977	0.0976	7.4484	-8.4131	-9.4203	4.5409	1.4128	-0.302	5.9509	0.6545	5.1655	14.325	35.3121	-46.3583
13	2.0454	2.6817	-7.5937	0.5435	-1.1453	2.9601	-2.9189	6.554	0.6521	0.0806	0.47	-2.3601	-0.1809	-5.0492	0.56	10.2422	1.7346	0.2887	4.8403	-0.2368	1.7115	6.3103	40.8517	-43.0763
14	9.662	-2.5919	5.9389	4.4776	2.3629	9.8422	-1.3937	-0.079	2.3942	-3.5452	0.8375	2.8904	-5.2847	-0.6088	0.7816	4.3717	-0.2172	0.034	2.4645	0.5417	3.639	15.3577	31.5883	-24.4846
15	8.2262	-4.2358	0.5327	3.195	1.6552	2.4573	-2.3709	-1.3447	1.7001	2.6083	2.1545	0.5052	-0.1141	0.7726	0.4578	5.6887	-0.3127	-0.0466	2.2296	0.0473	3.2599	44.3262	10.8159	-63.3067
16	3.4039	4.316	-3.4813	6.2395	-4.7571	3.8948	-1.6568	1.6993	1.4155	-0.9099	0.0537	0.5023	6.5504	0.9856	2.0004	7.9524	1.1427	0.4775	3.6012	0.4353	3.3757	42.9401	9.7835	-74.1966
17	7.5202	-1.3823	1.9604	2.9682	0.2632	0.9394	-0.3924	-1.7557	0.0546	-2.2144	0.7129	2.1357	-2.1285	0.4259	-0.3997	4.9821	-0.0898	0.2484	3.7514	0.9111	3.2475	36.3138	12.7113	-66.5211
18	6.0849	2.8401	-4.1182	2.1326	-3.1449	5.3299	1.7564	1.3647	-0.1534	4.4544	1.5469	-2.2277	-1.3023	0.792	-0.5819	4.6751	-1.106	0.3718	3.0534	-0.0252	3.3584	61.2864	-15.3796	-3.4389
19	2.3294	-1.8249	-2.2069	2.3769	4.0649	4.2935	0.9645	-0.8985	0.4532	1.3189	-1.1131	-1.2607	-1.9924	1.1172	0.3843	2.5879	-0.3245	-0.8243	2.3389	0.2407	3.3187	61.796	-23.1288	9.9258
20	6.7349	-2.5179	4.7698	6.2769	-2.3037	3.4947	2.5411	4.5527	-3.4762	-2.6806	-3.0355	1.1467	4.3598	0.9053	0.7789	1.1147	-2.7319	-1.5974	0.5669	-0.7263	4.215	66.2845	-28.9069	-4.0306
21	1.9041	8.5229	7.5061	5.4541	4.1449	4.2752	1.6394	-4.4388	8.3725	1.0548	-1.327	5.8094	-3.8752	-0.3104	-1.3706	3.8031	0.2853	1.0371	1.6473	0.3242	6.0345	58.931	-10.3785	-42.7102
22	1.1945	1.5346	1.4362	4.5941	-0.2407	9.5732	-0.8793	-0.5585	-0.8306	-1.6179	0.1115	-0.5183	0.9345	0.3419	1.1168	2.7508	-0.1296	0.465	2.758	0.2787	3.0858	70.6976	-26.5954	-43.0087
23	7.8811	-5.8907	-1.756	5.1481	0.9641	3.2868	3.8716	1.0517	0.6821	0.0271	-4.082	-2.6139	1.6713	-1.6214	0.0737	5.2038	-0.6253	0.4407	2.9855	-0.3295	3.7399	67.5229	-19.5771	-60.1171
24	8.7584	-6.6328	-1.8165	9.7251	-3.7164	5.8536	1.6038	5.8827	-14.2884	4.2952	3.9701	2.4185	3.5847	1.6569	-1.6735	7.6206	-1.4304	-2.7868	4.5432	-0.0913	7.3483	12.0572	11.571	-21.3528
25	4.2925	-2.2572	-1.5484	5.9177	6.7223	8.8389	-1.0453	0.8137	1.8007	-0.5614	-0.3001	-0.4338	-0.3253	-2.2783	1.3166	3.5767	1.0855	-0.1404	3.4858	0.3231	3.0451	4.472	21.1237	-7.9058
26	9.4784	-0.5267	0.8168	6.2332	7.6588	8.9687	1.3257	1.2613	0.4001	-2.3461	-0.8139	-0.3657	-2.6172	0.495	-0.8329	4.2312	-0.4578	-0.3967	2.7185	-0.0907	3.0797	31.8303	15.7578	8.9603
27	5.6122	-4.2895	-0.9189	6.1871	-2.3894	5.4708	-1.7806	0.9918	-0.3256	1.2849	0.6693	0.4342	-0.1118	-1.6934	2.3711	6.0273	-0.0849	0.0399	2.7081	-0.3557	2.9232	24.5905	18.147	14.9065
28	5.8389	0.1808	-1.842	0.8568	2.5036	3.843	-3.8372	-1.1105	0.2723	-1.6338	1.6987	-1.0514	-1.9565	-1.404	1.837	5.5972	0.3746	0.6902	2.483	0.1195	2.6748	35.0895	5.3212	17.5097
29	2.0107	5.2019	2.5175	4.4103	-2.3183	8.2447	-2.9332	1.3302	3.0411	7.0107	0.7119	8.2777	-4.8135	2.3463	1.359	9.3157	-0.7974	-0.0477	3.9352	-0.0345	5.277	44.56	-20.6325	-47.1614
30	5.3311	-2.2506	-2.4288	5.4021	1.5871	3.3594	0.6631	-0.5623	1.0867	2.1217	0.0717	0.8424	-2.0748	0.2161	-0.1985	4.9618	0.6276	-0.0527	2.7436	-0.1693	2.4859	47.2851	-19.0142	-67.0397
