登録情報 | データベース: PDB / ID: 6iyv |
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タイトル | Crystal sturucture of L,D-transpeptidase LdtMt2 from Mycobacterium tuberculosis in complex with ertapenem adduct |
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要素 | L,D-transpeptidase 2 |
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キーワード | TRANSFERASE / LD-TRANSPEPTIDASE / PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS ENZYME / beta-lactam binding |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
peptidoglycan-protein cross-linking / peptidoglycan L,D-transpeptidase activity / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの / acyltransferase activity / cell wall organization / regulation of cell shape / metal ion binding / plasma membrane類似検索 - 分子機能 Immunoglobulin-like - #3710 / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Bacterial Ig domain, transpeptidase-associated / Bacterial Ig domain / : / L,D-transpeptidase (L,D-TPase) catalytic domain profile. / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain-like ...Immunoglobulin-like - #3710 / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Bacterial Ig domain, transpeptidase-associated / Bacterial Ig domain / : / L,D-transpeptidase (L,D-TPase) catalytic domain profile. / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Immunoglobulin-like / Beta Barrel / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-2RG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / L,D-transpeptidase 2類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Mycobacterium tuberculosis (結核菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.5 Å |
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データ登録者 | Zhao, F. / Li, D.F. / Wang, D.C. |
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引用 | ジャーナル: Biochem. Biophys. Res. Commun. / 年: 2019 タイトル: The 1-beta-methyl group confers a lower affinity of l,d-transpeptidase LdtMt2for ertapenem than for imipenem. 著者: Zhao, F. / Hou, Y.J. / Zhang, Y. / Wang, D.C. / Li, D.F. |
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履歴 | 登録 | 2018年12月17日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2019年2月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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