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Yorodumi- PDB-6x1h: Crystal structure of a guanine nucleotide exchange factor (GEF) d... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6x1h | ||||||
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Title | Crystal structure of a guanine nucleotide exchange factor (GEF) domain from the Orientia tsutsugamushi protein OtDUB | ||||||
Components | ULP_PROTEASE domain-containing protein | ||||||
Keywords | SIGNALING PROTEIN / guanine nucleotide exchange factor / GEF / Orientia tsutsugamushi / scrub typhus | ||||||
Function / homology | Ubiquitin-like protease family profile. / Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain / Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain / cysteine-type peptidase activity / Papain-like cysteine peptidase superfamily / proteolysis / NICKEL (II) ION / Ubiquitin-like protease family profile domain-containing protein Function and homology information | ||||||
Biological species | Orientia tsutsugamushi (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.91 Å | ||||||
Authors | Lim, C.S. / Xiong, Y. | ||||||
Funding support | United States, 1items
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Citation | Journal: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / Year: 2020 Title: Crystal structure of a guanine nucleotide exchange factor encoded by the scrub typhus pathogen Orientia tsutsugamushi . Authors: Lim, C. / Berk, J.M. / Blaise, A. / Bircher, J. / Koleske, A.J. / Hochstrasser, M. / Xiong, Y. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6x1h.cif.gz | 524 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6x1h.ent.gz | 440.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6x1h.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 6x1h_validation.pdf.gz | 478 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 6x1h_full_validation.pdf.gz | 500.2 KB | Display | |
Data in XML | 6x1h_validation.xml.gz | 43.4 KB | Display | |
Data in CIF | 6x1h_validation.cif.gz | 59.6 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x1/6x1h ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x1/6x1h | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 6x1gSC S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Components on special symmetry positions |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: ARG / Beg label comp-ID: ARG / Refine code: _
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