PDB-6p1x: Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with dsD...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6p1x

タイトル

Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with dsDNA and L-ddCTP

要素

DNA Primer 20-mer
DNA template 27-mer
Reverse transcriptase/ribonuclease H
p51 RT

キーワード

TRANSFERASE/DNA / Reverse Transcriptase / ternary complex / L-ddCTP / chain terminator / stereochemistry / TRANSFERASE / TRANSFERASE-DNA complex

機能・相同性

機能・相同性情報

integrase activity / Integration of viral DNA into host genomic DNA / Autointegration results in viral DNA circles / Minus-strand DNA synthesis / Plus-strand DNA synthesis / 2-LTR circle formation / Uncoating of the HIV Virion / Vpr-mediated nuclear import of PICs / Early Phase of HIV Life Cycle / Integration of provirus ...
類似検索 - 分子機能

HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1 / HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1 / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H / Reverse transcriptase connection / Reverse transcriptase connection domain / Reverse transcriptase thumb / Reverse transcriptase thumb domain / Integrase Zinc binding domain / Zinc finger integrase-type profile. ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (ヒト免疫不全ウイルス)
synthetic construct (人工物)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.553 Å

データ登録者

Bertoletti, N. / Anderson, K.S.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2019
タイトル: Structural insights into the recognition of nucleoside reverse transcriptase inhibitors by HIV-1 reverse transcriptase: First crystal structures with reverse transcriptase and the ...
著者: Bertoletti, N. / Chan, A.H. / Schinazi, R.F. / Yin, Y.W. / Anderson, K.S.

履歴

登録	2019年5月20日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2019年7月24日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年8月21日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author / Item: _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.2	2019年8月28日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.3	2020年1月1日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2023年10月11日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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-
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類似性 (1)
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類似性 (1)

登録構造単位

A: Reverse transcriptase/ribonuclease H

B: p51 RT

P: DNA Primer 20-mer

T: DNA template 27-mer

ヘテロ分子

133 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration, cross-linking

単位格子

Length a, b, c (Å)	169.213, 171.502, 107.306
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	20
Space group name H-M	C222₁

-
タンパク質 , 2種, 2分子 AB

#1: タンパク質	Reverse transcriptase/ribonuclease H 分子量: 64521.895 Da / 分子数: 1 / 変異: C280S, Q258C / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (isolate HXB2) (ヒト免疫不全ウイルス) 株: isolate HXB2 / 遺伝子: gag-pol / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) 参照: UniProt: P04585, RNA-directed DNA polymerase, DNA-directed DNA polymerase, retroviral ribonuclease H
#2: タンパク質	p51 RT 分子量: 52748.418 Da / 分子数: 1 / 変異: C280S / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (isolate HXB2) (ヒト免疫不全ウイルス) 株: isolate HXB2 / 遺伝子: gag-pol / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P04585

#1: タンパク質

Reverse transcriptase/ribonuclease H

分子量: 64521.895 Da / 分子数: 1 / 変異: C280S, Q258C / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (isolate HXB2) (ヒト免疫不全ウイルス)
株: isolate HXB2 / 遺伝子: gag-pol / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)
参照: UniProt: P04585, RNA-directed DNA polymerase, DNA-directed DNA polymerase, retroviral ribonuclease H

#2: タンパク質

p51 RT

分子量: 52748.418 Da / 分子数: 1 / 変異: C280S / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (isolate HXB2) (ヒト免疫不全ウイルス)
株: isolate HXB2 / 遺伝子: gag-pol / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P04585

-
DNA鎖 , 2種, 2分子 PT

#3: DNA鎖	DNA Primer 20-mer 分子量: 6460.241 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#4: DNA鎖	DNA template 27-mer 分子量: 8408.397 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)

-
非ポリマー , 4種, 39分子

#5: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#6: 化合物	ChemComp-NQ4 / [[(2~{R},5~{S})-5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate / 1-[4-アミノ-2-オキソピリミジン-1(2H)-イル]-1,2,3-トリデオキシ-β-L-glycero-ペントフ(以下略) 分子量: 451.158 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₉H₁₆N₃O₁₂P₃ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#7: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#8: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 33 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.94 Å³/Da / 溶媒含有率: 58.2 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 6-10% (w/v) PEG 8000, 15 mM magnesium sulfate, and 50 mM MES adjusted at pH 6.0 PH範囲: 5.5-6

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS-II / ビームライン: 17-ID-2 / 波長: 0.9793 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年4月29日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9793 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.55→30 Å / Num. obs: 97351 / % possible obs: 99.4 % / 冗長度: 7.1 % / CC_1/2: 0.997 / R_sym value: 0.115 / Net I/σ(I): 12.13
反射シェル	解像度: 2.55→2.71 Å / 冗長度: 6.8 % / Mean I/σ(I) obs: 2.2 / Num. unique obs: 15225 / CC_1/2: 0.837 / R_sym value: 0.715 / % possible all: 96.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.14_3260: ???)	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6OR7

6or7

解像度: 2.553→29.749 Å / SU ML: 0.36 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 26.69

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2304	4853	4.99 %
R_work	0.1879	-	-
obs	0.19	97318	99.39 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.553→29.749 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7673	868	44	33	8618

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	8893
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.951	12297
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	17.793	5155
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.052	1355
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	1412

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.5533-2.5823	0.3763	136	0.3439	2590	X-RAY DIFFRACTION	85
2.5823-2.6127	0.2996	160	0.2754	3123	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6127-2.6445	0.332	155	0.2756	3115	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6445-2.678	0.345	160	0.2683	3123	X-RAY DIFFRACTION	100
2.678-2.7132	0.3401	162	0.26	3016	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7132-2.7503	0.2531	165	0.2784	3147	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7503-2.7896	0.3323	162	0.2739	3071	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7896-2.8312	0.3081	167	0.2742	3146	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8312-2.8754	0.3256	157	0.2624	3054	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8754-2.9225	0.3355	167	0.2508	3119	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9225-2.9728	0.303	161	0.2601	3051	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9728-3.0268	0.3182	161	0.2471	3088	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0268-3.085	0.3383	165	0.2491	3135	X-RAY DIFFRACTION	100
3.085-3.1479	0.3165	164	0.2426	3091	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1479-3.2163	0.259	158	0.2227	3092	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2163-3.291	0.2085	163	0.2097	3106	X-RAY DIFFRACTION	100
3.291-3.3732	0.2357	164	0.2075	3135	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3732-3.4643	0.2778	160	0.2128	3080	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4643-3.566	0.2561	166	0.2122	3112	X-RAY DIFFRACTION	100
3.566-3.6809	0.2322	164	0.1939	3086	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6809-3.8123	0.2505	162	0.1844	3086	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8123-3.9646	0.209	167	0.1615	3098	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9646-4.1445	0.1636	163	0.1552	3134	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1445-4.3624	0.2135	164	0.1451	3069	X-RAY DIFFRACTION	100
4.3624-4.6348	0.188	162	0.1372	3135	X-RAY DIFFRACTION	100
4.6348-4.9911	0.1708	165	0.1366	3067	X-RAY DIFFRACTION	100
4.9911-5.4905	0.1988	162	0.1421	3104	X-RAY DIFFRACTION	100
5.4905-6.2785	0.197	166	0.1693	3109	X-RAY DIFFRACTION	100
6.2785-7.8858	0.1961	162	0.1559	3088	X-RAY DIFFRACTION	100
7.8858-29.751	0.1548	163	0.1415	3095	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.7231	-0.2123	-0.1302	2.1746	0.1989	2.0682	-0.0285	0.419	0.5171	-0.3771	-0.0923	-0.2818	-0.4934	0.2245	0.1274	0.5448	-0.09	0.099	0.4457	0.0624	0.4983	-31.3213	8.9879	-28.7363
2	1.9435	-1.4531	0.6212	6.3998	-0.1477	6.0083	-0.1038	0.7386	-0.0566	-0.9465	-0.0977	0.0346	-0.1382	-0.0293	0.1328	0.5607	0.0182	0.0348	0.4491	0.1193	0.3818	-39.1076	2.0929	-34.6998
