PDB-5cer: Bd0816 Predatory Endopeptidase from Bdellovibrio bacteriovorus in...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5cer

タイトル

Bd0816 Predatory Endopeptidase from Bdellovibrio bacteriovorus in complex with immunity protein Bd3460

要素

Bd0816
Bd3460

キーワード

IMMUNE SYSTEM / transpeptidase and ankyrin repeat

機能・相同性

機能・相同性情報

peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / proteolysis
類似検索 - 分子機能

生物種

Bdellovibrio bacteriovorus HD100 (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.48 Å

データ登録者

Lovering, A.L. / Cadby, I.T. / Lambert, C. / Sockett, R.E.

資金援助

英国, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2015
タイトル: Ankyrin-mediated self-protection during cell invasion by the bacterial predator Bdellovibrio bacteriovorus.
著者: Lambert, C. / Cadby, I.T. / Till, R. / Bui, N.K. / Lerner, T.R. / Hughes, W.S. / Lee, D.J. / Alderwick, L.J. / Vollmer, W. / Sockett, E.R. / Lovering, A.L.

履歴

登録	2015年7月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2015年12月9日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年12月16日	Group: Database references
改定 1.2	2017年8月30日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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文書・詳細版	5cer_full_validation.pdf.gz	567.7 KB	表示
XML形式データ	5cer_validation.xml.gz	132 KB	表示
CIF形式データ	5cer_validation.cif.gz	187.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ce/5cer ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ce/5cer	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5ceaC 5cebC 5cecSC 5cedC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5cec-d 4hdo-d 5hyh-1 4fk3-d 4hdq-d 3r8i-d 5w7c-2 6oq4-d 1tnb-5 6p4x-4 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#29 - 2002年5月ペニシリン結合タンパク質 (Penicillin-binding Proteins) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Bd0816

B: Bd3460

C: Bd0816

D: Bd3460

E: Bd0816

F: Bd3460

G: Bd0816

H: Bd3460

I: Bd0816

J: Bd3460

K: Bd0816

L: Bd3460

ヘテロ分子

390 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Bd0816

B: Bd3460

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
65.1 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Bd0816

D: Bd3460

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3

E: Bd0816

F: Bd3460

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4

G: Bd0816

H: Bd3460

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5

I: Bd0816

J: Bd3460

ヘテロ分子

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6

K: Bd0816

L: Bd3460

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単位格子

Length a, b, c (Å)	237.450, 212.320, 90.900
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Dom-ID	Ens-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	A	1 - 401
2	1	C	1 - 401
1	2	A	1 - 401
2	2	E	1 - 401
1	3	A	1 - 398
2	3	G	1 - 398
1	4	A	1 - 401
2	4	I	1 - 401
1	5	A	1 - 399
2	5	K	1 - 399
1	6	B	28 - 220
2	6	D	28 - 220
1	7	B	28 - 220
2	7	F	28 - 220
1	8	B	28 - 220
2	8	H	28 - 220
1	9	B	28 - 220
2	9	J	28 - 220
1	10	B	28 - 220
2	10	L	28 - 220
1	11	C	1 - 401
2	11	E	1 - 401
1	12	C	1 - 398
2	12	G	1 - 398
1	13	C	1 - 401
2	13	I	1 - 401
1	14	C	1 - 399
2	14	K	1 - 399
1	15	D	28 - 220
2	15	F	28 - 220
1	16	D	28 - 220
2	16	H	28 - 220
1	17	D	28 - 220
2	17	J	28 - 220
1	18	D	28 - 220
2	18	L	28 - 220
1	19	E	1 - 398
2	19	G	1 - 398
1	20	E	1 - 401
2	20	I	1 - 401
1	21	E	1 - 399
2	21	K	1 - 399
1	22	F	28 - 220
2	22	H	28 - 220
1	23	F	28 - 220
2	23	J	28 - 220
1	24	F	28 - 220
2	24	L	28 - 220
1	25	G	1 - 398
2	25	I	1 - 398
1	26	G	1 - 398
2	26	K	1 - 398
1	27	H	28 - 220
2	27	J	28 - 220
1	28	H	28 - 220
2	28	L	28 - 220
1	29	I	1 - 399
2	29	K	1 - 399
1	30	J	28 - 220
2	30	L	28 - 220

NCSアンサンブル:

