登録情報 | データベース: PDB / ID: 5m5p |
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タイトル | S. cerevisiae spliceosomal helicase Brr2 (271-end) in complex with the Jab/MPN domain of S. cerevisiae Prp8 |
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要素 | - Pre-mRNA-splicing factor 8
- Pre-mRNA-splicing helicase BRR2
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キーワード | HYDROLASE / splicing / helicase / complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
spliceosome conformational change to release U4 (or U4atac) and U1 (or U11) / generation of catalytic spliceosome for second transesterification step / mRNA 5'-splice site recognition / mRNA 3'-splice site recognition / spliceosomal tri-snRNP complex assembly / Prp19 complex / U5 snRNA binding / U5 snRNP / U2 snRNA binding / U6 snRNA binding ...spliceosome conformational change to release U4 (or U4atac) and U1 (or U11) / generation of catalytic spliceosome for second transesterification step / mRNA 5'-splice site recognition / mRNA 3'-splice site recognition / spliceosomal tri-snRNP complex assembly / Prp19 complex / U5 snRNA binding / U5 snRNP / U2 snRNA binding / U6 snRNA binding / pre-mRNA intronic binding / spliceosomal snRNP assembly / U1 snRNA binding / U4/U6 x U5 tri-snRNP complex / catalytic step 2 spliceosome / spliceosomal complex / mRNA splicing, via spliceosome / metallopeptidase activity / nucleic acid binding / RNA helicase activity / RNA helicase / mRNA binding / ATP hydrolysis activity / ATP binding / identical protein binding / nucleus / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Brr2, N-terminal helicase PWI domain / : / N-terminal helicase PWI domain / Pre-mRNA-splicing helicase BRR2 plug domain / Winged Helix-turn-helix domain / Sec63 Brl domain / : / Sec63 domain / Sec63 Brl domain / PROCT domain ...Brr2, N-terminal helicase PWI domain / : / N-terminal helicase PWI domain / Pre-mRNA-splicing helicase BRR2 plug domain / Winged Helix-turn-helix domain / Sec63 Brl domain / : / Sec63 domain / Sec63 Brl domain / PROCT domain / Prp8 RNase domain IV, fingers region / PROCT (NUC072) domain / PRO8NT domain / PROCN domain / Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U6-snRNA-binding / Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U5-snRNA-binding / RNA recognition motif, spliceosomal PrP8 / PRP8 domain IV core / Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U5-snRNA-binding domain superfamily / Prp8 RNase domain IV, palm region / PRO8NT (NUC069), PrP8 N-terminal domain / PROCN (NUC071) domain / U6-snRNA interacting domain of PrP8 / U5-snRNA binding site 2 of PrP8 / RNA recognition motif of the spliceosomal PrP8 / PRP8 domain IV core / Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 / JAB/MPN domain / JAB1/MPN/MOV34 metalloenzyme domain / MPN domain / MPN domain profile. / DEAD/DEAH box helicase domain / DEAD/DEAH box helicase / C2 domain superfamily / Helicase conserved C-terminal domain / helicase superfamily c-terminal domain / Immunoglobulin E-set / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / Ribonuclease H-like superfamily / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 Pre-mRNA-splicing helicase BRR2 / Pre-mRNA-splicing factor 8類似検索 - 構成要素 |
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生物種 |  Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 4.2 Å |
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データ登録者 | Becke, C. / Absmeier, E. / Wollenhaupt, J. / Santos, K.F. / Wahl, M.C. |
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資金援助 | ドイツ, 4件 組織 | 認可番号 | 国 |
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German Research Foundation | SFB 740 | ドイツ | Bundesministerium fuer Bildung und Forschung | 05K10KEC | ドイツ | Einstein Foundation Berlin | A-2012-140 | ドイツ | Freie Universitaet Berlin | Dahlem International Network PostDoc Fellowship | ドイツ |
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引用 | ジャーナル: Cell Cycle / 年: 2017 タイトル: Interplay of cis- and trans-regulatory mechanisms in the spliceosomal RNA helicase Brr2. 著者: Absmeier, E. / Becke, C. / Wollenhaupt, J. / Santos, K.F. / Wahl, M.C. |
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履歴 | 登録 | 2016年10月22日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2016年12月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年1月11日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年1月25日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年9月6日 | Group: Author supporting evidence / Data collection / Refinement description カテゴリ: diffrn / diffrn_detector ...diffrn / diffrn_detector / diffrn_radiation / diffrn_radiation_wavelength / pdbx_audit_support / software Item: _diffrn.ambient_temp / _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2017年10月18日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn / diffrn_radiation / Item: _diffrn.ambient_temp |
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改定 1.5 | 2018年11月21日 | Group: Advisory / Data collection / Derived calculations / カテゴリ: pdbx_validate_close_contact / struct_conn |
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改定 1.6 | 2019年10月16日 | Group: Data collection / カテゴリ: reflns_shell |
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改定 1.7 | 2024年1月17日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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