3	2.5154	-0.2567	-0.1474	1.9614	0.3598	1.1685	-0.1507	0.1957	0.3035	-0.097	0.101	-0.2803	-0.1966	0.0931	0.068	0.3038	-0.0015	-0.0458	0.2787	0.001	0.2676	-39.3444	-6.3061	-19.9766
4	6.5492	0.7029	0.441	3.2075	3.7602	4.5315	-0.5327	1.2839	0.751	-0.3864	-0.3305	-0.1389	-1.6452	0.1476	0.8651	0.7503	-0.1683	0.0813	0.6539	0.175	0.7473	-29.0932	14.2629	-35.06
5	0.8717	0.1545	0.3218	2.4031	0.5425	0.2828	-0.0088	0.1445	0.0485	-0.0968	0.0407	0.0586	-0.1885	-0.0029	-0.0188	0.3463	0.0211	-0.0014	0.3187	0.0247	0.2693	-49.4016	-9.6188	-22.9413
6	0.2831	-0.0074	0.4003	2.0389	0.4553	0.8401	-0.0532	0.2711	-0.0964	-0.1603	-0.0796	0.111	-0.0573	-0.0666	0.1354	0.3071	-0.0005	-0.0418	0.4224	-0.0199	0.317	-47.6335	-32.5447	-33.0257
7	1.5432	-0.8503	-1.0038	1.6613	0.6794	1.4498	-0.0664	-0.1079	-0.2121	-0.0038	-0.0466	0.3215	0.0686	-0.0352	0.1086	0.2968	-0.0516	-0.0507	0.3214	-0.044	0.3812	-38.0443	-54.0067	-29.88
8	2.0424	-0.0514	-0.2639	2.2949	-0.0833	1.9137	-0.0109	0.2101	-0.0529	-0.4077	0.0247	-0.0809	0.0811	0.003	-0.0095	0.3501	-0.0117	0.0084	0.2869	-0.0624	0.3404	-24.5971	-59.3218	-44.8892
9	2.1657	0.748	0.7711	6.5898	-4.748	4.2354	-0.3217	0.6254	0.8325	0.4336	-0.4834	-1.3253	-0.4366	1.1893	0.829	0.4583	-0.0789	-0.1027	0.7908	0.0887	0.9515	-10.3547	-15.6055	-7.5104
10	4.0865	-1.0551	0.4503	3.0851	0.0696	2.0727	-0.0676	-0.199	-0.3152	0.3625	0.0322	-0.0757	0.0336	-0.0415	0.0462	0.3297	-0.0013	-0.0312	0.2802	0.0098	0.2668	-30.8201	-22.5093	-6.8446
11	5.3942	-1.0544	-1.2376	5.9675	4.0565	2.8371	1.0232	-0.0189	0.079	0.4767	-0.2578	-0.822	0.6557	1.2677	-0.6643	0.6187	-0.0719	-0.0079	0.8819	-0.0335	1.0928	-11.0341	-22.3897	-10.6097
12	1.2024	-1.1666	0.632	1.1792	-0.7268	0.775	0.0029	-0.3303	0.2314	0.1205	-0.0521	-0.1998	-0.0606	0.0925	0.0352	0.4263	-0.0222	-0.085	0.4414	-0.0375	0.4323	-23.0856	-23.7476	-2.6836
13	1.9957	0.9281	-0.5822	4.3193	-0.9469	2.0517	0.1367	-0.4781	0.2086	0.7244	-0.3338	0.0614	-0.0679	-0.0685	0.2205	0.5043	-0.0879	-0.0751	0.5228	0.01	0.3873	-13.5904	-36.2012	10.3776
14	3.7363	-1.3682	-0.6662	3.499	4.8137	7.8751	0.1074	-0.3114	0.0534	0.4809	0.0798	0.9311	0.5394	-0.1806	-0.2563	0.8832	-0.1998	0.1686	0.6834	-0.0266	0.727	-19.183	-41.5941	8.9455
15	2.3964	2.5376	1.9316	3.897	1.7247	1.9634	0.3956	-0.1686	-0.2186	0.2612	-0.1777	-0.524	0.1742	0.227	-0.2349	0.3507	-0.0185	-0.0068	0.4632	-0.0271	0.5105	-10.8194	-66.0075	-23.9669
16	4.2327	0.023	0.5425	3.439	0.536	2.5445	-0.0396	0.163	-0.0812	-0.0637	0.0461	0.0803	-0.0089	-0.0937	0.0013	0.3565	-0.0136	-0.0066	0.3658	0.0191	0.376	-22.9473	-45.4068	-14.5853
17	3.113	3.6591	2.0349	4.5437	3.1661	6.0327	-0.3988	0.7123	0.429	-0.3254	0.617	-0.0789	-0.0766	0.6285	-0.2231	0.5009	0.0126	0.0002	0.5189	0.1532	0.9493	-8.8068	-41.6247	-43.2494
18	4.9955	0.4249	-0.3592	4.6197	-1.2632	1.4704	-0.3219	0.159	0.5794	0.7204	0.1506	0.3251	0.0553	-0.2525	0.1445	0.636	0.0349	0.0234	0.5768	-0.036	0.6794	-23.3028	-39.2647	-37.1001
19	2.0151	1.3301	0.941	9.6491	3.4413	4.0033	0.2238	0.558	1.0949	0.9368	-0.84	0.3574	-1.2048	0.4493	0.5453	0.9103	0.0067	-0.0612	0.5202	-0.0067	0.846	-26.6822	-23.3279	-34.6161
20	4.8697	-1.009	0.2015	6.3487	2.0583	6.9587	0.7206	0.461	0.1047	-0.7927	-0.0133	-0.4205	0.0198	-0.168	-0.5896	0.53	0.1181	-0.0012	0.5253	-0.0247	0.3884	-43.1299	-15.0392	-35.6549
21	7.6623	2.0437	-3.0459	3.0736	-4.1351	6.1128	0.4771	0.6651	-0.0994	-1.4967	-0.5992	0.246	-0.199	0.4639	0.1055	0.7706	0.0407	0.0929	0.5599	-0.0291	0.4884	-34.926	-5.0392	-34.3993
22	0.3283	-0.1604	0.2002	4.1034	2.2976	3.3225	-0.0884	0.4455	-0.1339	-0.7901	-0.4172	-0.258	-0.2151	-0.3572	0.4703	0.505	0.0203	0.1084	0.4676	-0.0239	0.3904	-38.1512	-19.9922	-29.8038
23	4.8132	-3.9413	-0.9605	6.8693	-0.9622	2.6095	0.0671	0.8839	0.4867	0.54	-0.5074	-1.3105	-0.087	0.2249	0.401	0.5841	0.0499	-0.086	0.6566	-0.0633	0.7125	-21.4799	-33.5123	-37.7778
24	9.2273	-6.3977	-1.9886	7.4062	4.5708	3.9385	-1.0449	1.6019	-0.1144	0.8052	0.8127	1.1357	0.7924	-0.3904	0.2658	0.4607	-0.0419	0.0487	0.7561	0.0421	0.7187	-5.7733	-50.9849	-43.6587

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 1:62 )	A	1 - 62
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 63:79 )	A	63 - 79
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 80:125 )	A	80 - 125
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 126:142 )	A	126 - 142
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 143:277 )	A	143 - 277
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 278:387 )	A	278 - 387
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 388:448 )	A	388 - 448
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND RESID 449:555 )	A	449 - 555
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN B AND RESID 6:16 )	B	6 - 16
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN B AND RESID 17:82 )	B	17 - 82
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN B AND RESID 83:87 )	B	83 - 87
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN B AND RESID 96:153 )	B	96 - 153
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN B AND RESID 154:204 )	B	154 - 204
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN B AND RESID 205:240 )	B	205 - 240
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN B AND RESID 241:324 )	B	241 - 324
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN B AND RESID 325:429 )	B	325 - 429
17	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN P AND RESID 805:808 )	P	805 - 808
18	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN P AND RESID 809:812 )	P	809 - 812
19	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN P AND RESID 813:816 )	P	813 - 816
20	X-RAY DIFFRACTION	20	( CHAIN P AND RESID 818:821 )	P	818 - 821
21	X-RAY DIFFRACTION	21	( CHAIN T AND RESID 704:707 )	T	704 - 707
22	X-RAY DIFFRACTION	22	( CHAIN T AND RESID 708:711 )	T	708 - 711
23	X-RAY DIFFRACTION	23	( CHAIN T AND RESID 712:721 )	T	712 - 721
24	X-RAY DIFFRACTION	24	( CHAIN T AND RESID 722:725 )	T	722 - 725

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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