PDB-6czp: 2.2 Angstrom Resolution Crystal Structure Oxygen-Insensitive NAD(...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6czp

タイトル

2.2 Angstrom Resolution Crystal Structure Oxygen-Insensitive NAD(P)H-dependent Nitroreductase NfsB from Vibrio vulnificus in Complex with FMN

要素

Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / Structural Genomics / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID / oxygen-insensitive nitroreductase

機能・相同性

機能・相同性情報

oxidoreductase activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Vibrio vulnificus (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.24 Å

データ登録者

Minasov, G. / Wawrzak, Z. / Skarina, T. / Grimshaw, S. / Kwon, K. / Savchenko, A. / Satchell, K.J.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: 2.2 Angstrom Resolution Crystal Structure Oxygen-Insensitive NAD(P)H-dependent Nitroreductase NfsB from Vibrio vulnificus in Complex with FMN.
著者: Minasov, G. / Wawrzak, Z. / Skarina, T. / Grimshaw, S. / Kwon, K. / Savchenko, A. / Satchell, K.J.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

履歴

登録	2018年4月9日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年4月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6czp.cif.gz	712 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6czp.ent.gz	591.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6czp.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6czp_validation.pdf.gz	2.9 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6czp_full_validation.pdf.gz	2.9 MB	表示
XML形式データ	6czp_validation.xml.gz	70.6 KB	表示
CIF形式データ	6czp_validation.cif.gz	94.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cz/6czp ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cz/6czp	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	1icrS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1oo5-d 1v5y-d 3x21-4 1kqb-1 1kqd-1 1oo6-d 1icu-2 1oon-d 1nec-1 1icv-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: CSGID-IDP07377

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

B: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

C: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

D: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

E: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

F: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

G: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

H: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

ヘテロ分子

201 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

B: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: homology
50.1 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

D: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
50.2 kDa, 2 ポリマー
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3

E: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

F: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
50.1 kDa, 2 ポリマー
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4

G: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

H: Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
50.3 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	118.769, 119.659, 131.175
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 1種, 8分子 ABCDEFGH

#1: タンパク質	Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase 分子量: 24481.701 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Vibrio vulnificus (バクテリア) / 遺伝子: FORC36_4330 / プラスミド: pMCSG53 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)-Magic / 参照: UniProt: A0A1W6MCC0, UniProt: Q7MCD2*PLUS

#1: タンパク質

Oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase

分子量: 24481.701 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Vibrio vulnificus (バクテリア) / 遺伝子: FORC36_4330 / プラスミド: pMCSG53 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)-Magic / 参照: UniProt: A0A1W6MCC0, UniProt: Q7MCD2*PLUS

-
非ポリマー , 6種, 647分子

#2: 化合物	ChemComp-FMN / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / RIBOFLAVIN MONOPHOSPHATE / FMN 分子量: 456.344 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₇H₂₁N₄O₉P
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#5: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#6: 化合物	ChemComp-PGE / TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル分子量: 150.173 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₄
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 627 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.35 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.8 %
結晶化	温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: Protein: 17.0 mg/ml, 0.3M Sodium chloride, 0.01M HEPES pH 7.5, Screen: 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris pH 8.5, 25% (w/v) PEG3350, Cryo: paratone

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 21-ID-F / 波長: 0.97872 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2018年3月14日 / 詳細: C(111)
放射	モノクロメーター: Be / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97872 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→30 Å / Num. obs: 88464 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 7.8 % / B_iso Wilson estimate: 48.5 Å² / R_merge(I) obs: 0.129 / R_pim(I) all: 0.048 / R_rim(I) all: 0.138 / R_sym value: 0.129 / Χ²: 1.02 / Net I/σ(I): 38.3
反射シェル	解像度: 2.2→2.24 Å / 冗長度: 7.3 % / R_merge(I) obs: 0.768 / Mean I/σ(I) obs: 3.1 / Num. unique obs: 4360 / CC_1/2: 0.852 / R_pim(I) all: 0.3 / R_rim(I) all: 0.826 / R_sym value: 0.768 / Χ²: 1.025 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0222	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1ICR

1icr

解像度: 2.24→29.91 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.96 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.937 / SU B: 12.513 / SU ML: 0.158 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.311 / ESU R Free: 0.215 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.22392	4434	5 %	RANDOM
R_work	0.17733	-	-	-
obs	0.17962	83952	97.58 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 49.134 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-1.72 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	3.56 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.84 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 2.24→29.91 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13691	0	320	627	14638

