PDB-6rlg: Crystal structure of LdtMt2 from Mycobacterium tuberculosis

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6rlg

タイトル

Crystal structure of LdtMt2 from Mycobacterium tuberculosis

要素

L,D-transpeptidase 2

キーワード

ANTIMICROBIAL PROTEIN / beta lactmase / antibiotic resistance / tuberculosis

機能・相同性

機能・相同性情報

peptidoglycan-based cell wall biogenesis / peptidoglycan-protein cross-linking / peptidoglycan metabolic process / peptidoglycan L,D-transpeptidase activity / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの / acyltransferase activity / peptidoglycan-based cell wall / cell wall organization / regulation of cell shape / extracellular region ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Mycobacterium tuberculosis (結核菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.51000183032 Å

データ登録者

Brem, J. / Lohans, C. / Schofield, C.

資金援助

英国, 1件

引用

ジャーナル: Chem.Commun.(Camb.) / 年: 2019
タイトル: Targeting the Mycobacterium tuberculosis transpeptidase LdtMt2with cysteine-reactive inhibitors including ebselen.
著者: de Munnik, M. / Lohans, C.T. / Lang, P.A. / Langley, G.W. / Malla, T.R. / Tumber, A. / Schofield, C.J. / Brem, J.

履歴

登録	2019年5月2日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2019年8月14日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年9月4日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.2	2024年1月24日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6rlg.cif.gz	504.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6rlg.ent.gz	344.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6rlg.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6rlg_validation.pdf.gz	3.6 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6rlg_full_validation.pdf.gz	3.6 MB	表示
XML形式データ	6rlg_validation.xml.gz	35.1 KB	表示
CIF形式データ	6rlg_validation.cif.gz	54.8 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rl/6rlg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rl/6rlg	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6rrmC 5dujS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5dzp-1 5uwv-4 5dvp-2 3vyn-1 5dcc-2 5duj-2 5uwv-1 5uwv-6 4qrb-d 5du7-4 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#261 - 2021年9月 DNA配列ナノポア (DNA-Sequencing Nanopores) 類似性 (1) #22 - 2001年10月光化学系I (Photosystem I) 類似性 (1) #262 - 2021年10月 PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures ) 類似性 (1) #29 - 2002年5月ペニシリン結合タンパク質 (Penicillin-binding Proteins) 類似性 (1) #95 - 2007年11月多剤耐性輸送体 (Multidrug Resistance Transporters) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#261 - 2021年9月
DNA配列ナノポア (DNA-Sequencing Nanopores)
類似性 (1)
#22 - 2001年10月
光化学系I (Photosystem I)
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#262 - 2021年10月
PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures )
類似性 (1)
#29 - 2002年5月
ペニシリン結合タンパク質 (Penicillin-binding Proteins)
類似性 (1)
#95 - 2007年11月
多剤耐性輸送体 (Multidrug Resistance Transporters)
類似性 (1)

登録構造単位

A: L,D-transpeptidase 2

B: L,D-transpeptidase 2

ヘテロ分子

77.2 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: L,D-transpeptidase 2

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration, monomer
38.9 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: L,D-transpeptidase 2

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
38.3 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	60.950, 93.920, 75.570
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 93.030, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1
Space group name Hall	P2yb
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -x,y+1/2,-z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID
1	1
2	1

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	LEU	LEU	VAL	VAL	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	57 - 66	4 - 13
1	2	ASP	ASP	ALA	ALA	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	68 - 77	15 - 24
1	3	VAL	VAL	THR	THR	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	79 - 92	26 - 39
1	4	VAL	VAL	ASN	ASN	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	94 - 95	41 - 42
1	5	ASN	ASN	PRO	PRO	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	97 - 100	44 - 47
1	6	ALA	ALA	TRP	TRP	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	102 - 112	49 - 59
1	7	THR	THR	TYR	TYR	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	114 - 120	61 - 67
1	8	ARG	ARG	THR	THR	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	123 - 125	70 - 72
1	9	ASN	ASN	SER	SER	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	127 - 146	74 - 93
1	10	PRO	PRO	LYS	LYS	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	148 - 189	95 - 136
1	11	THR	THR	PRO	PRO	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	191 - 194	138 - 141
1	12	VAL	VAL	GLU	GLU	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	196 - 235	143 - 182
1	13	PHE	PHE	VAL	VAL	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	238 - 294	185 - 241
1	14	ARG	ARG	LYS	LYS	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	297 - 299	244 - 246
1	15	ILE	ILE	LYS	LYS	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	301 - 370	248 - 317
1	16	GLY	GLY	LYS	LYS	(chain 'A' and ((resid 57 and (name N or name...	A	A	372 - 407	319 - 354
2	17	LEU	LEU	VAL	VAL	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	57 - 66	4 - 13
2	18	ASP	ASP	ALA	ALA	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	68 - 77	15 - 24
2	19	VAL	VAL	THR	THR	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	79 - 92	26 - 39
2	20	VAL	VAL	ASN	ASN	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	94 - 95	41 - 42
2	21	ASN	ASN	PRO	PRO	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	97 - 100	44 - 47
2	22	ALA	ALA	TRP	TRP	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	102 - 112	49 - 59
2	23	THR	THR	TYR	TYR	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	114 - 120	61 - 67
2	24	ARG	ARG	THR	THR	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	123 - 125	70 - 72
2	25	ASN	ASN	SER	SER	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	127 - 146	74 - 93
2	26	PRO	PRO	LYS	LYS	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	148 - 189	95 - 136
2	27	THR	THR	PRO	PRO	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	191 - 194	138 - 141
2	28	VAL	VAL	GLU	GLU	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	196 - 235	143 - 182
2	29	PHE	PHE	VAL	VAL	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	238 - 294	185 - 241
2	30	ARG	ARG	LYS	LYS	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	297 - 299	244 - 246
2	31	ILE	ILE	LYS	LYS	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	301 - 370	248 - 317
2	32	GLY	GLY	LYS	LYS	(chain 'B' and (resid 57 through 66 or resid 68...	B	B	372 - 407	319 - 354

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質	L,D-transpeptidase 2 / LDT 2 / Ldt(Mt2) 分子量: 38012.211 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) (結核菌) 株: CDC 1551 / Oshkosh / 遺伝子: ldtB, MT2594, V735_02606 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: O53223, 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの

#1: タンパク質

L,D-transpeptidase 2 / LDT 2 / Ldt(Mt2)

分子量: 38012.211 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) (結核菌)
株: CDC 1551 / Oshkosh / 遺伝子: ldtB, MT2594, V735_02606 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: O53223, 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの

-
非ポリマー , 5種, 847分子

#2: 化合物	ChemComp-NO3 / NITRATE ION 分子量: 62.005 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: NO₃
#3: 化合物	ChemComp-TRS / 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL / TRIS BUFFER / トリス(ヒドロキシメチル)メチルアンモニウム分子量: 122.143 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₂NO₃ / コメント: pH緩衝剤*YM
#4: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 13 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#5: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 828 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.87 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.17 %
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.3 / 詳細: 0.2 M Ammonium nitrate pH 6.3, 20% PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I04 / 波長: 0.97952 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年6月30日
放射	モノクロメーター: Double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97952 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.51→33.79 Å / Num. obs: 132783 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 6.5 % / B_iso Wilson estimate: 21.2079757645 Å² / CC_1/2: 0.99 / R_merge(I) obs: 0.0748 / R_pim(I) all: 0.032 / R_rim(I) all: 0.081 / Net I/σ(I): 12.03
反射シェル	解像度: 1.51→1.54 Å / 冗長度: 6.7 % / Mean I/σ(I) obs: 1.1 / Num. unique obs: 6593 / CC_1/2: 0.56 / R_pim(I) all: 0.685 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.11.1_2575	精密化
PHENIX	1.11.1_2575	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
SHELXD		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5DUJ

5duj

解像度: 1.51000183032→33.7871482655 Å / SU ML: 0.173821797353 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34349787152 / 位相誤差: 22.2968116321

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.203826681086	6726	5.06842295635 %
R_work	0.180194769066	-	-
obs	0.181402239935	132704	99.8082115539 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 30.1701442648 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.51000183032→33.7871482655 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5237	0	78	828	6143

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.00859965640507	5649
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.99258571886	7736
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0633409903721	857
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.00711880568372	1026
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.6630625072	3262

