登録情報 | データベース: PDB / ID: 5u5m |
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF I83E MEDITOPE-ENABLED TRASTUZUMAB WITH AZIDO-MEDITOPE |
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要素 | - (MEMAB TRASTUZUMAB, ...) x 2
- AZIDO-PEG4-MEDITOPE
- Immunoglobulin G binding protein A
- Protein L
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キーワード | IMMUNE SYSTEM / ANTIBODY / ANTIBODY-DRUG CONJUGATES |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
IgG binding / immunoglobulin binding / extracellular region類似検索 - 分子機能 Protein G-related albumin-binding (GA) module / Extracellular matrix-binding protein ebh, GA module / GA module / GA module / Protein L, Ig light chain-binding / Protein L b1 domain / Repeat of unknown function DUF5633 / Family of unknown function (DUF5633) / Octapeptide repeat / Octapeptide repeat ...Protein G-related albumin-binding (GA) module / Extracellular matrix-binding protein ebh, GA module / GA module / GA module / Protein L, Ig light chain-binding / Protein L b1 domain / Repeat of unknown function DUF5633 / Family of unknown function (DUF5633) / Octapeptide repeat / Octapeptide repeat / Immunoglobulin FC, subunit C / Protein A, Ig-binding domain / B domain / Ubiquitin-like (UB roll) - #10 / GA-like domain / GA-like domain / Lysin motif / LysM domain superfamily / LysM domain / LysM domain profile. / LysM domain / Immunoglobulin/albumin-binding domain superfamily / YSIRK type signal peptide / YSIRK Gram-positive signal peptide / LPXTG cell wall anchor motif / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. / LPXTG cell wall anchor domain / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Ubiquitin-like (UB roll) / Immunoglobulins / Roll / Up-down Bundle / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 MESO-ERYTHRITOL / Immunoglobulin G-binding protein A / Immunoglobulin G binding protein A / Protein L類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト)
Finegoldia magna (バクテリア)
![](img/tx_bacteria.gif) Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.88 Å |
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データ登録者 | Williams, J.C. / Bzymek, K.P. / Pucket, J. / Avery, K.A. / Ma, Y. / Xie, J. / Zer, C. / Horne, D. |
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Crystal Structure Of I83E Meditope-Enabled Trastuzumab With Azido-Meditope 著者: Williams, J.C. / Bzymek, K.P. / Pucket, J. / Avery, K.A. / Ma, Y. / Xie, J. / Zer, C. / Horne, D. |
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履歴 | 登録 | 2016年12月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2018年3月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年3月28日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: entity / entity_src_gen ...entity / entity_src_gen / pdbx_entity_src_syn / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_prop / struct_ref / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _entity.pdbx_fragment / _entity_src_gen.gene_src_common_name ..._entity.pdbx_fragment / _entity_src_gen.gene_src_common_name / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num / _pdbx_struct_assembly.details / _pdbx_struct_assembly.method_details / _struct_ref.db_code / _struct_ref.pdbx_align_begin / _struct_ref.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code |
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改定 1.2 | 2018年4月18日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_detector / Item: _diffrn_detector.detector |
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改定 1.3 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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改定 1.4 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / Derived calculations / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / struct_conn Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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