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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7cp6 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of FqzB | ||||||
![]() | MAK1-like monooxygenase | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / flavin adenine dinucleotide / FAD-dependent monooxygenase | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hara, K. / Hashimoto, H. / Matsushita, T. / Kishimoto, S. / Watanabe, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural and Functional Analyses of a Spiro-Carbon-Forming, Highly Promiscuous Epoxidase from Fungal Natural Product Biosynthesis. 著者: Matsushita, T. / Kishimoto, S. / Hara, K. / Hashimoto, H. / Watanabe, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 195.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 141.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 938.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 949.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 33.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 45.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50977.641 Da / 分子数: 2 / 変異: L119I,A140T / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-IOD / #4: 化合物 | ChemComp-HG / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | Has protein modification | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.24 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.99 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: PEG3350, Bis-Tris propane, sodium iodide |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年2月24日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.00563 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→41.64 Å / Num. obs: 45285 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 13.6 % / Biso Wilson estimate: 35.71 Å2 / CC1/2: 0.997 / Rmerge(I) obs: 0.124 / Net I/σ(I): 14.87 |
反射 シェル | 解像度: 2.2→2.28 Å / Rmerge(I) obs: 0.822 / Num. unique obs: 4430 / CC1/2: 0.837 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 42.11 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→41.64 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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