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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7a4d
タイトルCrystal structure of the APH coiled-coil in complex with nanobodies Nb28 and Nb30
要素
  • APH coiled-coil
  • Nanobody Nb28
  • Nanobody Nb30
キーワードDE NOVO PROTEIN / coiled-coil / nanobody / antibody / protein design
機能・相同性Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / ACETATE ION
機能・相同性情報
生物種Lama glama (ラマ)
synthetic construct (人工物)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.694 Å
データ登録者Hadzi, S.
資金援助European Union, スロベニア, 3件
組織認可番号国
European Research Council (ERC)787115European Union
Slovenian Research AgencyP4-0176 スロベニア
Slovenian Research AgencyP1-0201 スロベニア
引用ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2021
タイトル: A nanobody toolbox targeting dimeric coiled-coil modules for functionalization of designed protein origami structures.
著者: Majerle, A. / Hadzi, S. / Aupic, J. / Satler, T. / Lapenta, F. / Strmsek, Z. / Lah, J. / Loris, R. / Jerala, R.
履歴
登録2020年8月19日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02021年5月5日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12021年8月11日Group: Database references / Derived calculations
カテゴリ: database_2 / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_gen
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.22024年5月1日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim
Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
改定 1.32024年10月16日Group: Structure summary
カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: Nanobody Nb28
B: Nanobody Nb28
C: Nanobody Nb30
D: Nanobody Nb30
E: APH coiled-coil
F: APH coiled-coil
G: Nanobody Nb28
H: Nanobody Nb28
I: Nanobody Nb30
J: Nanobody Nb30
K: APH coiled-coil
L: APH coiled-coil
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)134,60617
ポリマ－134,26912
非ポリマー3375
水1,06359
1
A: Nanobody Nb28
B: Nanobody Nb28
C: Nanobody Nb30
D: Nanobody Nb30
E: APH coiled-coil
F: APH coiled-coil
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)67,3519
ポリマ－67,1346
非ポリマー2163
水1086
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
2
G: Nanobody Nb28
H: Nanobody Nb28
I: Nanobody Nb30
J: Nanobody Nb30
K: APH coiled-coil
L: APH coiled-coil
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)67,2558
ポリマ－67,1346
非ポリマー1212
水1086
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)61.260, 127.450, 192.910
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number19
Space group name H-MP212121
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID詳細
11(chain A and (resid 3 through 86 or (resid 87...
21(chain B and (resid 3 through 86 or (resid 87...
31(chain G and resid 3 through 118)
41(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...
12(chain C and ((resid 3 and (name N or name...
22(chain D and ((resid 3 and (name N or name...
32(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...
42(chain J and ((resid 3 and (name N or name...
13(chain E and ((resid 1 through 2 and (name N...
23(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...
33(chain K and ((resid 1 through 2 and (name N...
43(chain L and ((resid 1 through 2 and (name N...

NCSドメイン領域:
Dom-IDComponent-IDEns-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDSelection detailsAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
111GLNGLNLEULEU(chain A and (resid 3 through 86 or (resid 87...AA3 - 863 - 86
121LYSLYSLYSLYS(chain A and (resid 3 through 86 or (resid 87...AA8787
131GLNGLNARGARG(chain A and (resid 3 through 86 or (resid 87...AA3 - 1203 - 120
141GLNGLNARGARG(chain A and (resid 3 through 86 or (resid 87...AA3 - 1203 - 120
151GLNGLNARGARG(chain A and (resid 3 through 86 or (resid 87...AA3 - 1203 - 120
211GLNGLNLEULEU(chain B and (resid 3 through 86 or (resid 87...BB3 - 863 - 86
221LYSLYSLYSLYS(chain B and (resid 3 through 86 or (resid 87...BB8787
231VALVALSERSER(chain B and (resid 3 through 86 or (resid 87...BB2 - 1182 - 118
311GLNGLNSERSER(chain G and resid 3 through 118)GG3 - 1183 - 118
411GLNGLNLEULEU(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...HH3 - 863 - 86
421LYSLYSLYSLYS(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...HH8787
431GLNGLNSERSER(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...HH3 - 1183 - 118
441GLNGLNSERSER(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...HH3 - 1183 - 118
451GLNGLNSERSER(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...HH3 - 1183 - 118
461GLNGLNSERSER(chain H and (resid 3 through 86 or (resid 87...HH3 - 1183 - 118
112GLNGLNGLNGLN(chain C and ((resid 3 and (name N or name...CC33
122GLNGLNSERSER(chain C and ((resid 3 and (name N or name...CC3 - 1153 - 115
132GLNGLNSERSER(chain C and ((resid 3 and (name N or name...CC3 - 1153 - 115
142GLNGLNSERSER(chain C and ((resid 3 and (name N or name...CC3 - 1153 - 115
152GLNGLNSERSER(chain C and ((resid 3 and (name N or name...CC3 - 1153 - 115
212GLNGLNGLNGLN(chain D and ((resid 3 and (name N or name...DD33
222GLNGLNSERSER(chain D and ((resid 3 and (name N or name...DD3 - 1143 - 114
232GLNGLNSERSER(chain D and ((resid 3 and (name N or name...DD3 - 1143 - 114
242GLNGLNSERSER(chain D and ((resid 3 and (name N or name...DD3 - 1143 - 114
252GLNGLNSERSER(chain D and ((resid 3 and (name N or name...DD3 - 1143 - 114
312GLNGLNGLYGLY(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...II3 - 423 - 42
322LYSLYSLYSLYS(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...II4343
332GLNGLNSERSER(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...II3 - 1153 - 115
342GLNGLNSERSER(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...II3 - 1153 - 115
352GLNGLNSERSER(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...II3 - 1153 - 115
362GLNGLNSERSER(chain I and (resid 3 through 42 or (resid 43...II3 - 1153 - 115
412GLNGLNGLNGLN(chain J and ((resid 3 and (name N or name...JJ33
422GLNGLNSERSER(chain J and ((resid 3 and (name N or name...JJ3 - 1153 - 115
432GLNGLNSERSER(chain J and ((resid 3 and (name N or name...JJ3 - 1153 - 115
442GLNGLNSERSER(chain J and ((resid 3 and (name N or name...JJ3 - 1153 - 115
452GLNGLNSERSER(chain J and ((resid 3 and (name N or name...JJ3 - 1153 - 115
113LEULEUGLUGLU(chain E and ((resid 1 through 2 and (name N...EE1 - 22 - 3
123ACEACENH2NH2(chain E and ((resid 1 through 2 and (name N...EE0 - 411 - 42
133ACEACENH2NH2(chain E and ((resid 1 through 2 and (name N...EE0 - 411 - 42
143ACEACENH2NH2(chain E and ((resid 1 through 2 and (name N...EE0 - 411 - 42
153ACEACENH2NH2(chain E and ((resid 1 through 2 and (name N...EE0 - 411 - 42
213LEULEULEULEU(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...FF1 - 52 - 6
223LYSLYSLYSLYS(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...FF67
233ACEACELEULEU(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...FF0 - 401 - 41
243ACEACELEULEU(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...FF0 - 401 - 41
253ACEACELEULEU(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...FF0 - 401 - 41
263ACEACELEULEU(chain F and (resid 1 through 5 or (resid 6...FF0 - 401 - 41
313LEULEUGLUGLU(chain K and ((resid 1 through 2 and (name N...KK1 - 22 - 3
323LEULEULEULEU(chain K and ((resid 1 through 2 and (name N...KK1 - 402 - 41
333LEULEULEULEU(chain K and ((resid 1 through 2 and (name N...KK1 - 402 - 41
343LEULEULEULEU(chain K and ((resid 1 through 2 and (name N...KK1 - 402 - 41
353LEULEULEULEU(chain K and ((resid 1 through 2 and (name N...KK1 - 402 - 41
413LEULEUGLUGLU(chain L and ((resid 1 through 2 and (name N...LL1 - 22 - 3
423LEULEULEULEU(chain L and ((resid 1 through 2 and (name N...LL1 - 402 - 41
433LEULEULEULEU(chain L and ((resid 1 through 2 and (name N...LL1 - 402 - 41
443LEULEULEULEU(chain L and ((resid 1 through 2 and (name N...LL1 - 402 - 41
453LEULEULEULEU(chain L and ((resid 1 through 2 and (name N...LL1 - 402 - 41

NCSアンサンブル:
ID
1
2
3

-
要素

-
タンパク質・ペプチド , 1種, 4分子 EFKL

#3: タンパク質・ペプチド
APH coiled-coil


分子量: 4835.549 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)

-
抗体 , 2種, 8分子 ABGHCDIJ

#1: 抗体
Nanobody Nb28


分子量: 14426.892 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Lama glama (ラマ)
発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌)
#2: 抗体
Nanobody Nb30


分子量: 14304.715 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Lama glama (ラマ)
発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌)

-
非ポリマー , 4種, 64分子

#4: 化合物 ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL


分子量: 62.068 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H6O2
#5: 化合物 ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL


分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C3H8O3
#6: 化合物 ChemComp-ACT / ACETATE ION


分子量: 59.044 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H3O2
#7: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 59 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationY

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.8 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.14 %
結晶化温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5
詳細: 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate 6.5

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SOLEIL / ビームライン: PROXIMA 1 / 波長: 0.97857 Å
検出器タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年11月18日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.97857 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.694→48.227 Å / Num. obs: 42539 / % possible obs: 99.48 % / 冗長度: 11.82 % / Biso Wilson estimate: 69.55 Å2 / CC1/2: 0.998 / Rrim(I) all: 0.144 / Net I/σ(I): 15.52
反射 シェル解像度: 2.694→2.791 Å / Num. unique obs: 4077 / CC1/2: 0.654 / Rrim(I) all: 1.516 / % possible all: 95.74

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類NB
PHENIX1.12_2829精密化
XDSデータ削減
XSCALEデータスケーリング
PHASER位相決定
PDB_EXTRACT3.25データ抽出
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: Modeler

