登録情報 データベース : PDB / ID : 2ckw 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The 2.3 A resolution structure of the Sapporo virus RNA dependant RNA polymerase. 要素RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE RNA依存性RNAポリメラーゼ 詳細 キーワード HYDROLASE (加水分解酵素) / NUCLEOTIDE-BINDING / NUCLEOTIDYLTRANSFERASE / COVALENT PROTEIN-RNA LINKAGE (共有結合) / POLYMERASE (ポリメラーゼ) / RNA ELONGATION (転写 (生物学)) / TRANSFERASE ACTIVITY (転移酵素) / MUTANT (ミュータント (人類)) / CAPSID PROTEIN (カプシド) / RNA REPLICATION (RNA依存性RNAポリメラーゼ) / STRUCTURAL PROTEIN (タンパク質) / PROTEASE (プロテアーゼ) / HELICASE (ヘリカーゼ) / TRANSFERASE (転移酵素) / RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE (RNA依存性RNAポリメラーゼ) / POLYPROTEIN (タンパク質分解) / ATP-BINDING / THIOL PROTEASE (システインプロテアーゼ)機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
calicivirin / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / カプシド / nucleoside-triphosphate phosphatase / host cell cytoplasm / DNA複製 / RNA helicase activity / RNA依存性RNAポリメラーゼ / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity ... calicivirin / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / カプシド / nucleoside-triphosphate phosphatase / host cell cytoplasm / DNA複製 / RNA helicase activity / RNA依存性RNAポリメラーゼ / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / タンパク質分解 / RNA binding / ATP binding 類似検索 - 分子機能 : / Viral genome-linked protein / Caliciviridae (CV) 3C-like protein profile. / Peptidase C24, Calicivirus polyprotein Orf1 / 2C endopeptidase (C24) cysteine protease family / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3230 / Norovirus peptidase C37 / Southampton virus-type processing peptidase / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A - #20 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A ... : / Viral genome-linked protein / Caliciviridae (CV) 3C-like protein profile. / Peptidase C24, Calicivirus polyprotein Orf1 / 2C endopeptidase (C24) cysteine protease family / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3230 / Norovirus peptidase C37 / Southampton virus-type processing peptidase / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A - #20 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Calicivirus coat protein / Calicivirus coat protein / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Helicase, superfamily 3, single-stranded RNA virus / Superfamily 3 helicase of positive ssRNA viruses domain profile. / Helicase, superfamily 3, single-stranded DNA/RNA virus / ヘリカーゼ / Helix non-globular / Picornavirus/Calicivirus coat protein / Special / Viral coat protein subunit / RNA-directed RNA polymerase, C-terminal domain / Viral RNA-dependent RNA polymerase / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / RNA-directed RNA polymerase, catalytic domain / RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile. / Alpha-Beta Plaits / Peptidase S1, PA clan / DNA/RNA polymerase superfamily / Up-down Bundle / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / 2-Layer Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 SAPPORO VIRUS (サッポロウイルス)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.3 Å 詳細データ登録者 Fullerton, S.W.B. / Tucker, P.A. / Rohayem, J. / Coutard, B. / Gebhardt, J. / Gorbalenya, A. / Canard, B. 引用ジャーナル : J.Virol. / 年 : 2007タイトル : Structural and Functional Characterization of Sapovirus RNA-Dependent RNA Polymerase.著者 : Fullerton, S.W.B. / Blaschke, M. / Coutard, B. / Gebhardt, J. / Gorbalenya, A. / Canard, B. / Tucker, P.A. / Rohayem, J. 履歴 登録 2006年4月24日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2006年11月29日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2019年7月24日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_source / Item : _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site改定 1.4 2019年10月16日 Group : Data collection / Other / カテゴリ : pdbx_database_status / reflns_shellItem : _pdbx_database_status.status_code_sf / _reflns_shell.Rmerge_I_obs改定 1.5 2023年12月13日 Group : Data collection / Database references / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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