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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7jts | ||||||
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タイトル | Stalk of radial spoke 1 attached with doublet microtubule from Chlamydomonas reinhardtii | ||||||
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![]() | STRUCTURAL PROTEIN / cilia / native / complex / microtubule / mechanoregulation | ||||||
機能・相同性 | ![]() radial spoke / positive regulation of cilium-dependent cell motility / motile cilium assembly / dynein complex / cytoplasmic dynein complex / ciliary plasm / motile cilium / dynein intermediate chain binding / axoneme / microtubule-based process ...radial spoke / positive regulation of cilium-dependent cell motility / motile cilium assembly / dynein complex / cytoplasmic dynein complex / ciliary plasm / motile cilium / dynein intermediate chain binding / axoneme / microtubule-based process / cilium assembly / enzyme regulator activity / acrosomal vesicle / calcium-mediated signaling / cilium / microtubule / cytoskeleton / calcium ion binding / membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 6.1 Å | ||||||
![]() | Gui, M. / Ma, M. / Sze-Tu, E. / Wang, X. / Koh, F. / Zhong, E. / Berger, B. / Davis, J. / Dutcher, S. / Zhang, R. / Brown, A. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structures of radial spokes and associated complexes important for ciliary motility. 著者: Miao Gui / Meisheng Ma / Erica Sze-Tu / Xiangli Wang / Fujiet Koh / Ellen D Zhong / Bonnie Berger / Joseph H Davis / Susan K Dutcher / Rui Zhang / Alan Brown / ![]() ![]() 要旨: In motile cilia, a mechanoregulatory network is responsible for converting the action of thousands of dynein motors bound to doublet microtubules into a single propulsive waveform. Here, we use two ...In motile cilia, a mechanoregulatory network is responsible for converting the action of thousands of dynein motors bound to doublet microtubules into a single propulsive waveform. Here, we use two complementary cryo-EM strategies to determine structures of the major mechanoregulators that bind ciliary doublet microtubules in Chlamydomonas reinhardtii. We determine structures of isolated radial spoke RS1 and the microtubule-bound RS1, RS2 and the nexin-dynein regulatory complex (N-DRC). From these structures, we identify and build atomic models for 30 proteins, including 23 radial-spoke subunits. We reveal how mechanoregulatory complexes dock to doublet microtubules with regular 96-nm periodicity and communicate with one another. Additionally, we observe a direct and dynamically coupled association between RS2 and the dynein motor inner dynein arm subform c (IDAc), providing a molecular basis for the control of motor activity by mechanical signals. These structures advance our understanding of the role of mechanoregulation in defining the ciliary waveform. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 223.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 137.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 635.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 635 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 35.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 58 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 56856.688 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A8J2J7, UniProt: P12759*PLUS #2: タンパク質 | 分子量: 10336.775 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q39580 #3: タンパク質 | | 分子量: 28418.410 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A0A2K3DJP7 #4: タンパク質 | | 分子量: 75037.945 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A0A2K3D359 #5: タンパク質 | | 分子量: 18317.215 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A8IDP6, UniProt: P04352*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: stalk of radial spoke 1 / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: NATURAL |
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分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() 株: CC-125 / Organelle: cilia |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES / 詳細: This sample is attached with doublet microtubule |
試料支持 | 詳細: unspecified |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 平均露光時間: 9 sec. / 電子線照射量: 38.9 e/Å2 / 検出モード: COUNTING フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
画像スキャン | 動画フレーム数/画像: 30 / 利用したフレーム数/画像: 1-30 |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
対称性 | 点対称性: C1 (非対称) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 6.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 143514 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | 空間: REAL |