PDB-5mdr: Crystal structure of in vitro folded Chitoporin VhChip from Vibri...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5mdr

タイトル

Crystal structure of in vitro folded Chitoporin VhChip from Vibrio harveyi in complex with chitohexaose

要素

Chitoporin

キーワード

SUGAR BINDING PROTEIN / outer membrane protein Vibrio harveyi porin channel

機能・相同性

機能・相同性情報

porin activity / pore complex / cell outer membrane / monoatomic ion transmembrane transport / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Vibrio harveyi (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Zahn, M. / van den Berg, B.

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2018
タイトル: Structural basis for chitin acquisition by marine Vibrio species.
著者: Aunkham, A. / Zahn, M. / Kesireddy, A. / Pothula, K.R. / Schulte, A. / Basle, A. / Kleinekathofer, U. / Suginta, W. / van den Berg, B.

履歴

登録	2016年11月13日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2017年12月20日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年1月24日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.src_method / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年1月17日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
改定 2.2	2024年10月16日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5mdr.cif.gz	849.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5mdr.ent.gz	710.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5mdr.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5mdr_validation.pdf.gz	4.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5mdr_full_validation.pdf.gz	4.3 MB	表示
XML形式データ	5mdr_validation.xml.gz	93.1 KB	表示
CIF形式データ	5mdr_validation.cif.gz	137.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/md/5mdr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/md/5mdr	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5mdoSC 5mdpC 5mdqC 5mdsC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5mds-d 5mdp-d 5mdo-2 5mdq-d 2yda-1 4gcp-1 6rck-d 6zhv-d 3hw9-1 3hwb-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Chitoporin

B: Chitoporin

C: Chitoporin

D: Chitoporin

E: Chitoporin

F: Chitoporin

ヘテロ分子

248 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Chitoporin

B: Chitoporin

C: Chitoporin

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
124 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

D: Chitoporin

E: Chitoporin

F: Chitoporin

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
123 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	146.552, 121.941, 147.155
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 117.92, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: GLU / Beg label comp-ID: GLU / End auth comp-ID: PHE / End label comp-ID: PHE / Refine code: _ / Auth seq-ID: 10 - 350 / Label seq-ID: 12 - 352

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15

#1: タンパク質

Chitoporin

分子量: 39192.863 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Vibrio harveyi (バクテリア) / 遺伝子: chiP / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: L0RVU0

#2: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2- ...

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 1237.172 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1-1-1-1-1/a4-b1_b4-c1_c4-d1_d4-e1_e4-f1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#3: 化合物

ChemComp-C8E / (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE / テトラエチレングリコ-ルモノオクチルエ-テル

分子量: 306.438 Da / 分子数: 15 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₆H₃₄O₅ / コメント: C8E, 可溶化剤*YM

#4: 化合物

ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン

分子量: 22.990 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 1748 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

Has protein modification

Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 30% (w/v) PEG 400, 0.05 M NaCl, 0.1 M sodium citrate pH 5.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I02 / 波長: 1.00727 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年2月6日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.00727 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.9→130.02 Å / Num. obs: 357447 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.062 / R_pim(I) all: 0.056 / Net I/σ(I): 11
反射シェル	解像度: 1.9→1.93 Å / 冗長度: 3.7 % / R_merge(I) obs: 0.682 / Mean I/σ(I) obs: 1.8 / R_pim(I) all: 0.598 / % possible all: 99.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0124	精密化
XDS		データ削減
Aimless		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5MDO

5mdo

解像度: 1.9→130.02 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.959 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.956 / SU B: 4.082 / SU ML: 0.06 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.084 / ESU R Free: 0.08 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1835	3476	1 %	RANDOM
R_work	0.17196	-	-	-
obs	0.17206	353937	99.57 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 34.555 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.36 Å²	-0 Å²	-0.27 Å²
2-	-	1.71 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-0.68 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 1.9→130.02 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	15990	0	729	1748	18467

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.02	17144
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.006	0.02	14930
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.624	1.977	23202
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.113	3	34375
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	8.976	5.063	2051
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.913	24.828	903
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	11.201	15	2240
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	18.198	15	78
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.094	0.2	2329
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.02	19888
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.005	0.02	4206
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.812	1.759	8183
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.812	1.759	8182
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.292	2.632	10220
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	1.291	2.632	10221
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.743	2.353	8961
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	1.743	2.353	8962
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	2.704	3.427	12983
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	7.964	18.458	20808
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	7.964	18.461	20809
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	38154	0.02
1	2	B	38154	0.02
2	1	A	38040	0.03
2	2	C	38040	0.03
3	1	A	37966	0.04
3	2	D	37966	0.04
4	1	A	38208	0.03
4	2	E	38208	0.03
5	1	A	38222	0.02
5	2	F	38222	0.02
6	1	B	37980	0.03
6	2	C	37980	0.03
7	1	B	38082	0.03
7	2	D	38082	0.03
8	1	B	38124	0.03
8	2	E	38124	0.03
9	1	B	38222	0.01
9	2	F	38222	0.01
10	1	C	38072	0.03
10	2	D	38072	0.03
11	1	C	38000	0.04
11	2	E	38000	0.04
12	1	C	38024	0.03
12	2	F	38024	0.03
13	1	D	37912	0.04
13	2	E	37912	0.04
14	1	D	37988	0.03
14	2	F	37988	0.03
15	1	E	38158	0.03
15	2	F	38158	0.03

