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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDCD7 |
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試料 | Thermotoga maritima phosphodiesterase TM1595 (wildtype, TmPde)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
生物種 | Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099) (バクテリア) |
引用 | 日付: 2017 Oct タイトル: Structural and Biophysical Analysis of the Soluble DHH/DHHA1-Type Phosphodiesterase TM1595 from Thermotoga maritima 著者: Drexler D / Müller M / Rojas-Cordova C / Bandera A |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1503 | タイプ: atomic / ダミー原子の半径: 1.90 A / コメント: PDB not yet released / カイ2乗値: 2.316 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: Thermotoga maritima phosphodiesterase TM1595 (wildtype, TmPde) 試料濃度: 7 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20mM Tris, 200 mM NaCl, 5%(v/v) glycerol / pH: 7.5 |
要素 #774 | 名称: TmPde / タイプ: protein 記述: Thermotoga maritima phosphodiesterase (wildtype, TmPDE, TM1595) 分子量: 37.823 / 分子数: 2 由来: Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099) 参照: UniProt: Q9X1T1 配列: GSGSGMDEIV KVLSQHDRIL VVGHIMPDGD CVSSVLSLTL GLEKLGKEVK AAVDYKIPYV FEKFPYIDKI EENPNFDPEL LVVVDASSPD RIGKFQDLLD KVPSVVIDHH STNTNFGNWN WVDPSFAATA QMIFRINKAL GVEYDSNLAT LNYLGIATDT GFFRHSNADV ...配列: GSGSGMDEIV KVLSQHDRIL VVGHIMPDGD CVSSVLSLTL GLEKLGKEVK AAVDYKIPYV FEKFPYIDKI EENPNFDPEL LVVVDASSPD RIGKFQDLLD KVPSVVIDHH STNTNFGNWN WVDPSFAATA QMIFRINKAL GVEYDSNLAT LNYLGIATDT GFFRHSNADV RVFEDAYKLV KMGADAHFVA KEILENKRFE QFKLFAEVLE RLQLLENGKI AYSYIDYDTY LRHNCTDEDS AGFVGELRSI RGVEVAVLFM EFPRGKIHVS MRSKDWFNVN EVAFELGGGG HPRAAGVTFE GKKIEEVIPR VINHLLKKFK EGVESESEKI PEGDVLGG |
-実験情報
ビーム | 設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.123987 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 3 mm | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | |||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Thermotoga maritima phosphodiesterase TM1595 (wildtype, TmPde) 測定日: 2015年6月23日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 0.045 sec. / フレーム数: 34 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 1187 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc /
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