- PDB-5ir6: The structure of bd oxidase from Geobacillus thermodenitrificans -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5ir6
タイトル
The structure of bd oxidase from Geobacillus thermodenitrificans
要素
Bd-type quinol oxidase subunit I
Bd-type quinol oxidase subunit II
Putative membrane protein
キーワード
OXIDOREDUCTASE / bd oxidase / terminal oxidase
機能・相同性
機能・相同性情報
cytochrome complex / aerobic electron transport chain / membrane => GO:0016020 / electron transfer activity / membrane / metal ion binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.73829 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 3.8→49 Å / Num. obs: 16612 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 32.1 % / Rrim(I) all: 0.014 / Rsym value: 0.096 / Net I/σ(I): 21.2
反射 シェル
解像度: 3.8→3.9 Å / 冗長度: 32.3 % / Mean I/σ(I) obs: 3.7 / Rpim(I) all: 0.2 / Rsym value: 1.75 / % possible all: 98.9
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0073
精密化
XDS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
SHELX
位相決定
PHENIX
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 3.8→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.918 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.893 / SU B: 62.819 / SU ML: 0.813 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.81 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT