登録情報 | データベース: PDB / ID: 3kbn |
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タイトル | Room temperature structure of D-Xylose Isomerase in complex with 2Ni(2+) co-factors and d12-D-glucose in the linear form |
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要素 | Xylose isomerase |
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キーワード | ISOMERASE / xylose isomerase / linear D-glucose / Carbohydrate metabolism / Metal-binding / Pentose shunt / Xylose metabolism |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
xylose isomerase / D-xylose metabolic process / xylose isomerase activity / magnesium ion binding / identical protein binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Xylose isomerase, actinobacteria / : / Xylose isomerase / Xylose isomerase family profile. / Divalent-metal-dependent TIM barrel enzymes / Xylose isomerase-like, TIM barrel domain / Xylose isomerase-like TIM barrel / Xylose isomerase-like superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 D-glucose / NICKEL (II) ION / Xylose isomerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptomyces rubiginosus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.53 Å |
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データ登録者 | Kovalevsky, A.Y. / Hanson, L. / Langan, P. |
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引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2010 タイトル: Metal ion roles and the movement of hydrogen during reaction catalyzed by D-xylose isomerase: a joint x-ray and neutron diffraction study. 著者: Kovalevsky, A.Y. / Hanson, L. / Fisher, S.Z. / Mustyakimov, M. / Mason, S.A. / Forsyth, V.T. / Blakeley, M.P. / Keen, D.A. / Wagner, T. / Carrell, H.L. / Katz, A.K. / Glusker, J.P. / Langan, P. |
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履歴 | 登録 | 2009年10月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年6月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2012年3月7日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2020年7月29日 | Group: Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _entity.pdbx_description ..._chem_comp.name / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 1.4 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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