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Yorodumi- PDB-6zfh: Structure of human galactokinase in complex with galactose and 2'... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6zfh | ||||||
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Title | Structure of human galactokinase in complex with galactose and 2'-(benzo[d]oxazol-2-ylamino)-7',8'-dihydro-1'H-spiro[cyclopentane-1,4'-quinazolin]-5'(6'H)-one | ||||||
Components | Galactokinase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / GHMP Kinase / Galactose metabolism / Inhibitor / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC | ||||||
Function / homology | Function and homology information glycolytic process from galactose / Defective GALK1 causes GALCT2 / galactitol metabolic process / galactokinase / galactokinase activity / galactose catabolic process / Galactose catabolism / galactose catabolic process via UDP-galactose / galactose binding / galactose metabolic process ...glycolytic process from galactose / Defective GALK1 causes GALCT2 / galactitol metabolic process / galactokinase / galactokinase activity / galactose catabolic process / Galactose catabolism / galactose catabolic process via UDP-galactose / galactose binding / galactose metabolic process / extracellular exosome / ATP binding / membrane / cytosol / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.439 Å | ||||||
Authors | Bezerra, G.A. / Mackinnon, S. / Zhang, M. / Foster, W. / Bailey, H. / Arrowsmith, C. / Edwards, A. / Bountra, C. / Lai, K. / Yue, W.W. / Structural Genomics Consortium (SGC) | ||||||
Funding support | United Kingdom, 1items
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Citation | Journal: Acs Chem.Biol. / Year: 2021 Title: Fragment Screening Reveals Starting Points for Rational Design of Galactokinase 1 Inhibitors to Treat Classic Galactosemia. Authors: Mackinnon, S.R. / Krojer, T. / Foster, W.R. / Diaz-Saez, L. / Tang, M. / Huber, K.V.M. / von Delft, F. / Lai, K. / Brennan, P.E. / Arruda Bezerra, G. / Yue, W.W. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6zfh.cif.gz | 1.1 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6zfh.ent.gz | 944.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6zfh.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zf/6zfh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zf/6zfh | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 6q3xC 6zgvC 6zgwC 6zgxC 6zgyC 6zgzC 6zh0C 1wuuS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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