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Yorodumi- PDB-7nit: X-ray structure of a multidomain BbgIII from Bifidobacterium bifidum -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7nit | ||||||
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Title | X-ray structure of a multidomain BbgIII from Bifidobacterium bifidum | ||||||
Components | Beta-galactosidase | ||||||
Keywords | HYDROLASE / Bifidobacterium bifidum / lactose hydrolysis / galactooligosaccharides / transgalactosylation | ||||||
Function / homology | Function and homology information hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds / membrane => GO:0016020 / carbohydrate metabolic process Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Bifidobacterium bifidum (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.89 Å | ||||||
Authors | Moroz, O.V. / Blagova, E. / Lebedev, A.A. / Sanchez Rodriguez, F. / Rigden, D.J. / Tams, J.W. / Wilting, R. / Vester, J.K. / Longhin, E. / Krogh, K.B.R. ...Moroz, O.V. / Blagova, E. / Lebedev, A.A. / Sanchez Rodriguez, F. / Rigden, D.J. / Tams, J.W. / Wilting, R. / Vester, J.K. / Longhin, E. / Krogh, K.B.R. / Pache, R.A. / Davies, G.J. / Wilson, K.S. | ||||||
Citation | Journal: Acta Crystallogr D Struct Biol / Year: 2021 Title: Multitasking in the gut: the X-ray structure of the multidomain BbgIII from Bifidobacterium bifidum offers possible explanations for its alternative functions. Authors: Moroz, O.V. / Blagova, E. / Lebedev, A.A. / Sanchez Rodriguez, F. / Rigden, D.J. / Tams, J.W. / Wilting, R. / Vester, J.K. / Longhin, E. / Hansen, G.H. / Krogh, K.B.R.M. / Pache, R.A. / ...Authors: Moroz, O.V. / Blagova, E. / Lebedev, A.A. / Sanchez Rodriguez, F. / Rigden, D.J. / Tams, J.W. / Wilting, R. / Vester, J.K. / Longhin, E. / Hansen, G.H. / Krogh, K.B.R.M. / Pache, R.A. / Davies, G.J. / Wilson, K.S. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7nit.cif.gz | 1.4 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb7nit.ent.gz | 1.1 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7nit.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/7nit ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/7nit | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 1gofS 2w1sS 2wdcS 3f2zS 4lplS 5dmyS S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
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