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.007	0.015	14335
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.017	12899
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.249	1.747	19356
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.438	1.732	30137
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	2.165	5	1746
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	18.525	18.547	475
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	9.108	15	2019
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	12.85	15	80
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.052	0.2	1825
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.022	0.02	16058
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.019	0.02	2754
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.592	2.851	6996
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	1.592	2.852	6997
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.458	4.268	8738
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	2.458	4.269	8739
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.136	3.215	7339
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	2.136	3.215	7339
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	3.343	4.723	10619
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	6.633	36.795	17018
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	6.606	36.652	16937
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.239→2.296 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.298	207	-
R_work	0.237	4278	-
obs	-	-	68.02 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.098	0.2539	-1.2119	1.1782	-0.2231	1.8857	-0.0484	0.1953	0.0257	-0.1941	0.0894	-0.1198	0.1253	-0.0177	-0.041	0.0877	0.0121	0.0267	0.0482	-0.0191	0.0412	16.278	39.2739	24.1432
2	9.943	-4.1746	-2.6406	5.9311	-0.4063	1.4301	-0.2627	-0.41	-0.4866	-0.0339	0.2848	-0.1308	0.2667	0.1218	-0.0222	0.3863	0.0707	-0.0298	0.04	-0.0629	0.5425	15.7494	11.6549	33.7818
3	2.2471	0.7318	-1.1447	1.3198	-0.5949	1.6859	-0.0887	0.1463	-0.0971	-0.0987	0.0695	-0.0467	0.1384	-0.0281	0.0192	0.1043	0.0046	0.019	0.0299	-0.0373	0.0641	10.3489	35.9513	30.2747
4	1.8998	-0.6885	0.2055	5.1918	-4.0568	9.6207	-0.0668	-0.1012	0.234	0.338	0.1167	-0.7158	-0.9984	0.1283	-0.05	0.1135	-0.0377	0.0261	0.13	-0.0793	0.1751	23.6703	51.5865	40.9502
5	1.3547	-0.5989	0.9812	2.4208	-1.0572	3.8899	0.4074	0.3476	0.0088	-0.3161	-0.094	-0.5916	1.1587	1.2944	-0.3134	0.431	0.2899	-0.0776	0.688	-0.0361	0.6211	33.2053	27.9957	37.9835
6	1.7862	-0.0592	-0.2957	3.1667	-0.3534	1.9338	-0.0178	-0.3993	-0.1642	0.1336	0.0709	-0.5403	0.0691	0.3838	-0.0531	0.1036	0.0097	-0.0526	0.1706	-0.0031	0.1295	19.8246	42.2297	47.2416
7	2.3031	-0.1751	0.0586	1.9261	-0.1876	1.3706	-0.0059	-0.2791	-0.4324	0.2274	0.004	-0.3713	0.1451	0.2809	0.0019	0.1495	0.0276	-0.0371	0.1362	0.0336	0.175	16.9687	34.4073	45.8135
8	3.5709	-2.6878	1.7618	4.7059	-3.5221	5.52	-0.262	0.1779	-0.3044	-0.4778	-0.0844	-0.5366	0.4837	0.3605	0.3464	0.231	0.016	0.1713	0.0791	-0.0731	0.2976	21.0256	22.245	26.7425
9	1.7587	-1.9894	1.0563	2.4495	-1.4694	4.0614	0.2144	0.0221	-0.497	-0.2331	-0.1005	0.8308	0.1691	-0.3704	-0.1139	0.077	0.0017	-0.0034	0.3087	-0.1328	0.6302	-34.6253	36.8502	46.672
10	1.9845	-0.2642	0.2126	1.4826	0.1464	1.3947	0.103	-0.0692	0.1044	0.2314	-0.1692	0.2793	-0.0795	-0.0891	0.0662	0.156	-0.0232	0.076	0.0624	-0.0245	0.0767	-15.2725	41.7998	53.4871
11	5.8038	-0.5141	1.2565	0.7197	-0.7811	0.9622	0.1367	-0.0562	0.3231	0.2052	-0.1705	0.0618	-0.2037	0.1178	0.0338	0.208	0.0138	0.0712	0.1723	-0.0702	0.214	-20.3829	45.4934	46.9272
12	3.728	-1.0184	0.5681	2.1284	-0.7721	4.0224	0.0581	0.0238	-0.0407	-0.3926	-0.0183	0.3035	0.34	-0.7736	-0.0397	0.16	-0.0662	-0.0382	0.2535	-0.1331	0.2589	-27.9843	24.7621	38.0761
13	2.8441	-0.1691	1.3616	8.6753	-5.5314	4.1394	-0.355	-0.8463	0.3266	0.9297	0.4488	0.4193	-0.5943	-0.7689	-0.0938	0.5392	-0.0048	0.1755	0.6796	0.0276	0.2107	-25.8854	29.167	63.8935
14	1.5793	-0.0643	0.3345	1.9688	-0.6733	3.4182	0.0249	-0.0852	-0.5515	0.051	-0.1707	0.2586	0.5592	-0.3017	0.1458	0.2158	-0.1018	0.0578	0.0681	-0.0277	0.2584	-18.5142	18.7006	48.257
15	3.0581	0.6177	-0.1978	2.2445	-0.7681	2.3165	0.0131	-0.1248	-0.2646	0.1078	-0.0611	0.322	0.2883	-0.2193	0.048	0.1207	-0.022	0.0449	0.0393	-0.0139	0.1021	-14.4041	25.477	46.1557
16	1.8972	1.8703	-1.7223	5.3285	-5.7394	6.2817	-0.1744	-0.4851	-0.0341	0.1019	-0.0416	-0.1725	-0.1176	-0.1337	0.216	0.3449	-0.0395	0.1533	0.3133	-0.0722	0.1415	-19.041	40.4567	65.359
17	0.9887	0.1701	-0.3087	1.6198	-0.8106	1.6987	0.0831	-0.1498	-0.0274	0.2225	-0.1744	-0.0932	0.009	0.2688	0.0914	0.1178	0.032	-0.0187	0.0894	0.0142	0.0151	-6.0813	15.1224	8.0329
18	2.3119	1.1655	-1.1721	2.3648	-1.2994	1.8232	0.0641	-0.0087	-0.2026	-0.0247	-0.3184	-0.4528	0.2389	0.5194	0.2543	0.1064	0.1231	-0.025	0.2929	0.1033	0.1455	9.9841	17.0543	-3.0841
19	0.7965	-0.231	-0.4013	2.5883	-0.6854	2.2104	0.1123	-0.0672	0.0338	0.3647	-0.0054	0.0438	-0.0908	0.1027	-0.1069	0.1225	0.0144	-0.0104	0.0674	-0.006	0.019	-8.4995	21.3628	7.4448
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31	1.1485	-0.4384	0.4607	1.9981	0.7569	1.0239	-0.0117	0.3322	0.246	-0.3222	-0.0664	0.0113	-0.0124	0.2041	0.0781	0.2311	0.0289	0.0139	0.3467	0.1138	0.1182	-2.0858	39.3515	-28.7116
32	1.3377	0.1775	0.4662	1.101	-0.0146	0.9169	-0.118	-0.0021	0.4007	-0.0551	-0.0274	0.0929	-0.1313	-0.073	0.1454	0.0715	0.0428	-0.0257	0.1454	0.034	0.1316	-5.8381	50.7843	-12.7647

