登録情報 データベース : PDB / ID : 7v1w 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Difructose dianhydride I synthase/hydrolase (alphaFFase1) from Bifidobacterium dentium in complex with beta-D-arabinofuranose 要素Difructose dianhydride I synthase/hydrolase (alphaFFase1) 詳細 キーワード HYDROLASE / Glycoside Hydrolase / alpha-D-fructofuranosidase / beta-D-arabinofuranose complex機能・相同性 Protein of unknown function DUF2961 / Protein of unknown function (DUF2961) / metal ion binding / beta-D-arabinofuranose / DUF2961 domain-containing protein 機能・相同性情報生物種 Bifidobacterium dentium (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.86 Å 詳細データ登録者 Kashima, T. / Arakawa, T. / Yamada, C. / Fujita, K. / Fushinobu, S. 資金援助 日本, 2件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) 26660083 日本 Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) 24380053 日本
引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2021タイトル : Identification of difructose dianhydride I synthase/hydrolase from an oral bacterium establishes a novel glycoside hydrolase family.著者 : Kashima, T. / Okumura, K. / Ishiwata, A. / Kaieda, M. / Terada, T. / Arakawa, T. / Yamada, C. / Shimizu, K. / Tanaka, K. / Kitaoka, M. / Ito, Y. / Fujita, K. / Fushinobu, S. 履歴 登録 2021年8月6日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2021年11月3日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 2.0 2022年1月12日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ : atom_site / entity ... atom_site / entity / pdbx_contact_author / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_peptide_omega / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_torsion / refine / refine_hist / refine_ls_restr / refine_ls_shell / struct_conf / struct_conn / struct_mon_prot_cis Item : _entity.pdbx_number_of_molecules / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id ... _entity.pdbx_number_of_molecules / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.dist / _refine.B_iso_max / _refine.B_iso_mean / _refine.B_iso_min / _refine.aniso_B[1][1] / _refine.aniso_B[1][3] / _refine.aniso_B[2][2] / _refine.aniso_B[3][3] / _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc / _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free / _refine.ls_R_factor_R_free / _refine.ls_R_factor_R_work / _refine.ls_R_factor_obs / _refine.ls_number_reflns_R_free / _refine.ls_number_reflns_obs / _refine.overall_SU_B / _refine.overall_SU_ML / _refine.pdbx_overall_ESU_R / _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free / _refine_hist.number_atoms_solvent / _refine_hist.number_atoms_total / _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand / _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand / _refine_ls_restr.dev_ideal / _refine_ls_restr.dev_ideal_target / _refine_ls_restr.number / _refine_ls_shell.R_factor_R_free / _refine_ls_shell.R_factor_R_work / _refine_ls_shell.number_reflns_R_free / _refine_ls_shell.number_reflns_R_work / _refine_ls_shell.number_reflns_all / _refine_ls_shell.percent_reflns_obs / _struct_conf.end_auth_comp_id / _struct_conf.end_auth_seq_id / _struct_conf.end_label_comp_id / _struct_conf.end_label_seq_id / _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 解説 : Atoms with unrealistic or zero occupancies / Provider : author / タイプ : Coordinate replacement改定 2.1 2022年2月16日 Group : Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first ... _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID 改定 2.2 2023年11月29日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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