PDB-7w2f: An open-like conformation of the sigma-1 receptor from Xenopus la...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7w2f

タイトル

An open-like conformation of the sigma-1 receptor from Xenopus laevis complexed with PRE084 by co-crystallization

要素

Sigma non-opioid intracellular receptor 1

キーワード

MEMBRANE PROTEIN / sigma receptor / membrane receptor / S1R / ligand entry

機能・相同性

機能・相同性情報

ergosterol biosynthetic process / nuclear outer membrane / lipid transport / nuclear inner membrane / cytoplasmic vesicle / endoplasmic reticulum membrane / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Xenopus laevis (アフリカツメガエル)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.1 Å

データ登録者

Meng, F. / Sun, Z. / Zhou, X.

資金援助

中国, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: An open-like conformation of the sigma-1 receptor reveals its ligand entry pathway.
著者: Meng, F. / Xiao, Y. / Ji, Y. / Sun, Z. / Zhou, X.

履歴

登録	2021年11月23日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2022年3月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2022年3月23日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.2	2023年11月29日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7w2f.cif.gz	1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7w2f.ent.gz	877.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7w2f.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7w2f_validation.pdf.gz	4.5 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7w2f_full_validation.pdf.gz	4.6 MB	表示
XML形式データ	7w2f_validation.xml.gz	94.6 KB	表示
CIF形式データ	7w2f_validation.cif.gz	119.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w2/7w2f ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w2/7w2f	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7w2bC 7w2cC 7w2dC 7w2eC 7w2gC 7w2hC 5hk1S S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	7w2g-1 7w2g-2 7w2f-2 7w2f-4 7w2h-4 7w2g-3 7w2h-7 7w2h-1 7w2h-2 7w2h-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

B: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

C: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

D: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

E: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

F: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

G: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

H: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

I: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

J: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

K: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

L: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

ヘテロ分子

307 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

B: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

C: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
76.6 kDa, 3 ポリマー
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2

D: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

E: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

F: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
76.6 kDa, 3 ポリマー
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3

G: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

H: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

I: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
76.9 kDa, 3 ポリマー
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4

J: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

K: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

L: Sigma non-opioid intracellular receptor 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
77.2 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	135.345, 161.041, 202.210
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質

Sigma non-opioid intracellular receptor 1 / Sigma 1-type opioid receptor / Sigma1-receptor / Sigma1R

分子量: 25121.682 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Xenopus laevis (アフリカツメガエル)
遺伝子: sigmar1, oprs1 / 発現宿主:

Komagataella pastoris (菌類) / 参照: UniProt: Q6DCU6

#2: 化合物

ChemComp-E84 / 2-morpholin-4-ylethyl 1-phenylcyclohexane-1-carboxylate / PRE-084 / PRE-084

分子量: 317.423 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₉H₂₇NO₃ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: 抗うつ薬, アゴニスト*YM

#3: 糖

ChemComp-BOG / octyl beta-D-glucopyranoside / Beta-Octylglucoside / octyl beta-D-glucoside / octyl D-glucoside / octyl glucoside / オクチルβ-D-グルコピラノシド

タイプ: D-saccharide / 分子量: 292.369 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₄H₂₈O₆ / コメント: 可溶化剤*YM

#4: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 155 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

研究の焦点であるリガンドがあるか

Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.66 Å³/Da / 溶媒含有率: 66.35 %
結晶化	温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: 0.1M Na+-HEPES pH 6.5, 28% PEG 300, 0.4mM PRE084

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRF

/ ビームライン: BL18U1 / 波長: 0.97915 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年9月19日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97915 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 3.1→47.357 Å / Num. obs: 80396 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 5.2 % / B_iso Wilson estimate: 73.66 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.135 / R_pim(I) all: 0.065 / R_rim(I) all: 0.151 / Net I/σ(I): 8.1 / Num. measured all: 418467

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. measured all	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Net I/σ(I) obs	% possible all
3.1-3.153	5.4	0.931	21462	3993	0.794	0.441	1.033	1.6	99.8
8.399-47.357	4.7	0.041	19771	4207	0.999	0.021	0.046	22.6	97.9

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XDS	BUILT 20210323	データ削減
Aimless	0.7.4	データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX	1.13_2998	精密化
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5HK1

5hk1

解像度: 3.1→47.357 Å / SU ML: 0.41 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 35.62 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2878	3922	4.9 %
R_work	0.2558	76197	-
obs	0.2574	80119	99.2 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 244.96 Å² / B_iso mean: 80.5425 Å² / B_iso min: 24 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 3.1→47.357 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	20333	0	416	155	20904
B_iso mean	-	-	95.84	58.11	-
残基数	-	-	-	-	2583

