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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7czo | ||||||
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タイトル | N-terminal domain of HipA toxin | ||||||
![]() | Uncharacterized protein HI_0666 | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION / N-terminal domain of HipA toxin | ||||||
機能・相同性 | HipA, N-terminal subdomain 1 / HipA N-terminal domain / protein serine/threonine kinase activity / cytosol / Uncharacterized protein HI_0666![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kang, S.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The Haemophilus influenzae HipBA toxin-antitoxin system adopts an unusual three-com-ponent regulatory mechanism 著者: Koo, J.S. / Kang, S.M. / Jung, W.M. / Kim, D.H. / Lee, B.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 24 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2wiuS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12468.080 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd / 遺伝子: HI_0666 / 発現宿主: ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-CL / #3: 水 | ChemComp-HOH / | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.56 Å3/Da / 溶媒含有率: 73.03 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: 1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, 0.5% (w/v) PEG 8000 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2019年11月14日 |
放射 | プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9795 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.7→50 Å / Num. obs: 6880 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 9.6 % / CC1/2: 0.998 / Net I/σ(I): 27.9 |
反射 シェル | 解像度: 2.7→2.75 Å / Num. unique obs: 345 / CC1/2: 0.973 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 2WIU 解像度: 2.7→50 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 76.47 Å2 | ||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→50 Å
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拘束条件 |
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