登録情報 データベース : PDB / ID : 2v9w 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Complex structure of Sulfolobus solfataricus DPO4 and DNA duplex containing a hydrophobic thymine isostere 2,4-difluorotoluene nucleotide in the template strand 要素5'-D(*GP*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*GP*AP *CP*TP*G)-3'5'-D(*TP*TP*CP*AP*GP*DFTP*AP*GP*TP*CP*CP *TP*TP*CP*CP*CP*CP*C)-3'DNA POLYMERASE IV 詳細キーワード TRANSFERASE (転移酵素) / DNA-DIRECTED DNA POLYMERASE (DNAポリメラーゼ) / P2 DNA POLYMERASE IV / NUCLEOTIDYLTRANSFERASE / MUTATOR PROTEIN / DNA REPLICATION (DNA複製) / 4-DIFLUOROTOLUENE / DNA REPAIR (DNA修復) / DNA-BINDING / METAL-BINDING / TRANSLESION DNA POLYMERASE / DDCTP / CYTOPLASM (細胞質) / MAGNESIUM (マグネシウム) / DNA DAMAGE (DNA修復)機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
error-prone translesion synthesis / DNA-templated DNA replication / damaged DNA binding / DNAポリメラーゼ / DNA-directed DNA polymerase activity / magnesium ion binding / 細胞質 類似検索 - 分子機能 DNA polymerase type-Y, HhH motif / IMS family HHH motif / DNA polymerase IV / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I - #60 / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / impB/mucB/samB family C-terminal domain / UmuC domain / DNA polymerase, Y-family, little finger domain superfamily ... DNA polymerase type-Y, HhH motif / IMS family HHH motif / DNA polymerase IV / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I - #60 / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / impB/mucB/samB family C-terminal domain / UmuC domain / DNA polymerase, Y-family, little finger domain superfamily / impB/mucB/samB family / UmuC domain profile. / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Dna Ligase; domain 1 / 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain / DNA polymerase; domain 1 / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Alpha-Beta Plaits / DNA/RNA polymerase superfamily / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE / デオキシリボ核酸 / DNA (> 10) / DNA polymerase IV 類似検索 - 構成要素生物種 SULFOLOBUS SOLFATARICUS (古細菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 3 Å 詳細データ登録者 Irimia, A. / Pallan, P.S. / Egli, M. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2007タイトル : Structure and Activity of Y-Class DNA Polymerase Dpo4 from Sulfolobus Solfataricus with Templates Containing the Hydrophobic Thymine Analog 2,4-Difluorotoluene.著者 : Irimia, A. / Eoff, R.L. / Pallan, P.S. / Guengerich, F.P. / Egli, M. 履歴 登録 2007年8月27日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2007年10月30日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2023年12月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id
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