HMG (high mobility group) box / HMG boxes A and B DNA-binding domains profile. / high mobility group / High mobility group box domain / High mobility group box domain superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性
DNA / DNA (> 10) / ARS-binding factor 2, mitochondrial 類似検索 - 構成要素
モノクロメーター: channel cut ESRF monochromator / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.9795 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.12→43.483 Å / Num. obs: 35516 / % possible obs: 96.1 % / 冗長度: 3.7 % / CC1/2: 0.998 / Rmerge(I) obs: 0.06649 / Net I/σ(I): 11.3
反射 シェル
解像度: 2.12→2.18 Å / 冗長度: 1.9 % / % possible all: 68.3
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
PHENIX
(1.10.1_2155: ???)
精密化
XDS
データ削減
XDS
データスケーリング
PHENIX
1.10.1_2155
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: PARTIAL MODEL OBTAINED WITH SINGLE ANOMALOUS DIFFRACTION 解像度: 2.18→43.483 Å / SU ML: 0.31 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 27.58 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.2364
1881
5.65 %
Rwork
0.209
-
-
obs
0.2106
33291
98.47 %
溶媒の処理
減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL