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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDGZ3 |
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![]() | Subgenomic flavivirus RNAs from Zika virus
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生物種 | ![]() ![]() |
![]() | ![]() タイトル: Long non‐coding subgenomic flavivirus RNAs have extended 3D structures and are flexible in solution 著者: Zhang Y / Zhang Y / Liu Z / Cheng M / Ma J / Wang Y / Qin C |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3584 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (2.8.3) / ダミー原子の半径: 6.75 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 0.333 / P-value: 0.129727 ![]() |
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モデル #3609 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 0.606 ![]() |
モデル #3610 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 0.606 ![]() |
モデル #3611 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 0.606 ![]() |
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試料
![]() | 名称: Subgenomic flavivirus RNAs from Zika virus / 試料濃度: 0.75-3.00 |
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バッファ | 名称: 20mM Tris-HCl, 100mM NaCl, 5mM MgCl2 / pH: 7.5 |
要素 #1836 | 名称: ZIKV-sfRNA / タイプ: RNA / 記述: Subgenomic flavivirus RNA from Zika virus / 分子量: 133.491 / 分子数: 1 / 由来: Zika virus 配列: UGUCAGGCCU GCUAGUCAGC CACAGCUUGG GGAAAGCUGU GCAGCCUGUG ACCCCCCCAG GAGAAGCUGG GAAACCAAGC CCAUAGUCAG GCCGAGAACG CCAUGGCACG GAAGAAGCCA UGCUGCCUGU GAGCCCCUCA GAGGACACUG AGUCAAAAAA CCCCACGCGC ...配列: UGUCAGGCCU GCUAGUCAGC CACAGCUUGG GGAAAGCUGU GCAGCCUGUG ACCCCCCCAG GAGAAGCUGG GAAACCAAGC CCAUAGUCAG GCCGAGAACG CCAUGGCACG GAAGAAGCCA UGCUGCCUGU GAGCCCCUCA GAGGACACUG AGUCAAAAAA CCCCACGCGC UUGGAGGCGC AGGAUGGGAA AAGAAGGUGG CGACCUUCCC CACCCUUUAA UCUGGGGCCU GAACUGGAGA UCAGCUGUGG AUCUCCAGAA GAGGGACUAG UGGUUAGAGG AGACCCCCCG GAAAACGCAA AACAGCAUAU UGACGCUGGG AAAGACCAGA GACUCCAUGA GUUUCCACCA CGCUGGCCGC CAGGCACAGA UCGCCGAAUA GCGGCGGCCG GUGUGGGGAA AUCCAUGGGU CU |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Photon Source (APS), Argonne National Laboratory 12ID-B SAXS/WAXS 地域: Lemont, IL / 国: USA ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン |
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: The subtracted SAXS data series used to generate the final extrapolated to zero-concentration profile displayed in this entry are provided in the full entry zip archive. The ab initio ...コメント: The subtracted SAXS data series used to generate the final extrapolated to zero-concentration profile displayed in this entry are provided in the full entry zip archive. The ab initio dummy atom model represents the averaged spatial disposition of the RNA in solution (DAMFILT model), derived from several aligned individual models (corresponding fit).
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