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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5jvf | ||||||
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Title | Crystal Structure of Apo-FleN | ||||||
![]() | Site-determining protein | ||||||
![]() | TRANSCRIPTION / FleN / Antiactivator / Pseudomonas | ||||||
Function / homology | ![]() negative regulation of cell division / cytoplasmic side of plasma membrane / ATP hydrolysis activity / ATP binding / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Jain, D. / Chanchal / Banerjee, P. | ||||||
Funding support | ![]()
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![]() | ![]() Title: ATP-Induced Structural Remodeling in the Antiactivator FleN Enables Formation of the Functional Dimeric Form Authors: Chanchal / Banerjee, P. / Jain, D. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 121.8 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 94.3 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 451.2 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 457.5 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 15.2 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 22 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
| |||||||||
Components on special symmetry positions |
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Components
#1: Protein | Mass: 30484.309 Da / Num. of mol.: 1 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() | ||||
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#2: Chemical | ChemComp-IOD / #3: Chemical | ChemComp-GOL / #4: Water | ChemComp-HOH / | |
-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.51 Å3/Da / Density % sol: 51.07 % |
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Crystal grow | Temperature: 277 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / Details: 0.2M Ammonium iodide, 20% PEG3350 |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() |
Detector | Type: MAR CCD 165 mm / Detector: CCD / Date: Oct 4, 2014 |
Radiation | Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Wavelength: 0.95372 Å / Relative weight: 1 |
Reflection | Resolution: 1.66→28.69 Å / Num. obs: 65124 / % possible obs: 99.6 % / Redundancy: 7.3 % / Net I/σ(I): 17.6 |
Reflection shell | Resolution: 1.66→1.75 Å |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]()
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Solvent computation | Shrinkage radii: 0.9 Å / VDW probe radii: 1.11 Å / Solvent model: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 1.66→25.573 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell |
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Refinement TLS params. | Method: refined / Origin x: 29.774 Å / Origin y: 1.909 Å / Origin z: 50.341 Å
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Refinement TLS group | Selection details: chain 'A' and (resid 8 through 273 ) |