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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6d8t | ||||||
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タイトル | NMR solution structure of tamapin, mutant E25K/K27E | ||||||
![]() | Potassium channel toxin alpha-KTx 5.4 | ||||||
![]() | TOXIN / Tamapin mutant / E25K/K27E / CSalpha/beta / SK channels | ||||||
機能・相同性 | Scorpion short toxins signature. / Scorpion short chain toxin, potassium channel inhibitor / Scorpion short toxin, BmKK2 / Knottin, scorpion toxin-like superfamily / ion channel inhibitor activity / potassium channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / Potassium channel toxin alpha-KTx 5.4![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
![]() | del Rio Portilla, F. / Melchor Meneses, C.M. / Titaux Delgado, G.A. / Mayorga Flores, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Novel Blocker of Onco SK3 Channels Derived from Scorpion Toxin Tamapin and Active against Migration of Cancer Cells 著者: Flores, M. / Chantome, A. / Melchor-Meneses, C.M. / Domingo, I. / Titaux Delgado, G.A. / Galindo-Murillo, R. / Vandier, C. / del Rio Portilla, F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 187 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 160.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 367.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 465.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 18.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6d3tC ![]() 6d8hC ![]() 6d8qC ![]() 6d8rC ![]() 6d8sC ![]() 6d8uC ![]() 6d8yC ![]() 6d93C ![]() 6d9oC ![]() 6d9pC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3470.186 Da / 分子数: 1 / 変異: E25K, K27E / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 2.0 mM Potassium channel toxin alpha-KTx 5.4, 95% H2O/5% D2O Label: 1H_sample / 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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試料 | 濃度: 2.0 mM / 構成要素: Potassium channel toxin alpha-KTx 5.4 / Isotopic labeling: natural abundance |
試料状態 | イオン強度: 0 Not defined / Label: 1 / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 / 詳細: used also for simulated annealing | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |