PDB-5ezl: Crystal Structure of Fab of parasite invasion inhibitory antibody...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ezl

タイトル

Crystal Structure of Fab of parasite invasion inhibitory antibody c1 - monoclinic form

要素

(Fab c12) x 2

キーワード

IMMUNE SYSTEM / MALARIA INHIBITORY ANTIBODY / FAB / cyrpa

機能・相同性

Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta

機能・相同性情報

生物種

Mus musculus (ハツカネズミ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.43 Å

データ登録者

Favuzza, P. / Pluschke, G. / Rudolph, M.G.

引用

ジャーナル: Elife / 年: 2017
タイトル: Structure of the malaria vaccine candidate antigen CyRPA and its complex with a parasite invasion inhibitory antibody.
著者: Favuzza, P. / Guffart, E. / Tamborrini, M. / Scherer, B. / Dreyer, A.M. / Rufer, A.C. / Erny, J. / Hoernschemeyer, J. / Thoma, R. / Schmid, G. / Gsell, B. / Lamelas, A. / Benz, J. / Joseph, C. ...

履歴

登録	2015年11月26日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2017年1月11日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年3月1日	Group: Structure summary
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_special_symmetry / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_seq_id ..._atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_entity_nonpoly.entity_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_special_symmetry.label_asym_id / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5ezl.cif.gz	350.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5ezl.ent.gz	285.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5ezl.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5ezl_validation.pdf.gz	788.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5ezl_full_validation.pdf.gz	792.7 KB	表示
XML形式データ	5ezl_validation.xml.gz	32 KB	表示
CIF形式データ	5ezl_validation.cif.gz	46 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/5ezl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/5ezl	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5eziSC 5ezjSC 5eznC 5ezoC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1bfo-4 4mhh-4 1fl3-2 5ezj-d 4llu-1 6u85-d 1kno-3 4mhh-3 1ub5-1 4mhj-9 4kkb-2 4kjq-2 5yup-d 4lou-3 6w4v-d 6wos-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Fab c12

B: Fab c12

H: Fab c12

L: Fab c12

ヘテロ分子

95.2 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Fab c12

B: Fab c12

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
47.7 kDa, 2 ポリマー
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2

H: Fab c12

L: Fab c12

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
47.5 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	101.420, 108.900, 97.400
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 97.750, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	H-448- HOH

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	chain A
2	1	chain H
1	2	chain B
2	2	chain L

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	chain A	A	15 - 251
2	1	1	chain H	H	15 - 250
1	1	2	chain B	B	25 - 237
2	1	2	chain L	L	25 - 237

NCSアンサンブル:

ID
1
2

#1: 抗体

Fab c12

分子量: 23676.471 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Mus musculus (ハツカネズミ) / 発現宿主:

Mus musculus (ハツカネズミ)

#2: 抗体

Fab c12

分子量: 23581.146 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Mus musculus (ハツカネズミ) / 発現宿主:

Mus musculus (ハツカネズミ)

#3: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#4: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 190 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.82 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.37 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 / 詳細: 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.0, 20% PEG 8000

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SLS

/ ビームライン: X10SA / 波長: 1.00002 Å

検出器

タイプ: PSI PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年10月6日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.00002 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.43→48.2 Å / Num. obs: 39274 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.4 % / B_iso Wilson estimate: 48.088 Å² / CC_1/2: 0.992 / R_merge(I) obs: 0.148 / R_rim(I) all: 0.176 / Χ²: 0.941 / Net I/σ(I): 7.77 / Num. measured all: 133813

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	最高解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. possible	Num. unique obs	CC_1/2	R_rim(I) all	% possible all
2.43-2.49		3.5	1.411	0.99	10195	2924	2911	0.313	1.666	99.6
2.49-2.56			1.238	1.15	9909	2860	2854	0.403	1.463	99.8
2.56-2.64			1.101	1.29	9208	2708	2688	0.447	1.306	99.3
2.64-2.72			0.882	1.59	8883	2705	2686	0.555	1.052	99.3
2.72-2.81			0.646	2.11	8407	2602	2571	0.656	0.773	98.8
2.81-2.9			0.542	2.61	8575	2505	2478	0.75	0.642	98.9
2.9-3.01			0.416	3.33	8477	2436	2411	0.84	0.492	99
3.01-3.14			0.312	4.39	8019	2334	2319	0.911	0.371	99.4
3.14-3.28			0.24	5.76	7555	2253	2239	0.95	0.286	99.4
3.28-3.44			0.175	7.42	6953	2152	2127	0.965	0.209	98.8
3.44-3.62			0.126	9.83	6991	2052	2044	0.982	0.149	99.6
3.62-3.84			0.109	11.37	6717	1926	1912	0.987	0.129	99.3
3.84-4.11			0.081	14.66	6249	1814	1802	0.991	0.096	99.3
4.11-4.44			0.061	17.43	5538	1705	1690	0.995	0.073	99.1
4.44-4.86			0.052	20.07	5270	1566	1553	0.996	0.062	99.2
4.86-5.43			0.053	19.9	4909	1406	1395	0.998	0.063	99.2
5.43-6.27			0.065	16.89	4196	1259	1254	0.994	0.077	99.6
6.27-7.68			0.061	17.06	3531	1071	1066	0.995	0.073	99.5
7.68-10.87			0.035	26.97	2787	824	819	0.998	0.042	99.4
	10.87		0.025	31.45	1444	468	455	0.999	0.03	97.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
PHENIX		精密化
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5ezi, 5ezj

