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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDDQ9 |
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試料 | N-terminal half of herpes simplex virus type-1 inner tegument protein UL37
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 microtubule-dependent intracellular transport of viral material towards cell periphery / protein-glutamine glutaminase activity / protein-glutamine glutaminase / symbiont-mediated suppression of cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway / viral tegument / 加水分解酵素; ペプチド以外のCN結合加水分解酵素; 鎖状アミドに作用 / virion assembly / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of RIG-I activity / host cell / host cell Golgi apparatus ...microtubule-dependent intracellular transport of viral material towards cell periphery / protein-glutamine glutaminase activity / protein-glutamine glutaminase / symbiont-mediated suppression of cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway / viral tegument / 加水分解酵素; ペプチド以外のCN結合加水分解酵素; 鎖状アミドに作用 / virion assembly / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of RIG-I activity / host cell / host cell Golgi apparatus / host cell cytoplasm / virus-mediated perturbation of host defense response / host cell nucleus / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Human herpesvirus 1 (strain 17) (ヘルペスウイルス) |
引用 | 日付: 2018 Aug 30 タイトル: The dynamic nature of the conserved tegument protein UL37 of herpesviruses. 著者: "Koenigsberg A", "Heldwein E" |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2175 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (5.0) / ダミー原子の半径: 2.75 A / 対称性: P1, none / カイ2乗値: 1.145 / P-value: 0.108692 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #2176 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 2.80 A / 対称性: P1, none / カイ2乗値: 1.145 / P-value: 0.108692 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: N-terminal half of herpes simplex virus type-1 inner tegument protein UL37 試料濃度: 6 mg/ml |
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バッファ | 名称: 100 mM HEPES 150 mM NaCl 5% glycerol 0.1 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP) pH: 7.5 |
要素 #1189 | 名称: HSV1 UL37 / タイプ: protein / 記述: Inner tegument protein / 分子量: 61.724 / 分子数: 1 / 由来: Human herpesvirus 1 (strain 17) / 参照: UniProt: P10221 配列: GPGSMADRGP PSEAPVVTTS PAGPPSDGPM QRLLASLAGL RQPPTPTAET ANGADDPAFL ATAKLRAAMA AFLLSGTAIA PADARDCWRP LLEHLCALHR AHGLPETALL AENLPGLLVH RLVVALPEAP DQAFREMEVI KDTILAVTGS DTSHALDSAG LRTAAALGPV ...配列: GPGSMADRGP PSEAPVVTTS PAGPPSDGPM QRLLASLAGL RQPPTPTAET ANGADDPAFL ATAKLRAAMA AFLLSGTAIA PADARDCWRP LLEHLCALHR AHGLPETALL AENLPGLLVH RLVVALPEAP DQAFREMEVI KDTILAVTGS DTSHALDSAG LRTAAALGPV RVRQCAVEWI DRWQTVTKSC LAMSPRTSIE ALGETSLKMA PVPLGQPSAN LTTPAYSLLF PAPFVQEGLR FLALVSNRVT LFSAHLQRID DATLTPLTRA LFTLALVDEY LTTPERGAVV PPPLLAQFQH TVREIDPAIM IPPLEANKMV RSREEVRVST ALSRVSPRSA CAPPGTLMAR VRTDVAVFDP DVPFLSSSAL AVFQPAVSSL LQLGEQPSAG AQQRLLALLQ QTWTLIQNTN SPSVVINTLI DAGFTPSHCT HYLSALEGFL AAGVPARTPT GHGLGEVQQL FGCIALAGSN VFGLAREYGY YANYVKTFRR VQGASEHTHG RLCEAVGLSG GVLSQTLARI MGPAVPTEHL ASLRRALVGE FETAERRFSS GQPSLLRETA LIWIDVYGQT HWDITPTTP |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Cornell High Energy Synchrotron Source (CHESS) G1 地域: Ithaca, NY / 国: USA / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.124662 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.53109 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 200K / タイプ: Pilatus / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: N-terminal half of herpes simplex virus type-1 inner tegument protein UL37 測定日: 2017年6月3日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 4 °C / 照射時間: 2 sec. / フレーム数: 300 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 480 /
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結果 | カーブのタイプ: sec コメント: Additional SEC parameters: Column type: Superdex 200 Increase 5/150 GE; Flow rate: 0.3 mL/min; Sample injection concentration: 6 mg/ml; Injection volume: 100 µl.
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