登録情報 データベース : PDB / ID : 5ko9 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of the SRAP Domain of Human HMCES Protein 要素Embryonic stem cell-specific 5-hydroxymethylcytosine-binding protein 詳細 キーワード DNA BINDING PROTEIN / SRAP Domain / DNA-binding / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
protein-DNA covalent cross-linking activity / 付加脱離酵素(リアーゼ) / DNA-(abasic site) binding / positive regulation of isotype switching / protein-DNA covalent cross-linking repair / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素 / double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining / somatic hypermutation of immunoglobulin genes / interstrand cross-link repair / replication fork ... protein-DNA covalent cross-linking activity / 付加脱離酵素(リアーゼ) / DNA-(abasic site) binding / positive regulation of isotype switching / protein-DNA covalent cross-linking repair / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素 / double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining / somatic hypermutation of immunoglobulin genes / interstrand cross-link repair / replication fork / peptidase activity / single-stranded DNA binding / DNA damage response / proteolysis 類似検索 - 分子機能 SOS response associated peptidase-like / hypothetical protein yedk fold / SOS response associated peptidase (SRAP) / SOS response associated peptidase-like / SOS response associated peptidase (SRAP) / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.5 Å 詳細データ登録者 Halabelian, L. / Li, Y. / Bountra, C. / Edwards, A.M. / Arrowsmith, C.H. / Structural Genomics Consortium (SGC) 引用ジャーナル : Nat.Struct.Mol.Biol. / 年 : 2019タイトル : Structural basis of HMCES interactions with abasic DNA and multivalent substrate recognition.著者 : Halabelian, L. / Ravichandran, M. / Li, Y. / Zeng, H. / Rao, A. / Aravind, L. / Arrowsmith, C.H. 履歴 登録 2016年6月29日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2016年8月24日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2019年6月26日 Group : Data collection / Database references / Derived calculationsカテゴリ : citation / citation_author ... citation / citation_author / pdbx_prerelease_seq / pdbx_struct_oper_list Item : _citation.country / _citation.journal_abbrev ... _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation 改定 1.2 2019年11月13日 Group : Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first ... _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID 改定 1.3 2023年10月4日 Group : Data collection / Database references / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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