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
3.1-3.1374	0.3612	138	0.3251	2713	100
3.1374-3.1771	0.3527	130	0.3145	2694	100
3.1771-3.2189	0.3324	139	0.3017	2727	100
3.2189-3.263	0.3214	140	0.2984	2669	100
3.263-3.3096	0.3482	134	0.299	2743	100
3.3096-3.359	0.3956	161	0.3024	2682	100
3.359-3.4114	0.3509	142	0.3	2677	100
3.4114-3.4674	0.3246	128	0.2999	2700	99
3.4674-3.5271	0.3192	143	0.2774	2683	100
3.5271-3.5912	0.3179	140	0.2682	2734	100
3.5912-3.6603	0.2927	146	0.2516	2709	100
3.6603-3.735	0.2507	137	0.2433	2712	100
3.735-3.8162	0.2583	153	0.2472	2692	100
3.8162-3.9049	0.2582	141	0.2483	2705	100
3.9049-4.0025	0.2759	129	0.2448	2731	100
4.0025-4.1107	0.2491	144	0.2337	2733	99
4.1107-4.2315	0.2973	127	0.2281	2720	100
4.2315-4.368	0.2493	144	0.2246	2729	100
4.368-4.524	0.2146	156	0.2133	2650	98
4.524-4.705	0.2465	147	0.2261	2737	99
4.705-4.9189	0.2525	147	0.2146	2724	100
4.9189-5.178	0.2396	128	0.2262	2765	100
5.178-5.5019	0.2999	134	0.2487	2744	100
5.5019-5.926	0.3192	130	0.28	2771	100
5.926-6.521	0.3249	137	0.2841	2760	99
6.521-7.4614	0.2688	148	0.2582	2743	98
7.4614-9.3886	0.2399	136	0.232	2821	99
9.3886-47.357	0.3581	143	0.2894	2729	92

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.5775	0.4771	1.3703	2.5011	-2.1693	2.7347	-0.2476	0.6789	-1.0036	-0.5622	-0.5756	0.2671	0.7947	0.9123	0.6662	0.8081	-0.7705	0.4305	0.9441	0.1139	1.08	54.2919	-47.5707	-55.5257
2	1.2553	-0.7477	-0.1828	3.871	-0.4998	3.8549	0.4417	0.3223	-0.5546	-0.3395	0.14	0.6244	0.5212	-0.3829	-0.5385	0.7795	-0.06	-0.3472	0.7424	0.0065	0.7756	62.2491	-41.5305	-88.8881
3	1.4344	0.7238	0.6466	2.4871	0.4867	1.661	0.014	-0.0256	-0.0498	-0.0079	0.1241	0.372	0.3735	-0.0869	-0.1608	0.4704	-0.0226	-0.0778	0.5497	0.0127	0.624	68.2642	-34.7094	-76.7953
4	1.1048	0.441	-1.6112	4.4083	-0.1473	3.9028	-0.5709	0.7089	-0.1962	-0.2758	-0.1674	0.3737	1.0646	-0.8622	0.3828	0.4324	-0.0624	-0.1406	0.8788	-0.0893	0.964	48.6734	-36.7823	-82.1305
5	5.8909	2.8006	-0.0736	1.6641	0.8356	2.5339	0.3637	1.2693	1.6436	-0.2684	0.4473	0.8206	-1.2759	0.2674	-0.4771	0.2028	0.2342	-0.2798	0.8312	0.2371	1.7871	37.4576	-8.5224	-80.6145
6	5.5527	-1.9331	-3.0232	3.322	1.6619	6.782	0.2862	0.2857	-0.4826	-1.0097	0.0743	1.4941	-0.4847	-0.591	-0.3308	0.6769	-0.0576	-0.2437	0.6237	0.2581	1.0514	66.3831	4.4372	-89.9324
7	4.1607	2.1408	0.2588	2.6111	-1.2579	4.5511	-0.1482	0.28	0.8953	0.1754	-0.0773	0.0119	-0.9169	-0.2631	0.2441	0.6666	0.098	-0.2326	0.6224	0.1006	0.9492	69.3016	3.7529	-77.9221
8	2.2441	1.829	-0.4057	3.247	0.9579	3.1495	-0.0855	0.9254	0.5116	-0.6069	-0.0417	0.6308	0.022	-0.4182	0.1279	0.5952	-0.0038	-0.2133	0.6997	0.0902	0.7318	67.9951	-12.4964	-86.8101
9	2.8742	-1.8639	-3.7081	6.3166	1.569	4.9188	0.3699	2.3522	0.759	-0.3159	-0.7526	0.6648	0.0655	0.3878	0.5529	0.5733	0.0865	-0.2056	0.7592	0.1128	0.7944	67.2427	-13.5604	-84.3298
10	1.0925	1.1936	-0.9497	1.556	-1.9188	3.1256	0.1223	0.2819	0.4407	-0.1099	0.2971	0.7786	-0.2589	0.0308	-0.4762	0.5084	0.0451	0.0096	0.5712	0.1165	0.7834	62.874	-7.4783	-74.4245
11	1.5508	-0.2282	-0.7365	3.2928	1.1038	0.6496	0.0843	0.0524	1.0195	-0.5617	0.0754	0.0193	-0.0209	-1.6421	-0.1076	0.4731	0.249	0.1495	0.8638	-0.1088	0.8287	59.8154	7.021	-69.9348
12	6.6012	0.093	-1.1506	2.6353	-0.8588	0.4338	0.7755	0.6024	-1.1782	-1.1867	-0.8926	-0.531	0.2703	-1.189	-0.0286	1.1573	0.502	-0.285	0.8417	0.0905	0.5751	15.745	-48.4492	-51.194
13	3.6915	1.1095	0.292	3.4559	-4.4077	6.7146	-0.639	0.1793	0.0525	0.1334	0.0895	-0.0402	-0.1741	-1.2754	0.4707	0.6474	0.1413	-0.0743	0.6605	-0.2154	0.9149	31.443	-76.2242	-42.4835
14	5.7624	-2.7075	3.8755	5.6298	-1.782	9.5839	0.3315	0.2419	-0.845	-0.1558	0.6556	-0.4512	-0.0416	0.8878	-0.7542	0.534	-0.005	0.1243	0.5694	-0.0397	0.6892	42.5668	-78.0077	-40.5677
15	3.5094	-0.3353	-0.6781	4.155	1.3165	5.3474	0.1172	0.3885	0.1355	0.0644	-0.005	0.1925	-0.1215	0.0342	-0.1692	0.5503	0.0294	0.0406	0.5078	-0.0419	0.5171	32.331	-66.4863	-33.3783
16	0.5378	-0.7467	-0.2544	2.4716	0.0686	0.196	0.0724	-0.0397	-0.24	-0.4809	0.1908	-0.7792	0.4299	0.1048	-0.206	0.7106	0.0483	0.0806	0.4742	0.0995	0.4683	35.867	-51.6881	-33.2913
17	2.5569	-0.4458	0.3535	6.0148	0.5774	7.2222	-0.3667	0.6903	0.1665	-2.3738	-0.2098	0.1385	-0.7894	0.1083	0.4831	1.0312	-0.1497	0.1668	0.6168	0.0827	0.7079	42.7962	-59.2632	-48.1319
18	5.4632	0.2507	-2.0672	1.9219	1.565	4.1806	0.202	-1.6353	-0.8704	1.2186	0.1022	-0.1085	0.6982	1.0741	-0.6268	0.6719	-0.8726	-0.2107	0.9096	-0.0895	0.9466	62.8585	-39.6433	-35.9949
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62	0.9813	-0.1296	0.2025	3.3906	0.3864	1.9769	-0.0697	0.1407	-0.3027	-0.3981	0.116	-0.8152	-0.1	0.5113	-0.0425	0.4159	0.0092	0.116	0.6141	-0.1096	0.6333	1.4634	-26.9972	-82.6209
63	4.6836	-4.3626	-0.4669	8.7364	0.8528	3.9957	0.8274	0.3841	-0.9476	-0.4935	-0.5016	-0.8351	-0.0714	0.8417	-0.2059	0.4241	0.0283	-0.0869	0.6993	-0.0446	0.9809	7.9977	-44.949	-70.1037
64	0.2802	0.4022	-0.5929	4.2969	1.4808	2.6141	-0.2148	-0.651	-0.149	0.7235	0.3496	-1.0232	-0.1219	0.2859	-0.4488	0.8293	0.2534	0.1517	1.3567	-0.3236	0.0468	66.5937	-3.3091	-41.1384
65	5.6054	0.3258	1.8711	4.5048	1.1473	5.8362	-0.2415	-0.4122	0.0906	0.6707	0.2888	0.2384	0.1338	0.4245	-0.0929	0.469	0.0859	0.0337	0.4646	0.0197	0.384	90.0126	-25.9331	-52.7692
66	2.9165	-0.6025	1.9874	2.4593	0.2844	2.0601	-0.0611	-0.082	0.3544	-0.001	0.1608	0.0092	-0.0441	-0.2057	-0.1057	0.4237	-0.0184	0.0457	0.5604	-0.0125	0.4167	80.5655	-17.5276	-61.2627
67	0.8174	-0.0208	0.1159	1.569	0.1739	5.6599	-0.3119	-0.2599	0.139	0.1167	-0.0953	0.1149	0.3868	0.3112	0.5448	0.4503	-0.1677	0.123	0.7933	0.1535	0.5676	76.4779	-29.6222	-45.0136

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'K' and (resid 5 through 28 )	K	5 - 28
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'K' and (resid 29 through 85 )	K	29 - 85
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'K' and (resid 86 through 192 )	K	86 - 192
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'K' and (resid 193 through 218 )	K	193 - 218
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'L' and (resid 5 through 28 )	L	5 - 28
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'L' and (resid 29 through 50 )	L	29 - 50
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'L' and (resid 51 through 106 )	L	51 - 106
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'L' and (resid 107 through 151 )	L	107 - 151
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'L' and (resid 152 through 164 )	L	152 - 164
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'L' and (resid 165 through 192 )	L	165 - 192
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'L' and (resid 193 through 219 )	L	193 - 219
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'A' and (resid 5 through 28 )	A	5 - 28
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'A' and (resid 29 through 50 )	A	29 - 50
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'A' and (resid 51 through 65 )	A	51 - 65
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'A' and (resid 66 through 174 )	A	66 - 174
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'A' and (resid 175 through 192 )	A	175 - 192
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'A' and (resid 193 through 219 )	A	193 - 219
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 5 through 29 )	B	5 - 29
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'B' and (resid 30 through 106 )	B	30 - 106
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'B' and (resid 107 through 134 )	B	107 - 134
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'B' and (resid 135 through 144 )	B	135 - 144
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'B' and (resid 145 through 174 )	B	145 - 174
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'B' and (resid 175 through 192 )	B	175 - 192
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'B' and (resid 193 through 219 )	B	193 - 219
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 4 through 29 )	C	4 - 29
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 30 through 50 )	C	30 - 50
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 51 through 106 )	C	51 - 106
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'C' and (resid 107 through 151 )	C	107 - 151
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'C' and (resid 152 through 164 )	C	152 - 164
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'C' and (resid 165 through 192 )	C	165 - 192
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'C' and (resid 193 through 219 )	C	193 - 219
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 5 through 29 )	D	5 - 29
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 30 through 106 )	D	30 - 106
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 107 through 127 )	D	107 - 127
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'D' and (resid 128 through 151 )	D	128 - 151
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'D' and (resid 152 through 192 )	D	152 - 192
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'D' and (resid 193 through 219 )	D	193 - 219
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'E' and (resid 5 through 28 )	E	5 - 28
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'E' and (resid 29 through 106 )	E	29 - 106
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'E' and (resid 107 through 144 )	E	107 - 144
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'E' and (resid 145 through 174 )	E	145 - 174
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'E' and (resid 175 through 219 )	E	175 - 219
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'F' and (resid 5 through 29 )	F	5 - 29
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'F' and (resid 30 through 50 )	F	30 - 50
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'F' and (resid 51 through 106 )	F	51 - 106
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'F' and (resid 107 through 140 )	F	107 - 140
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'F' and (resid 141 through 157 )	F	141 - 157
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'F' and (resid 158 through 219 )	F	158 - 219
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'G' and (resid 1 through 28 )	G	1 - 28
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'G' and (resid 29 through 65 )	G	29 - 65
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'G' and (resid 66 through 77 )	G	66 - 77
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'G' and (resid 78 through 134 )	G	78 - 134
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'G' and (resid 135 through 156 )	G	135 - 156
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'G' and (resid 157 through 192 )	G	157 - 192
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'G' and (resid 193 through 219 )	G	193 - 219
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'H' and (resid 5 through 29 )	H	5 - 29
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'H' and (resid 30 through 85 )	H	30 - 85
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'H' and (resid 86 through 192 )	H	86 - 192
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'H' and (resid 193 through 218 )	H	193 - 218
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'I' and (resid 5 through 28 )	I	5 - 28
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'I' and (resid 29 through 106 )	I	29 - 106
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'I' and (resid 107 through 192 )	I	107 - 192
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'I' and (resid 193 through 219 )	I	193 - 219
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resid 5 through 29 )	J	5 - 29
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'J' and (resid 30 through 85 )	J	30 - 85
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'J' and (resid 86 through 192 )	J	86 - 192
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'J' and (resid 193 through 219 )	J	193 - 219

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

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