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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6rs2 | ||||||||||||||||||
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タイトル | Structure of the Bateman module of human CNNM4. | ||||||||||||||||||
![]() | Metal transporter CNNM4 | ||||||||||||||||||
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機能・相同性 | ![]() : / sodium ion transmembrane transporter activity / magnesium ion transport / magnesium ion homeostasis / magnesium ion transmembrane transporter activity / enamel mineralization / response to stimulus / transmembrane transporter activity / ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||||||||
![]() | Corral-Rodriguez, M.A. / Stuiver, M. / Gomez-Garcia, I. / Oyenarte, I. / Gimenez, P. / Ereno-Orbea, J. / Diercks, T. / Muller, D. / Martinez-Cruz, L.A. | ||||||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural Insights into the Intracellular Region of the Human Magnesium Transport Mediator CNNM4. 著者: Gimenez-Mascarell, P. / Oyenarte, I. / Gonzalez-Recio, I. / Fernandez-Rodriguez, C. / Corral-Rodriguez, M.A. / Campos-Zarraga, I. / Simon, J. / Kostantin, E. / Hardy, S. / Diaz Quintana, A. / ...著者: Gimenez-Mascarell, P. / Oyenarte, I. / Gonzalez-Recio, I. / Fernandez-Rodriguez, C. / Corral-Rodriguez, M.A. / Campos-Zarraga, I. / Simon, J. / Kostantin, E. / Hardy, S. / Diaz Quintana, A. / Zubillaga Lizeaga, M. / Merino, N. / Diercks, T. / Blanco, F.J. / Diaz Moreno, I. / Martinez-Chantar, M.L. / Tremblay, M.L. / Muller, D. / Siliqi, D. / Martinez-Cruz, L.A. #1: ![]() タイトル: Structural Basis of the Oncogenic Interaction of Phosphatase PRL-1 with the Magnesium Transporter CNNM2. 著者: Gimenez-Mascarell, P. / Oyenarte, I. / Hardy, S. / Breiderhoff, T. / Stuiver, M. / Kostantin, E. / Diercks, T. / Pey, A.L. / Ereno-Orbea, J. / Martinez-Chantar, M.L. / Khalaf-Nazzal, R. / ...著者: Gimenez-Mascarell, P. / Oyenarte, I. / Hardy, S. / Breiderhoff, T. / Stuiver, M. / Kostantin, E. / Diercks, T. / Pey, A.L. / Ereno-Orbea, J. / Martinez-Chantar, M.L. / Khalaf-Nazzal, R. / Claverie-Martin, F. / Muller, D. / Tremblay, M.L. / Martinez-Cruz, L.A. #2: ジャーナル: Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun. 年: 2012 タイトル: Purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of the CBS-domain pair of cyclin M2 (CNNM2). 著者: Gomez-Garcia, I. / Stuiver, M. / Ereno, J. / Oyenarte, I. / Corral-Rodriguez, M.A. / Muller, D. / Martinez-Cruz, L.A. #3: ジャーナル: Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun. 年: 2011 タイトル: Purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of the CBS pair of the human metal transporter CNNM4. 著者: Gomez Garcia, I. / Oyenarte, I. / Martinez-Cruz, L.A. #4: ジャーナル: Biochem. J. / 年: 2014 タイトル: Nucleotide binding triggers a conformational change of the CBS module of the magnesium transporter CNNM2 from a twisted towards a flat structure. 著者: Corral-Rodriguez, M.A. / Stuiver, M. / Abascal-Palacios, G. / Diercks, T. / Oyenarte, I. / Ereno-Orbea, J. / de Opakua, A.I. / Blanco, F.J. / Encinar, J.A. / Spiwok, V. / Terashima, H. / ...著者: Corral-Rodriguez, M.A. / Stuiver, M. / Abascal-Palacios, G. / Diercks, T. / Oyenarte, I. / Ereno-Orbea, J. / de Opakua, A.I. / Blanco, F.J. / Encinar, J.A. / Spiwok, V. / Terashima, H. / Accardi, A. / Muller, D. / Martinez-Cruz, L.A. | ||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 125.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 98.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17638.051 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.12 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.16 % |
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結晶化![]() | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 / 詳細: 0.1M HEPES pH 7.5, 4 M NaCl |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2010年9月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 3.69→43.949 Å / Num. obs: 11864 / % possible obs: 98.7 % / 冗長度: 5.3 % / CC1/2: 0.99 / Rpim(I) all: 0.023 / Rrim(I) all: 0.052 / Rsym value: 0.047 / Net I/σ(I): 21 |
反射 シェル | 解像度: 3.69→3.76 Å / 冗長度: 5.2 % / Mean I/σ(I) obs: 3.4 / Num. unique obs: 11864 / CC1/2: 0.91 / Rpim(I) all: 0.209 / Rrim(I) all: 0.485 / Rsym value: 0.437 / % possible all: 90.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: 3KPB 解像度: 3.694→43.949 Å / SU ML: 0.52 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.36 / 位相誤差: 29.56
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.694→43.949 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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