31	3.4071	-2.2162	0.2421	1.1287	0.7194	4.9418	3.5905	3.9644	-2.8243	2.9945	-3.9204	-1.9025	-1.4876	-3.1954	-1.1704	4.2264	-0.1575	0.2518	4.4202	-1.3211	4.1845	56.9542	-31.7458	-59.6999
32	4.1167	6.4448	-4.2316	2.0034	-5.679	5.4375	-0.428	7.175	-7.8043	-5.3482	2.6018	0.399	4.3945	-2.4729	-1.2233	5.3209	-0.1954	-1.5313	4.4104	-0.962	3.4644	27.2332	-7.3076	1.0323
33	6.4641	-6.4414	3.5527	8.5327	-2.5093	0.6634	-0.9335	-1.0064	-0.5367	-1.2807	0.8454	-0.4379	-1.9038	0.118	-0.1896	3.701	0.0863	0.0609	3.2313	-0.3335	2.2579	33.6866	-13.7643	17.7967

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'H' and (resid -3 through 38 )	H
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'H' and (resid 39 through 84 )	H
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'H' and (resid 85 through 98 )	H
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'H' and (resid 99 through 148 )	H
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'H' and (resid 149 through 165 )	H
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'H' and (resid 166 through 174 )	H
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid -1 through 26 )	B
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 27 through 76 )	B
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 77 through 85 )	B
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 86 through 171 )	B
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid -3 through 76 )	C
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 77 through 85 )	C
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 86 through 98 )	C
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 99 through 168 )	C
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'A' and (resid -3 through 49 )	A
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'A' and (resid 50 through 85 )	A
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'A' and (resid 86 through 171 )	A
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'G' and (resid -3 through 20 )	G
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'G' and (resid 21 through 112 )	G
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'G' and (resid 113 through 171 )	G
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'I' and (resid -3 through 6 )	I
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'I' and (resid 7 through 134 )	I
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'I' and (resid 135 through 173 )	I
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid -3 through 6 )	D
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 7 through 166 )	D
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid -3 through 49 )	E
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 50 through 112 )	E
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 113 through 174 )	E
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'J' and (resid -3 through 6 )	J
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'J' and (resid 7 through 134 )	J
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'J' and (resid 135 through 171 )	J
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid -3 through 6 )	F
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 7 through 166 )	F

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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