登録情報 | データベース: PDB / ID: 5gpc |
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タイトル | Structural analysis of fatty acid degradation regulator FadR from Bacillus halodurans |
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要素 | - DNA (5'-D(P*CP*AP*TP*GP*AP*AP*TP*GP*AP*GP*TP*AP*TP*TP*CP*AP*TP*TP*CP*AP*T)-3')
- DNA (5'-D(P*GP*AP*TP*GP*AP*AP*TP*GP*AP*AP*TP*AP*CP*TP*CP*AP*TP*TP*CP*AP*T)-3')
- Transcriptional regulator (TetR/AcrR family)
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キーワード | TRANSCRIPTION / DNA BINDING PROTEIN/DNA / fadR / transcriptional regulator / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
transcription cis-regulatory region binding / DNA-binding transcription factor activity類似検索 - 分子機能 Transcription regulator YsiA, C-terminal / YsiA-like protein, C-terminal region / Tetracycline Repressor, domain 2 / Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain superfamily / Tetracycline Repressor; domain 2 / Bacterial regulatory proteins, tetR family / DNA-binding HTH domain, TetR-type / TetR-type HTH domain profile. / Homeodomain-like / Homeobox-like domain superfamily ...Transcription regulator YsiA, C-terminal / YsiA-like protein, C-terminal region / Tetracycline Repressor, domain 2 / Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain superfamily / Tetracycline Repressor; domain 2 / Bacterial regulatory proteins, tetR family / DNA-binding HTH domain, TetR-type / TetR-type HTH domain profile. / Homeodomain-like / Homeobox-like domain superfamily / Arc Repressor Mutant, subunit A / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Transcriptional regulator (TetR/AcrR family)類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bacillus halodurans (バクテリア) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.8 Å |
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データ登録者 | Lee, J.Y. / Yeo, H.K. / Park, T.W. |
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資金援助 | 韓国, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Research Foundation of Korea | NRF; 2014R1A1A1A05008017 | 韓国 | Agriculture Research Center | ARC; 710003-03 | 韓国 | Global PhD Fellowship program | NRF-2011-0031110 | 韓国 |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2017 タイトル: Structural basis of operator sites recognition and effector binding in the TetR family transcription regulator FadR. 著者: Yeo, H.K. / Park, Y.W. / Lee, J.Y. |
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履歴 | 登録 | 2016年8月1日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年3月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年12月6日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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