5ezi

5ezj

解像度: 2.43→48.2 Å / SU ML: 0.43 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 30.12 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2452	1964	5 %
R_work	0.1868	-	-
obs	0.1898	39244	99.2 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 145.02 Å² / B_iso mean: 47.1049 Å² / B_iso min: 19.69 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.43→48.2 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6644	0	42	190	6876
B_iso mean	-	-	80.3	43.43	-
残基数	-	-	-	-	870

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	1992	X-RAY DIFFRACTION	6.625	TORSIONAL
1	2	H	1992	X-RAY DIFFRACTION	6.625	TORSIONAL
2	1	B	1985	X-RAY DIFFRACTION	6.625	TORSIONAL
2	2	L	1985	X-RAY DIFFRACTION	6.625	TORSIONAL

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.5087	-1.1217	-0.3828	5.1002	0.8879	3.4094	-0.014	0.0992	0.0752	0.1126	-0.1112	0.3435	0	-0.4014	0.1165	0.2539	0.0091	-0.018	0.3254	-0.0116	0.3039	19.4082	33.9488	-16.0995
2	1.3394	-0.9704	-0.1672	3.1514	-1.0696	1.532	-0.0497	0.032	-0.144	0.1275	-0.1577	-0.1174	-0.2804	0.0678	0.1306	0.3263	-0.0676	0.0171	0.404	-0.0079	0.3163	29.7652	19.8858	3.2821
3	1.7198	-0.4643	-0.0838	1.3501	-0.2208	4.4287	0.1043	0.0005	0.0271	0.2071	-0.0492	-0.0213	-0.1824	-0.0875	-0.0101	0.3664	-0.058	0.0076	0.2559	0.009	0.2892	29.0755	16.4752	10.1622
4	2.6788	-0.7728	0.7441	2.2211	-2.334	7.4354	0.0068	0.2252	0.142	0.1703	-0.3092	-0.3962	-0.5182	0.5782	0.3989	0.3739	-0.0512	0.0088	0.3322	0.0072	0.4261	37.715	49.669	-2.9405
5	2.9451	0.4158	0.6799	3.4404	1.1767	1.8711	-0.0416	-0.0268	0.1289	0.1733	0.1044	-0.0222	-0.2712	0.0725	-0.0452	0.3254	0.0237	-0.0125	0.2649	0.0118	0.3312	27.4305	49.5953	-4.9562
6	2.0576	-1.3288	1.4191	3.7527	-0.0944	2.5217	-0.0167	0.0115	0.1371	0.1816	-0.2134	-0.2658	-0.3727	0.1309	0.1582	0.3188	-0.0233	-0.009	0.3776	0.0798	0.3493	42.3473	23.2604	13.2324
7	3.1744	-2.4962	1.1661	5.4977	-0.3703	2.4068	0.2156	0.2894	0.1032	-0.5811	-0.1623	0.0071	0.0468	0.4017	-0.0222	0.4849	-0.0313	0.0869	0.5144	0.0712	0.3518	43.7777	24.9812	9.5628
8	2.8468	-1.6127	1.3948	2.4784	0.275	3.7049	0.1326	0.2256	0.1202	0.329	-0.3785	-0.8306	0.2467	0.2908	0.1475	0.4349	-0.0004	-0.0241	0.4278	0.0937	0.4038	48.2097	15.3872	15.4285
9	2.0307	0.5385	-0.633	5.0779	-3.0303	3.8029	0.101	-0.2167	0.2059	0.6476	0.0703	0.0283	-0.434	-0.122	-0.1962	0.3372	-0.0057	0.0066	0.2973	-0.029	0.2888	26.6365	23.6148	62.106
10	2.2831	-0.0992	-0.5021	3.6717	0.5508	5.8171	-0.1173	0.1116	0.1178	-0.1586	0.252	-0.0334	0.3608	0.187	-0.1461	0.2468	-0.0214	0	0.2248	-0.0063	0.3018	34.9213	18.4514	59.2425
11	7.331	5.509	-1.6181	6.5325	-5.1145	6.671	-0.1273	-0.0061	-0.438	0.1993	-0.4857	-0.624	-0.1173	0.5195	0.5968	0.2925	0.0263	-0.0301	0.2137	-0.0376	0.3826	35.6616	26.713	57.0983
12	3.7513	2.6037	-1.4398	5.9427	-1.062	2.1031	0.0771	0.0728	0.0316	0.7121	-0.0132	0.005	-0.0049	-0.2702	-0.0798	0.3005	-0.02	-0.0036	0.3127	-0.0172	0.2624	26.2319	16.9729	56.7325
13	5.5216	0.2992	0.6509	2.8388	0.3056	1.1899	-0.0612	0.4578	-0.3144	-0.3662	-0.0096	0.1573	-0.1742	0.0343	0.0269	0.355	0.0418	0.0068	0.3334	-0.0367	0.2973	13.2907	39.0933	39.0951
14	3.1796	0.2168	1.2679	3.1943	0.4273	2.8969	0.1555	0.097	-0.3917	-0.095	-0.1105	0.2604	-0.086	-0.2536	-0.0762	0.2983	0.0364	-0.0037	0.3055	-0.031	0.4001	9.5986	38.2256	40.489
15	7.9745	-1.8421	2.518	2.2671	-0.5385	3.5373	0.4148	0.2629	-0.3147	-0.5273	-0.1985	0.3243	0.3137	0.1915	-0.1153	0.525	-0.0082	-0.0037	0.2406	-0.0345	0.3454	24.4339	5.7285	37.5361
16	2.3688	-0.9985	1.0281	3.5162	0.1169	2.209	-0.0955	0.1732	-0.057	-0.223	0.0121	0.3162	0.0565	-0.1337	0.1252	0.3068	-0.0802	-0.027	0.2925	0.0012	0.2887	23.4465	2.8527	48.516
17	4.0746	-0.5933	2.7825	3.2286	-0.4914	4.2128	-0.3543	0.1985	-0.0658	-0.2332	0.1487	-0.0181	-0.3949	0.0325	0.1751	0.2951	-0.0042	0.0315	0.2033	0.005	0.2327	24.8183	7.7676	46.967
18	6.7597	-4.515	4.9878	3.1084	-3.4731	3.8448	0.733	0.0816	-0.5161	-1.0596	-0.1693	0.8699	0.3592	-0.0273	-0.4	0.4754	0.0438	-0.1579	0.4436	-0.065	0.6423	11.7716	13.8898	30.8264
19	1.8901	1.6124	0.367	7.2434	-0.5584	2.9267	0.301	0.2757	-0.2777	-0.0844	-0.2457	0.2148	0.0398	0.0165	-0.041	0.3324	0.0728	-0.0323	0.4023	-0.0403	0.3805	11.6846	35.7378	28.8594
20	7.108	2.2456	-1.9458	8.0575	-0.4338	8.7978	-0.3273	1.6814	-0.8462	-1.4245	0.1705	-0.9562	0.1017	0.2788	0.082	0.6971	0.0093	0.1812	0.669	-0.1024	0.4445	16.7508	36.9763	16.5867
21	3.6013	2.7105	0.7524	3.8509	-2.1313	4.2749	-0.0261	0.2669	-0.6383	-0.5163	0.1505	-0.9936	0.5655	-0.1428	-0.0927	0.5602	0.1385	-0.0394	0.4648	-0.1448	0.6435	15.0443	25.1398	31.3289
22	4.64	1.4092	0.8978	2.1298	-0.2181	3.8501	-0.2851	0.7344	0.2211	-1.4662	0.0858	-0.0304	-0.1749	-0.2456	0.2313	0.6094	-0.0317	0.0322	0.5018	0.0193	0.3371	15.7313	42.8868	21.9293
23	3.4376	2.6556	1.1811	4.7733	-0.1382	2.9423	-0.0285	0.238	-0.0206	-1.6869	-0.1245	0.9666	0.1065	-0.3467	0.0552	0.7135	-0.0067	-0.1391	0.6257	-0.103	0.4758	6.8557	34.151	18.4694

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 15 through 119 )	A	15 - 119
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 120 through 154 )	A	120 - 154
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 155 through 236 )	A	155 - 236
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 25 through 49 )	B	25 - 49
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 50 through 126 )	B	50 - 126
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 127 through 174 )	B	127 - 174
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 175 through 196 )	B	175 - 196
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 197 through 237 )	B	197 - 237
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'H' and (resid 15 through 47 )	H	15 - 47
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'H' and (resid 48 through 90 )	H	48 - 90
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'H' and (resid 91 through 105 )	H	91 - 105
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'H' and (resid 106 through 131 )	H	106 - 131
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'H' and (resid 132 through 177 )	H	132 - 177
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'H' and (resid 178 through 236 )	H	178 - 236
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'L' and (resid 25 through 42 )	L	25 - 42
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'L' and (resid 43 through 99 )	L	43 - 99
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'L' and (resid 100 through 125 )	L	100 - 125
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'L' and (resid 126 through 137 )	L	126 - 137
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'L' and (resid 138 through 168 )	L	138 - 168
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'L' and (resid 169 through 179 )	L	169 - 179
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'L' and (resid 180 through 198 )	L	180 - 198
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'L' and (resid 199 through 221 )	L	199 - 221
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'L' and (resid 222 through 237 )	L	222 - 237

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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