LS精密化シェル

解像度: 1.9→1.949 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.278	308	-
R_work	0.265	26074	-
obs	-	-	99.4 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.4634	-0.5952	1.4274	6.8654	-4.7345	4.617	0.0546	-0.151	-0.0225	-0.07	-0.0602	-0.2238	0.2036	-0.0273	0.0055	0.3001	0.0048	-0.0097	0.2569	-0.0155	0.3382	-7.3553	-24.6058	58.6711
2	0.8533	-0.1896	0	0.599	-0.3067	1.1727	0.0259	0.1722	-0.0599	-0.1741	-0.0698	-0.0664	0.1489	0.1358	0.0439	0.1101	0.0293	0.0232	0.1387	-0.012	0.0159	-2.731	3.8774	34.4113
3	4.4092	-2.3322	1.2811	2.9578	-0.9833	2.1045	0.3217	-0.0231	-0.5795	-0.2252	-0.0474	0.3464	0.5075	-0.0127	-0.2744	0.1806	-0.0431	-0.037	0.0644	-0.0112	0.0998	-14.8266	-6.54	57.5418
4	1.2715	-0.061	0.1011	0.3741	0.0809	1.0214	0.0123	-0.1331	-0.0041	0.0935	0.0169	0.1588	0.0109	-0.2	-0.0292	0.0716	-0.0115	0.0529	0.1444	0.017	0.0752	-25.0152	5.8605	68.9419
5	4.3148	4.7585	0.0889	10.2013	1.3763	0.5879	0.0693	0.0045	-0.1396	0.2019	-0.0641	0.0748	0.0286	-0.0941	-0.0052	0.301	0.0207	0.01	0.2542	0.0075	0.3121	0.0501	-24.551	56.5474
6	1.0742	0.2035	0.2427	0.3289	-0.0361	1.2832	0.0219	-0.0837	0.0349	0.1361	-0.0758	-0.1258	-0.0284	0.2353	0.0539	0.0849	-0.0061	-0.0405	0.1757	0.043	0.0761	15.3132	7.0204	70.2589
7	1.2989	-0.842	-0.9884	6.4122	2.5399	2.5281	0.0766	-0.1238	0.0233	-0.1191	-0.0362	0.1832	-0.2089	0.0388	-0.0404	0.3039	-0.0142	-0.0056	0.2451	0.0162	0.3286	11.4171	87.5881	25.0884
8	1.0611	-0.0003	0.1717	0.3447	0.0953	1.1317	-0.0056	0.2225	0.011	-0.1427	-0.0135	0.0063	0.0466	0.0515	0.0191	0.1197	0.0125	0.0105	0.147	0.0078	0.0033	6.0146	55.9019	5.3728
9	1.7832	-2.1696	0.6118	11.7612	-3.9214	9.1541	-0.1509	0.0152	0.3518	-0.0336	-0.0234	-0.1974	-0.4744	-0.229	0.1743	0.4278	-0.0107	0.0169	0.2727	-0.0171	0.379	5.9463	87.8496	30.5352
10	1.4171	-0.116	0.1419	0.3892	-0.227	1.0958	0.0322	-0.0459	0.0574	0.052	-0.0907	-0.1908	-0.031	0.2354	0.0585	0.0617	-0.0391	-0.0339	0.1545	0.0224	0.1008	29.1116	59.0411	38.059
11	1.7931	0.4462	-0.0971	3.9177	-3.536	5.6914	-0.0159	-0.079	0.3126	0.3441	-0.1141	-0.0134	-0.6928	0.0521	0.13	0.1075	0.0003	-0.0096	0.102	-0.0696	0.1006	3.2945	68.9825	38.3465
12	0.961	0.2857	-0.0272	0.5577	-0.015	1.0246	0.0395	-0.1768	0.0926	0.154	-0.0457	0.112	-0.0912	-0.1327	0.0063	0.0687	0.0042	0.0402	0.1373	-0.037	0.0364	-11.8805	57.8699	41.6247

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	10 - 17
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	18 - 350
3	X-RAY DIFFRACTION	3	B	10 - 37
4	X-RAY DIFFRACTION	4	B	38 - 350
5	X-RAY DIFFRACTION	5	C	10 - 17
6	X-RAY DIFFRACTION	6	C	18 - 350
7	X-RAY DIFFRACTION	7	D	10 - 17
8	X-RAY DIFFRACTION	8	D	18 - 350
9	X-RAY DIFFRACTION	9	E	10 - 17
10	X-RAY DIFFRACTION	10	E	18 - 350
11	X-RAY DIFFRACTION	11	F	10 - 38
12	X-RAY DIFFRACTION	12	F	39 - 350

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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