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.51-1.5272	0.322926147431	192	0.337937877592	4210	X-RAY DIFFRACTION	99.7507364605
1.5272-1.5451	0.335922094485	218	0.313847829924	4171	X-RAY DIFFRACTION	99.8862084661
1.5451-1.564	0.276520526888	223	0.288064901575	4221	X-RAY DIFFRACTION	99.9550157445
1.564-1.5838	0.291760517056	219	0.278457953143	4145	X-RAY DIFFRACTION	99.931302954
1.5838-1.6046	0.298237120836	213	0.272850717048	4279	X-RAY DIFFRACTION	99.8888147654
1.6046-1.6266	0.281022910341	238	0.278168746394	4116	X-RAY DIFFRACTION	99.9540863177
1.6266-1.6498	0.271610705283	239	0.262646560145	4251	X-RAY DIFFRACTION	100
1.6498-1.6744	0.283640751134	228	0.249402779527	4131	X-RAY DIFFRACTION	99.954138959
1.6744-1.7006	0.25704515489	223	0.248003125086	4191	X-RAY DIFFRACTION	99.9773499434
1.7006-1.7285	0.263326734647	226	0.237071776327	4206	X-RAY DIFFRACTION	99.932356257
1.7285-1.7583	0.233857884299	203	0.21966604359	4194	X-RAY DIFFRACTION	99.9318181818
1.7583-1.7903	0.233682556683	203	0.207973410618	4235	X-RAY DIFFRACTION	99.954954955
1.7903-1.8247	0.233595115689	211	0.206021301248	4183	X-RAY DIFFRACTION	99.9772468714
1.8247-1.8619	0.214692766976	200	0.197192287319	4223	X-RAY DIFFRACTION	99.9548022599
1.8619-1.9024	0.227750103482	238	0.19964310271	4225	X-RAY DIFFRACTION	99.9328257949
1.9024-1.9467	0.229899979156	197	0.206667661367	4181	X-RAY DIFFRACTION	99.8176014592
1.9467-1.9954	0.194060547338	244	0.191002404555	4202	X-RAY DIFFRACTION	99.9550359712
1.9954-2.0493	0.191662310208	230	0.180191031205	4199	X-RAY DIFFRACTION	99.9774266366
2.0493-2.1096	0.215502524556	226	0.18650774376	4180	X-RAY DIFFRACTION	99.5931283906
2.1096-2.1777	0.200230081604	250	0.174544910484	4167	X-RAY DIFFRACTION	99.9321266968
2.1777-2.2555	0.196319733143	254	0.172605809466	4149	X-RAY DIFFRACTION	99.5253164557
2.2555-2.3458	0.171857939883	222	0.173832022239	4197	X-RAY DIFFRACTION	99.5494480739
2.3458-2.4525	0.18719152541	253	0.171512583458	4167	X-RAY DIFFRACTION	99.9321727334
2.4525-2.5818	0.20511017976	227	0.164541341613	4192	X-RAY DIFFRACTION	99.684186781
2.5818-2.7434	0.206073661553	219	0.170135562375	4204	X-RAY DIFFRACTION	99.4826810616
2.7434-2.9552	0.207303305075	204	0.173908126813	4253	X-RAY DIFFRACTION	99.9775684163
2.9552-3.2523	0.209850330062	243	0.165919978599	4197	X-RAY DIFFRACTION	99.7752808989
3.2523-3.7224	0.176498555728	229	0.157051582879	4199	X-RAY DIFFRACTION	99.3939393939
3.7224-4.6879	0.154115871833	209	0.141486876758	4250	X-RAY DIFFRACTION	99.2432673047
4.6879-33.7956	0.209671320213	245	0.174909460495	4260	X-RAY DIFFRACTION	99.49204947

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	-0.0442678529536	0.142405558512	-0.104846743751	0.405665937033	-0.975418252851	3.0621498638	-0.0143315042521	0.01377799906	-0.00984792911791	0.013662115109	0.113731564044	0.0118982271879	-0.0852267954306	-0.0573511134909	-0.0926080702518	0.178313529598	0.046711628843	0.0298859669054	0.218803524698	0.0141036904517	0.243247265952	-11.0686894511	-87.7203573834	-12.4643478071
2	1.18150286195	-0.0800882639986	0.0603064443883	1.48502479936	0.606743208404	1.50746263777	0.159931086085	-0.0195762515517	-0.0895594308855	0.0911343913285	-0.16857166064	-0.027096269487	0.0620133868672	-0.042183724223	0.0161366810063	0.17002066888	-0.000168947752132	-0.0266768628397	0.148559952393	0.00451622694246	0.163592198761	-17.4789319168	-95.263123104	17.9659274255
3	0.190363872386	0.160746032901	-0.304428466203	0.296572900088	0.536163775243	2.15040082048	-0.00991238809831	0.0465147580529	-0.0358232039326	-0.0206458440064	0.0802648058459	-0.0484146578047	0.0289938221729	0.105825319804	-0.0761481557991	0.172851813844	0.0333655844564	-0.0262688140864	0.171150285343	-0.00190207861559	0.216991263064	10.6544195459	-101.897577743	16.9655747961
4	1.68749417281	0.0415202752872	0.368646578348	1.25658072597	-0.438764371263	1.48397456606	0.141504312307	-0.224102280665	0.0746720115213	0.128307694482	-0.168019483714	-0.0797959711395	-0.118946469486	0.0473018916011	0.0287044260286	0.186005949132	-0.0399551638819	-0.00012135384809	0.156239259158	-0.00384645077116	0.155738841738	13.5910153149	-90.8129804865	54.3121103056
5	2.79527757636	1.84072040443	0.439229788591	5.26262496828	-1.32999034641	2.68608972396	0.0261337960434	-0.15654265125	0.155130723674	0.00117146718343	-0.0169509946317	0.118713074408	-0.0632052393147	-0.145745116352	-0.0109438380805	0.124823218005	0.0222298392422	0.010802210762	0.122790415081	-0.00708668149677	0.147463652696	-10.4744807036	-77.4374788315	-33.4356364539

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'B' and (resid 123 through 248 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'B' and (resid 249 through 407 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 57 through 248 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 249 through 407 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 57 through 122 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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