登録情報 | データベース: PDB / ID: 6fxj |
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タイトル | Structure of coproheme decarboxylase from Listeria monocytogenes in complex with iron coproporphyrin III |
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要素 | Putative heme-dependent peroxidase lmo2113 |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / coproheme binding / coproheme decarboxylase / pentamer |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
hydrogen peroxide-dependent heme synthase / heme biosynthetic process / peroxidase activity / heme binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Apc35880; domain 1 / Coproheme decarboxylase / Heme-dependent peroxidase ChdC/CLD / Chlorite dismutase / Dimeric alpha-beta barrel / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-FEC / N-PROPANOL / Coproheme decarboxylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Listeria monocytogenes EGD-e (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.79 Å |
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データ登録者 | Hofbauer, S. / Pfanzagl, V. / Mlynek, G. |
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資金援助 | オーストリア, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Austrian Science Fund | P29099 | オーストリア |
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引用 | ジャーナル: Acs Catalysis / 年: 2019 タイトル: Redox Cofactor Rotates during Its Stepwise Decarboxylation: Molecular Mechanism of Conversion of Coproheme to Hemeb. 著者: Milazzo, L. / Gabler, T. / Puhringer, D. / Jandova, Z. / Maresch, D. / Michlits, H. / Pfanzagl, V. / Djinovic-Carugo, K. / Oostenbrink, C. / Furtmuller, P.G. / Obinger, C. / Smulevich, G. / Hofbauer, S. |
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履歴 | 登録 | 2018年3月9日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2019年7月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年8月28日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2024年1月17日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id |
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