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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDC25 |
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試料 | RNase E 603-850/ATP-dependent RNA helicase (RhlB)/enolase ternary complex
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 : / phosphopyruvate hydratase / phosphopyruvate hydratase complex / phosphopyruvate hydratase activity / RNA catabolic process / glycolytic process / RNA helicase activity / RNA helicase / cell surface / magnesium ion binding ...: / phosphopyruvate hydratase / phosphopyruvate hydratase complex / phosphopyruvate hydratase activity / RNA catabolic process / glycolytic process / RNA helicase activity / RNA helicase / cell surface / magnesium ion binding / RNA binding / extracellular region / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
引用 | 日付: 2017 Nov 9 タイトル: Analysis of the natively unstructured RNA/protein-recognition core in the Escherichia coli RNA degradosome and its interactions with regulatory RNA/Hfq complexes 著者: Bruce H / Du D / Matak-Vinkovic D / Bandyra K / Broadhurst R / Martin E / Sobott F / Shkumatov A |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1314 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (2.3) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 コメント: Best fitting model out of 10 independent reconstructions カイ2乗値: 4.97 / P-value: 0.000001 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: RNase E 603-850/ATP-dependent RNA helicase (RhlB)/enolase ternary complex 試料濃度: 9.1 mg/ml / Entity id: 697 / 698 / 699 |
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バッファ | 名称: 50 mM Tris HCl, 100 mM NaCl, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 10 mM DTT and 5 % glycerol (v/v) pH: 7.5 |
要素 #697 | 名称: RNase E 603-850 / タイプ: protein / 記述: RNase E 603-850 / 分子量: 30.127 / 分子数: 1 / 由来: Escherichia coli / 参照: UniProt: Q46977 配列: ERQQDRRKPR QNNRRDRNER RDTRSERTEG SDNREENRRN RRQAQQQTAE TRESRQQAEV TEKARTADEQ QAPRRERSRR RNDDKRQAQQ EAKALNVEEQ SVQETEQEER VRPVQPRRKQ RQLNQKVRYE QSVAEEAVVA PVVEETVAAE PIVQEAPAPR TELVKVPLPV ...配列: ERQQDRRKPR QNNRRDRNER RDTRSERTEG SDNREENRRN RRQAQQQTAE TRESRQQAEV TEKARTADEQ QAPRRERSRR RNDDKRQAQQ EAKALNVEEQ SVQETEQEER VRPVQPRRKQ RQLNQKVRYE QSVAEEAVVA PVVEETVAAE PIVQEAPAPR TELVKVPLPV VAQTAPEQQE ENNADNRDNG GMPRRSRRSP RHLRVSGQRR RRYRDERYPT QSPMPLTVAC ASPELASGKV WIRYPIVRHH HHHH |
要素 #698 | 名称: RhlB / タイプ: protein / 記述: ATP-dependent RNA helicase RhlB / 分子量: 47.125 / 分子数: 1 / 由来: Escherichia coli / 参照: UniProt: W8ZZD4 配列: MSKTHLTEQK FSDFALHPKV VEALEKKGFH NCTPIQALAL PLTLAGRDVA GQAQTGTGKT MAFLTSTFHY LLSHPAIADR KVNQPRALIM APTRELAVQI HADAEPLAEA TGLKLGLAYG GDGYDKQLKV LESGVDILIG TTGRLIDYAK QNHINLGAIQ VVVLDEADRM ...配列: MSKTHLTEQK FSDFALHPKV VEALEKKGFH NCTPIQALAL PLTLAGRDVA GQAQTGTGKT MAFLTSTFHY LLSHPAIADR KVNQPRALIM APTRELAVQI HADAEPLAEA TGLKLGLAYG GDGYDKQLKV LESGVDILIG TTGRLIDYAK QNHINLGAIQ VVVLDEADRM YDLGFIKDIR WLFRRMPPAN QRLNMLFSAT LSYRVRELAF EQMNNAEYIE VEPEQKTGHR IKEELFYPSN EEKMRLLQTL IEEEWPDRAI IFANTKHRCE EIWGHLAADG HRVGLLTGDV AQKKRLRILD EFTRGDLDIL VATDVAARGL HIPAVTHVFN YDLPDDCEDY VHRIGRTGRA GASGHSISLA CEEYALNLPA IETYIGHSIP VSKYNPDALM TDLPKPLRLT RPRTGNGPRR TGAPRNRRRS G |
要素 #699 | 名称: Enolase / タイプ: protein / 記述: Enolase / 分子量: 45.654 / 分子数: 2 / 由来: Escherichia coli / 参照: UniProt: A1AEW7 配列: MSKIVKIIGR EIIDSRGNPT VEAEVHLEGG FVGMAAAPSG ASTGSREALE LRDGDKSRFL GKGVTKAVAA VNGPIAQALI GKDAKDQAGI DKIMIDLDGT ENKSKFGANA ILAVSLANAK AAAAAKGMPL YEHIAELNGT PGKYSMPVPM MNIINGGEHA DNNVDIQEFM ...配列: MSKIVKIIGR EIIDSRGNPT VEAEVHLEGG FVGMAAAPSG ASTGSREALE LRDGDKSRFL GKGVTKAVAA VNGPIAQALI GKDAKDQAGI DKIMIDLDGT ENKSKFGANA ILAVSLANAK AAAAAKGMPL YEHIAELNGT PGKYSMPVPM MNIINGGEHA DNNVDIQEFM IQPVGAKTVK EAIRMGSEVF HHLAKVLKAK GMNTAVGDEG GYAPNLGSNA EALAVIAEAV KAAGYELGKD ITLAMDCAAS EFYKDGKYVL AGEGNKAFTS EEFTHFLEEL TKQYPIVSIE DGLDESDWDG FAYQTKVLGD KIQLVGDDLF VTNTKILKEG IEKGIANSIL IKFNQIGSLT ETLAAIKMAK DAGYTAVISH RSGETEDATI ADLAVGTAAG QIKTGSMSRS DRVAKYNQLI RIEEALGEKA PYNGRKEIKG QA |
-実験情報
ビーム | 設備名称: SOLEIL SWING / 地域: Saint-Aubin / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.1022 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.79 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: AVIEX / タイプ: CCD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: RNase E 603-850/ATP-dependent RNA helicase (RhlB)/enolase ternary complex 測定日: 2014年7月16日 / 保管温度: 15 °C / セル温度: 15 °C / 照射時間: 1.5 sec. / フレーム数: 250 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 873 /
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結果 | カーブのタイプ: other /
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