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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5odf | ||||||||||||||||||||
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タイトル | NtMe polyamide in complex with 5'CGATGTACATCG3'- hairpin polyamides studies | ||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA BINDING PROTEIN / DNA / Minor groove binders / Hairpin polyamides | 機能・相同性 | NtMe polyamide / DNA / DNA (> 10) | ![]() 生物種 | ![]() 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ![]() Padroni, G. / Parkinson, J. / Burley, G.A. | ![]() ![]() タイトル: Structural basis of DNA duplex distortion induced by thiazole-containing hairpin polyamides. 著者: Padroni, G. / Parkinson, J.A. / Fox, K.R. / Burley, G.A. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 190.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 154.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 533 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 730.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 23.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 30.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 5oczC ![]() 5odmC ![]() 5oe1C C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3582.424 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() #2: 化合物 | ChemComp-CWN / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 100 Phosphate mM / Label: NtMe PA / pH: 7.4 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 3 | ||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: na | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: na / 計算したコンフォーマーの数: 10 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |