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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6h24 | ||||||
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タイトル | X-Ray Crystal Structure of the MSBI1.176 WH1 Domain, a Replication Protein Isolated from a Multiple Sclerosis Patient | ||||||
![]() | Replication protein![]() | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | Initiator Rep protein / Initiator Replication protein, WH1 / DNA replication initiation / Winged helix DNA-binding domain superfamily / ![]() ![]() ![]() | ||||||
生物種 | Sphinx1.76-related DNA (その他) | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kilic, T. / Popov, A.N. / Hansman, G.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural analysis of a replication protein encoded by a plasmid isolated from a multiple sclerosis patient. 著者: Kilic, T. / Popov, A.N. / Burk-Korner, A. / Koromyslova, A. / Zur Hausen, H. / Bund, T. / Hansman, G.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 158.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 128 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 15454.439 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sphinx1.76-related DNA (その他) / 遺伝子: Rep / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.94 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.64 % |
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結晶化![]() | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 0.2 M magnesium acetate, 20% PEG3350 |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 1.53→40.65 Å / Num. obs: 35709 / % possible obs: 99.42 % / 冗長度: 6.4 % / Biso Wilson estimate: 22.19 Å2 / CC1/2: 1 / Rmerge(I) obs: 0.04087 / Rpim(I) all: 0.0173 / Rrim(I) all: 0.04446 / Net I/σ(I): 20.91 | ||||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 1.53→1.58 Å / Rmerge(I) obs: 0.6848 / Mean I/σ(I) obs: 1.98 / Num. unique obs: 3473 / CC1/2: 0.85 / Rpim(I) all: 0.2973 / Rrim(I) all: 0.7487 / % possible all: 96.93 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.53→40.65 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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