+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6c2f | ||||||
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Title | MBD2 in complex with methylated DNA | ||||||
Components |
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Keywords | DNA BINDING PROTEIN/DNA / methylated dna / dna binding / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex | ||||||
Function / homology | Function and homology information satellite DNA binding / NuRD complex / DNA methylation-dependent heterochromatin formation / methyl-CpG binding / C2H2 zinc finger domain binding / RNA Polymerase I Promoter Opening / NoRC negatively regulates rRNA expression / molecular adaptor activity / chromatin remodeling / protein domain specific binding ...satellite DNA binding / NuRD complex / DNA methylation-dependent heterochromatin formation / methyl-CpG binding / C2H2 zinc finger domain binding / RNA Polymerase I Promoter Opening / NoRC negatively regulates rRNA expression / molecular adaptor activity / chromatin remodeling / protein domain specific binding / negative regulation of DNA-templated transcription / chromatin / positive regulation of DNA-templated transcription / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / protein-containing complex / nucleoplasm / nucleus / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) synthetic construct (others) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.65 Å | ||||||
Authors | Liu, K. / Xu, C. / Tempel, W. / Arrowsmith, C.H. / Bountra, C. / Edwards, A.M. / Min, J. / Structural Genomics Consortium / Structural Genomics Consortium (SGC) | ||||||
Citation | Journal: to be published Title: MBD2 in complex with methylated DNA Authors: Liu, K. / Xu, C. / Tempel, W. / Arrowsmith, C.H. / Bountra, C. / Edwards, A.M. / Min, J. / Structural Genomics Consortium | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6c2f.cif.gz | 323.8 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6c2f.ent.gz | 258.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6c2f.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c2/6c2f ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c2/6c2f | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 6c2e S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
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