解像度: 2.694→48.227 Å / SU ML: 0.35 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 24.49 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2227 2121 4.99 %
Rwork0.1765 40343 -
obs0.1789 42464 99.44 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso max: 170.66 Å2 / Biso mean: 69.58 Å2 / Biso min: 30 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.694→48.227 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数8303 0 51 59 8413
Biso mean--105.26 63.56 -
残基数----1085
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0098507
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.12811524
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0591221
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0071505
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d16.4565047
Refine LS restraints NCS
Ens-IDDom-IDAuth asym-ID数Refine-IDRmsタイプ
11A2131X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
12B2131X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
13G2131X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
14H2131X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
21C2022X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
22D2022X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
23I2022X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
24J2022X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
31E782X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
32F782X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
33K782X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
34L782X-RAY DIFFRACTION14.006TORSIONAL
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection Rwork% reflection obs (%)
2.694-2.75620.33551280.3137247193
2.7562-2.82510.33191390.2632644100
2.8251-2.90150.31621410.26522682100
2.9015-2.98690.30081390.25522636100
2.9869-3.08330.32861420.25252684100
3.0833-3.19350.27371400.22352663100
3.1935-3.32130.29981410.21822683100
3.3213-3.47240.2521400.1912671100
3.4724-3.65540.26391420.18482696100
3.6554-3.88440.2441410.1652684100
3.8844-4.18410.19361420.15022696100
4.1841-4.60490.15221440.12462738100
4.6049-5.27050.17131430.13092724100
5.2705-6.63750.19181460.16842777100
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
13.75-0.6913-0.40898.29223.03064.08980.14680.14980.3620.17620.0561-0.5458-0.12130.1626-0.18750.457-0.01830.03930.35890.02180.49174.4783-0.0507-9.054
24.9424-1.22851.01898.7414-0.18934.2578-0.11010.0179-0.40731.14450.127-0.23360.96310.11130.04870.8240.0683-0.0640.3666-0.09970.513979.2951-32.469-9.9887
35.20331.6623-0.55642.2108-0.58823.11470.27080.6095-0.1364-0.0902-0.34610.2095-0.4782-1.33640.08450.69640.22210.02781.0525-0.20280.479353.124-17.909-33.2027
44.0803-0.1711-1.01643.7874-0.50227.74890.24380.1348-0.0419-0.4182-0.0832-0.2460.05490.6857-0.17990.56590.18940.03110.5543-0.06220.416476.8296-17.4502-42.9157
53.7314-3.1445-3.67723.56662.27387.12330.55340.41380.6056-0.1586-0.3595-0.2236-0.5560.3142-0.09260.45950.0164-0.09540.4678-0.02230.340771.9886-12.5328-22.1712
63.7033-1.2617-4.8792.15940.71736.36580.53410.5085-1.2354-0.3002-0.51810.2074-0.0512-0.1196-0.04240.56470.0699-0.03830.4169-0.0910.333671.1195-21.1457-21.6044
73.4868-1.4622-0.38967.00633.19117.3878-0.1528-0.0039-0.34880.14540.0622-0.1490.6540.1860.04670.54110.00010.05440.28720.00420.342746.79190.11375.3835
82.5893-0.04940.23518.1619-0.48944.3068-0.12750.06960.5256-0.0486-0.0970.0848-0.0355-0.06030.23760.37590.014-0.0710.2862-0.01080.476747.002432.65886.5353
96.6193-2.3948-2.54172.55731.32045.7416-0.3568-0.0378-0.227-0.04480.21330.30430.3151-0.21480.1390.84640.018-0.07540.4437-0.04110.457724.317413.807330.7779
105.95110.31220.62642.5568-0.66486.61150.2587-1.5169-0.05910.8704-0.0326-0.43330.32041.0856-0.18040.90070.0214-0.13771.0299-0.03360.467647.938216.789139.4639
113.86114.39590.43647.50434.79625.52820.4297-0.0998-0.7050.5939-0.2541-0.23010.78370.2379-0.18530.6310.05590.05280.37360.01440.398642.773311.731718.747
126.96637.54344.92196.98973.31274.81730.3161-0.79790.93840.3797-0.45560.39540.0698-0.36930.07810.65250.0533-0.02440.3625-0.00740.418941.086420.038718.3874
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1(chain 'A' and resid 3 through 120)A3 - 120
2X-RAY DIFFRACTION2(chain 'B' and resid 2 through 118)B2 - 118
3X-RAY DIFFRACTION3(chain 'C' and resid 3 through 115)C3 - 115
4X-RAY DIFFRACTION4(chain 'D' and resid 3 through 114)D3 - 114
5X-RAY DIFFRACTION5(chain 'E' and resid 0 through 41)E0 - 41
6X-RAY DIFFRACTION6(chain 'F' and resid 0 through 40)F0 - 40
7X-RAY DIFFRACTION7(chain 'G' and resid 1 through 120)G1 - 120
8X-RAY DIFFRACTION8(chain 'H' and resid 3 through 118)H3 - 118
9X-RAY DIFFRACTION9(chain 'I' and resid 3 through 115)I3 - 115
10X-RAY DIFFRACTION10(chain 'J' and resid 3 through 115)J3 - 115
11X-RAY DIFFRACTION11(chain 'K' and resid 1 through 40)K1 - 40
12X-RAY DIFFRACTION12(chain 'L' and resid 1 through 40)L1 - 40

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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