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	-1 - 95
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	96 - 124
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	125 - 195
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	196 - 217
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	0 - 24
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	25 - 124
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	125 - 197
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	198 - 217
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	-1 - 25
10	X-RAY DIFFRACTION	10	C	26 - 179
11	X-RAY DIFFRACTION	11	C	180 - 195
12	X-RAY DIFFRACTION	12	C	196 - 217
13	X-RAY DIFFRACTION	13	D	0 - 17
14	X-RAY DIFFRACTION	14	D	18 - 109
15	X-RAY DIFFRACTION	15	D	110 - 198
16	X-RAY DIFFRACTION	16	D	199 - 217
17	X-RAY DIFFRACTION	17	E	-1 - 99
18	X-RAY DIFFRACTION	18	E	100 - 156
19	X-RAY DIFFRACTION	19	E	157 - 195
20	X-RAY DIFFRACTION	20	E	196 - 217
21	X-RAY DIFFRACTION	21	F	0 - 36
22	X-RAY DIFFRACTION	22	F	37 - 179
23	X-RAY DIFFRACTION	23	F	180 - 195
24	X-RAY DIFFRACTION	24	F	196 - 217
25	X-RAY DIFFRACTION	25	G	1 - 98
26	X-RAY DIFFRACTION	26	G	99 - 124
27	X-RAY DIFFRACTION	27	G	125 - 197
28	X-RAY DIFFRACTION	28	G	198 - 217
29	X-RAY DIFFRACTION	29	H	0 - 24
30	X-RAY DIFFRACTION	30	H	25 - 99
31	X-RAY DIFFRACTION	31	H	100 - 163
32	X-RAY DIFFRACTION	32	H	164 - 217

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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