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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8k8x | ||||||
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タイトル | CryoEM of LonC open pentamer, apo state | ||||||
![]() | endopeptidase La | ||||||
![]() | CHAPERONE / Lon proteases / open pentamer | ||||||
機能・相同性 | ![]() endopeptidase La / ATP-dependent peptidase activity / protein catabolic process / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / ATP binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.53 Å | ||||||
![]() | Li, M. / Hsieh, K. / Liu, H. / Zhang, S. / Gao, Y. / Gong, Q. / Zhang, K. / Chang, C. / Li, S. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Bifurcated assembly pathway and dual function of a Lon-like protease revealed by cryo-EM Analysis 著者: Li, M. / Liu, H. / Hsieh, K.Y. / Zhang, S. / Gao, Y. / Gong, Q. / Zhang, K. / Chang, C.I. / Li, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 594.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 499.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.5 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.5 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 99.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 149.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 36967MC ![]() 8k8vC ![]() 8k8wC ![]() 8k8yC ![]() 8k8zC ![]() 8k90C ![]() 8k91C ![]() 8k92C ![]() 8k93C ![]() 8k94C ![]() 8k95C ![]() 8k96C ![]() 8k97C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 80558.352 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: lon_2 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: CryoEM structure of LonC protease hepatmer, apo state タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 値: 0.40 MDa / 実験値: YES |
由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 濃度: 1 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2700 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1300 nm |
撮影 | 電子線照射量: 60 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: NONE | ||||||||||||||||||||||||
粒子像の選択 | 選択した粒子像数: 920069 | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.53 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 52058 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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