登録情報 | データベース: PDB / ID: 6kcq |
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タイトル | Crystal structure of yedK with ssDNA containing an abasic site |
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要素 | - DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*(PED)P*AP*A)-3')
- SOS response-associated protein
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN / DNA repair / abasic site |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
protein-DNA covalent cross-linking activity / : / 付加脱離酵素(リアーゼ) / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素 / SOS response / peptidase activity / single-stranded DNA binding / DNA damage response / proteolysis類似検索 - 分子機能 SOS response associated peptidase-like / hypothetical protein yedk fold / SOS response associated peptidase (SRAP) / SOS response associated peptidase-like / SOS response associated peptidase (SRAP) / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Abasic site processing protein / Abasic site processing protein YedK類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.701 Å |
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データ登録者 | Wang, N. / Bao, H. / Huang, H. |
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資金援助 | 中国, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Ministry of Science and Technology (China) | 2018YFC1004500 | 中国 | National Natural Science Foundation of China | the Thousand Young Talents Program | 中国 | National Natural Science Foundation of China | 31800619 | 中国 |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2019 タイトル: Molecular basis of abasic site sensing in single-stranded DNA by the SRAP domain of E. coli yedK. 著者: Wang, N. / Bao, H. / Chen, L. / Liu, Y. / Li, Y. / Wu, B. / Huang, H. |
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履歴 | 登録 | 2019年6月28日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2019年7月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年1月22日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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