登録情報 データベース : PDB / ID : 5jaj 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of chicken LGP2 witha 5'p 10-mer dsRNA and ADP-AlF4-Mg. 要素LGP2 RNA (5'-R(P*GP*GP*UP*AP*CP*GP*UP*AP*CP*C)-3')RNA (5'-R(P*GP*GP*UP*AP*CP*GP*UP*AP*CP*CP*C)-3') 詳細キーワード RNA BINDING PROTEIN / Innate immune pattern recognition receptor / RIG-I like helcase / dsRNA binding / dsRNA-dependent ATPase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
negative regulation of RIG-I signaling pathway / antiviral innate immune response / double-stranded RNA binding / RNA helicase activity / single-stranded RNA binding / RNA helicase / hydrolase activity / DNA binding / zinc ion binding / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 - #30 / phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 / RIG-I-like receptor, C-terminal / : / RIG-I receptor C-terminal domain / RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain / RIG-I-like receptor, C-terminal domain superfamily / C-terminal domain of RIG-I / RIG-I-like receptor (RLR) C-terminal regulatory (CTR) domain profile. / Helicase/UvrB, N-terminal ... phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 - #30 / phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 / RIG-I-like receptor, C-terminal / : / RIG-I receptor C-terminal domain / RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain / RIG-I-like receptor, C-terminal domain superfamily / C-terminal domain of RIG-I / RIG-I-like receptor (RLR) C-terminal regulatory (CTR) domain profile. / Helicase/UvrB, N-terminal / Type III restriction enzyme, res subunit / Helicase conserved C-terminal domain / helicase superfamily c-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases / Up-down Bundle / Rossmann fold / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / TETRAFLUOROALUMINATE ION / TRIFLUOROMAGNESATE / RNA / RNA (> 10) / RNA helicase 類似検索 - 構成要素生物種 Gallus gallus (ニワトリ)synthetic construct (人工物) 手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.5 Å 詳細データ登録者 Cusack, S. / Uchikawa, E. 資金援助 フランス, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 European Research Council 322586 フランス
引用ジャーナル : Mol.Cell / 年 : 2016タイトル : Structural Analysis of dsRNA Binding to Anti-viral Pattern Recognition Receptors LGP2 and MDA5.著者 : Uchikawa, E. / Lethier, M. / Malet, H. / Brunel, J. / Gerlier, D. / Cusack, S. 履歴 登録 2016年4月12日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年6月1日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2019年2月20日 Group : Author supporting evidence / Data collection ... Author supporting evidence / Data collection / Derived calculations / Source and taxonomy カテゴリ : pdbx_audit_support / pdbx_entity_src_syn / struct_connItem : _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id / _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific改定 1.2 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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