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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDCP7 |
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試料 | Truncated monomeric Cytohesin-3 (Grp1; amino acids 63-399) E161A 6GS Arf6 Q67L SUMO fusion protein
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生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) |
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2018 タイトル: Structural Dynamics Control Allosteric Activation of Cytohesin Family Arf GTPase Exchange Factors. 著者: Andrew W Malaby / Sanchaita Das / Srinivas Chakravarthy / Thomas C Irving / Osman Bilsel / David G Lambright / 要旨: Membrane dynamic processes including vesicle biogenesis depend on Arf guanosine triphosphatase (GTPase) activation by guanine nucleotide exchange factors (GEFs) containing a catalytic Sec7 domain and ...Membrane dynamic processes including vesicle biogenesis depend on Arf guanosine triphosphatase (GTPase) activation by guanine nucleotide exchange factors (GEFs) containing a catalytic Sec7 domain and a membrane-targeting module such as a pleckstrin homology (PH) domain. The catalytic output of cytohesin family Arf GEFs is controlled by autoinhibitory interactions that impede accessibility of the exchange site in the Sec7 domain. These restraints can be relieved through activator Arf-GTP binding to an allosteric site comprising the PH domain and proximal autoinhibitory elements (Sec7-PH linker and C-terminal helix). Small-angle X-ray scattering and negative-stain electron microscopy were used to investigate the structural organization and conformational dynamics of cytohesin-3 (Grp1) in autoinhibited and active states. The results support a model in which hinge dynamics in the autoinhibited state expose the activator site for Arf-GTP binding, while subsequent C-terminal helix unlatching and repositioning unleash conformational entropy in the Sec7-PH linker to drive exposure of the exchange site. |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1559 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (r2835) / ダミー原子の半径: 3.10 A / 対称性: P1 / コメント: Most representative of 100 dammif models / カイ2乗値: 1.565001 / P-value: 0.000114 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #1560 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 3.00 A / 対称性: P1 コメント: Filtered average of 10 filtered averages of 10 dammif models カイ2乗値: 1.565001 / P-value: 0.000114 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Truncated monomeric Cytohesin-3 (Grp1; amino acids 63-399) E161A 6GS Arf6 Q67L SUMO fusion protein 試料濃度: 2.6 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.1% 2-mercaptoethanol, 5% glycerol, 0.001 mM insitol 1,3,4,5-tetrakis phosphate pH: 8 |
要素 #797 | タイプ: protein / 記述: Grp1 63-399 E161A 6GS Arf6 Q67L SUMO fusion protein / 分子量: 72.469 / 分子数: 1 / 由来: Mus musculus 配列: MGHHHHHHGS TTQRNKQIAM GRKKFNMDPK KGIQFLIEND LLQSSPEDVA QFLYKGEGLN KTVIGDYLGE RDEFNIKVLQ AFVELHEFAD LNLVQALRQF LWSFRLPGEA QKIDRMMEAF ASRYCLCNPG VFQSTDTCYV LSFAIIMLNT SLHNHNVRDK PTAERFIAMN ...配列: MGHHHHHHGS TTQRNKQIAM GRKKFNMDPK KGIQFLIEND LLQSSPEDVA QFLYKGEGLN KTVIGDYLGE RDEFNIKVLQ AFVELHEFAD LNLVQALRQF LWSFRLPGEA QKIDRMMEAF ASRYCLCNPG VFQSTDTCYV LSFAIIMLNT SLHNHNVRDK PTAERFIAMN RGINEGGDLP EELLRNLYES IKNEPFKIPE DDGNDLTHTF FNPDREGWLL KLGGRVKTWK RRWFILTDNC LYYFEYTTDK EPRGIIPLEN LSIREVEDPR KPNCFELYNP SHKGQVIKAC KTEADGRVVE GNHVVYRISA PSPEEKEEWM KSIKASISRD PFYDMLATRK RRIANKKGSG SGSGSGSGSM GKVLSKIFGN KEMRILMLGL DAAGKTTILY KLKLGQSVTT IPTVGFNVET VTYKNVKFNV WDVGGQDKIR PLWRHYYTGT QGLIFVVDCA DRDRIDEARQ ELHRIINDRE MRDAIILIFA NKQDLPDAMK PHEIQEKLGL TRIRDRNWYV QPSCATSGDG LYEGLTWLTS NYKSGDSEVN QEAKPEVKPE VKPETHINLK VSDGSSEIFF KIKKTTPLRR LMEAFAKRQG KEMDSLRFLY DGIRIQADQT PEDLDMEDND IIEAHREQIG GS |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Photon Source (APS) BioCAT 18ID / 地域: Argonne, IL / 国: USA / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.10332 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.5 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: MAR 165 CCD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Truncated monomeric Cytohesin-3 (Grp1; amino acids 63-399) E161A 6GS Arf6 Q67L SUMO fusion protein 測定日: 2013年11月15日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 1 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 77 /
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結果 | カーブのタイプ: other /
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