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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hgf | ||||||
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タイトル | HAIRPIN LOOP CONTAINING DOMAIN OF HEPATOCYTE GROWTH FACTOR, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||
要素 | HEPATOCYTE GROWTH FACTOR | ||||||
キーワード | HEPATOCYTE GROWTH FACTOR / SCATTER FACTOR / HAIRPIN LOOP / HEPARIN BINDING / PLASMINOGEN RELATED / NK1 | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 regulation of p38MAPK cascade / regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis by mesenchymal-epithelial signaling / Drug-mediated inhibition of MET activation / skeletal muscle cell proliferation / MET activates STAT3 / negative regulation of hydrogen peroxide-mediated programmed cell death / MET interacts with TNS proteins / MET Receptor Activation / hepatocyte growth factor receptor signaling pathway / MET receptor recycling ...regulation of p38MAPK cascade / regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis by mesenchymal-epithelial signaling / Drug-mediated inhibition of MET activation / skeletal muscle cell proliferation / MET activates STAT3 / negative regulation of hydrogen peroxide-mediated programmed cell death / MET interacts with TNS proteins / MET Receptor Activation / hepatocyte growth factor receptor signaling pathway / MET receptor recycling / MET activates PTPN11 / MET activates RAP1 and RAC1 / myoblast proliferation / MET activates PI3K/AKT signaling / MET activates PTK2 signaling / cellular response to hepatocyte growth factor stimulus / positive regulation of DNA biosynthetic process / chemoattractant activity / negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria / negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation / negative regulation of interleukin-6 production / positive regulation of interleukin-10 production / epithelial to mesenchymal transition / positive regulation of osteoblast differentiation / MET activates RAS signaling / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors / epithelial cell proliferation / Interleukin-7 signaling / negative regulation of autophagy / cell chemotaxis / platelet alpha granule lumen / liver development / negative regulation of inflammatory response / growth factor activity / cell morphogenesis / Negative regulation of MET activity / Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer / PIP3 activates AKT signaling / Platelet degranulation / mitotic cell cycle / PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling / RAF/MAP kinase cascade / Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling / positive regulation of MAPK cascade / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / positive regulation of cell migration / positive regulation of protein phosphorylation / signaling receptor binding / negative regulation of apoptotic process / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / extracellular space / extracellular region / identical protein binding / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE-GEOMETRY SIMULATED ANNEALING | ||||||
データ登録者 | Zhou, H. / Mazzulla, M.J. / Kaufman, J.D. / Stahl, S.J. / Wingfield, P.T. / Rubin, J.S. / Bottaro, D.P. / Byrd, R.A. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 1998 タイトル: The solution structure of the N-terminal domain of hepatocyte growth factor reveals a potential heparin-binding site. 著者: Zhou, H. / Mazzulla, M.J. / Kaufman, J.D. / Stahl, S.J. / Wingfield, P.T. / Rubin, J.S. / Bottaro, D.P. / Byrd, R.A. #1: ジャーナル: Biochem.J. / 年: 1997 タイトル: Functional and Biophysical Characterization of Recombinant Human Hepatocyte Growth Factor Isoforms Produced in Escherichia Coli 著者: Stahl, S.J. / Wingfield, P.T. / Kaufman, J.D. / Pannell, L.K. / Cioce, V. / Sakata, H. / Taylor, W.G. / Rubin, J.S. / Bottaro, D.P. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2hgf.cif.gz | 43.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2hgf.ent.gz | 33.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2hgf.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2hgf_validation.pdf.gz | 245 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2hgf_full_validation.pdf.gz | 244.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2hgf_validation.xml.gz | 5.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2hgf_validation.cif.gz | 7.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hg/2hgf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hg/2hgf | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11401.286 Da / 分子数: 1 / 断片: AMINO TERMINAL DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P14210 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: SEE REFERENCE. |
-試料調製
試料状態 | pH: 6.8 / 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE-GEOMETRY SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: RESTRAINED, MINIMIZED MEAN STRUCTURE 計算したコンフォーマーの数: 60 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |