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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6l99 | ||||||
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タイトル | Zinc finger of RING finger protein 144A | ||||||
![]() | E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A | ||||||
![]() | METAL BINDING PROTEIN / RING finger protein 144A / Zinc Finger | ||||||
機能・相同性 | ![]() RBR-type E3 ubiquitin transferase / protein K6-linked ubiquitination / ubiquitin conjugating enzyme binding / pattern recognition receptor signaling pathway / ubiquitin ligase complex / protein polyubiquitination / ubiquitin protein ligase activity / E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins / ubiquitin-dependent protein catabolic process / endosome membrane ...RBR-type E3 ubiquitin transferase / protein K6-linked ubiquitination / ubiquitin conjugating enzyme binding / pattern recognition receptor signaling pathway / ubiquitin ligase complex / protein polyubiquitination / ubiquitin protein ligase activity / E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins / ubiquitin-dependent protein catabolic process / endosome membrane / protein ubiquitination / intracellular membrane-bounded organelle / endoplasmic reticulum membrane / Golgi apparatus / zinc ion binding / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Miyamoto, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Zinc finger of RING finger protein 144A 著者: Miyamoto, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 439.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 367.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8212.658 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() | ||
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#2: 化合物 | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | Sample state: isotropic / タイプ: NOESY |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution / 内容: 1 mM [U-13C; U-15N] RNF, 90% H2O/10% D2O / Label: RNF / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 1 mM / 構成要素: RNF / Isotopic labeling: [U-13C; U-15N] |
試料状態 | 詳細: 1 mM U 13C; 15N RNF, 90% H2O/10% D2O / イオン強度: 20 mM / Label: conditions_1 / pH: 6.8 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 2 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |