- PDB-6nlr: Crystal structure of the putative histidinol phosphatase hisK fro... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 6nlr
タイトル
Crystal structure of the putative histidinol phosphatase hisK from Listeria monocytogenes with trinuclear metals determined by PIXE revealing sulphate ion in active site. Based on PIXE analysis and original date from 3DCP
THIS ENTRY 6NLR REFLECTS AN ALTERNATIVE MODELING OF THE ORIGINAL DATA IN 3DCP, DETERMINED BY S.M. ...THIS ENTRY 6NLR REFLECTS AN ALTERNATIVE MODELING OF THE ORIGINAL DATA IN 3DCP, DETERMINED BY S.M.VOROBIEV,M.SU,J.SEETHARAMAN,L.ZHAO,L.MAO,E.L.FOOTE,R.XIAO,R.NAIR,M.C.BARAN,T.B.ACTON,B.ROST,G.T.MONTELIONE,J.F.HUNT,L.TONG,NORTHEAST STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM (NESG)
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97931 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.1→41.6 Å / Num. obs: 114574 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(F): 2 / 冗長度: 3.9 % / Rmerge(I) obs: 0.106 / Net I/σ(I): 23.6
反射 シェル
解像度: 2.1→2.18 Å / 冗長度: 3.8 % / Rmerge(I) obs: 0.272 / Mean I/σ(I) obs: 4.4 / Num. unique obs: 12134 / % possible all: 98.4
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0241
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
SHELXDE
位相決定
RESOLVE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 2.1→41.6 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.967 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.956 / SU B: 7.658 / SU ML: 0.107 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.173 / ESU R Free: 0.144 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.18583
2868
4.9 %
RANDOM
Rwork
0.15488
-
-
-
obs
0.15638
55392
98.4 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.7 Å / 減衰半径: 0.7 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: MASK