#1: タンパク質	Bd0816 分子量: 44521.594 Da / 分子数: 6 / 断片: Bd0816 / 変異: K26M, S58A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Bdellovibrio bacteriovorus HD100 (バクテリア) 遺伝子: Bd0816 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) 参照: UniProt: Q6MPN2, serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase
#2: タンパク質	Bd3460 分子量: 20550.508 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Bdellovibrio bacteriovorus HD100 (バクテリア) 遺伝子: Bd3460 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q6MHS9
#3: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1356 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.63 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.16 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 / 詳細: 0.1M Na HEPES pH 7.5, 0.2M MgCl2, 25% w/v PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I04 / 波長: 0.92001 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年9月26日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.92001 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.48→100 Å / Num. obs: 153169 / % possible obs: 99 % / 冗長度: 13.5 % / R_sym value: 0.156 / Net I/σ(I): 15.1
反射シェル	冗長度: 14 % / Mean I/σ(I) obs: 15.1 / R_sym value: 0.753

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0103	精密化
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5CEC

5cec

解像度: 2.48→100 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.914 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.888 / SU B: 18.896 / SU ML: 0.22 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.472 / ESU R Free: 0.273 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2491	7978	5 %	RANDOM
R_work	0.215	-	-	-
obs	0.2167	153169	98.79 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.7 Å / 減衰半径: 0.7 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 238.35 Å² / B_iso mean: 43.935 Å² / B_iso min: 6.17 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	2.18 Å²	-0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.49 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-1.69 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.48→100 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	27359	0	4	1356	28719
B_iso mean	-	-	36.78	34.22	-
残基数	-	-	-	-	3561

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.014	0.019	27725
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.01	0.02	27363
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.683	1.966	37344
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.861	3	63069
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.437	5	3548
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.435	26.017	1175
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.141	15	5239
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	13.982	15	96
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.098	0.2	4324
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.009	0.02	31455
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.007	0.02	5917
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.117	2.017	14231
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	1.117	2.017	14230
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.819	3.022	17763

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	49732	0.08
1	2	C	49732	0.08
2	1	A	49000	0.08
2	2	E	49000	0.08
3	1	A	49228	0.09
3	2	G	49228	0.09
4	1	A	49128	0.08
4	2	I	49128	0.08
5	1	A	48424	0.1
5	2	K	48424	0.1
6	1	B	24028	0.08
6	2	D	24028	0.08
7	1	B	23806	0.08
7	2	F	23806	0.08
8	1	B	23846	0.09
8	2	H	23846	0.09
9	1	B	23690	0.1
9	2	J	23690	0.1
10	1	B	23660	0.09
10	2	L	23660	0.09
11	1	C	49172	0.09
11	2	E	49172	0.09
12	1	C	49116	0.09
12	2	G	49116	0.09
13	1	C	49124	0.09
13	2	I	49124	0.09
14	1	C	48946	0.09
14	2	K	48946	0.09
15	1	D	23848	0.09
15	2	F	23848	0.09
16	1	D	23882	0.09
16	2	H	23882	0.09
17	1	D	23854	0.09
17	2	J	23854	0.09
18	1	D	23606	0.1
18	2	L	23606	0.1
19	1	E	49492	0.08
19	2	G	49492	0.08
20	1	E	49564	0.08
20	2	I	49564	0.08
21	1	E	49158	0.08
21	2	K	49158	0.08
22	1	F	23978	0.08
22	2	H	23978	0.08
23	1	F	23626	0.09
23	2	J	23626	0.09
24	1	F	24038	0.08
24	2	L	24038	0.08
25	1	G	49358	0.09
25	2	I	49358	0.09
26	1	G	49330	0.08
26	2	K	49330	0.08
27	1	H	23810	0.09
27	2	J	23810	0.09
28	1	H	23914	0.09
28	2	L	23914	0.09
29	1	I	49386	0.08
29	2	K	49386	0.08
30	1	J	23560	0.1
30	2	L	23560	0.1

LS精密化シェル

解像度: 2.48→2.544 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.29	563	-
R_work	0.257	11331	-
all	-	11894	-
obs	-	-	99.44 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.5675	0.2069	0.3872	0.8719	0.3077	0.941	-0.0444	-0.0294	0.0326	-0.0099	0.0105	-0.1045	-0.0902	0.2011	0.0339	0.0347	-0.0371	-0.0259	0.1508	0.0003	0.0425	-39.949	30.864	-28.22
2	2.8693	1.6108	-0.3375	1.4655	-2.4881	9.6011	0.0554	0.2035	-0.0045	-0.059	-0.0351	0.0062	0.2149	0.4945	-0.0203	0.28	-0.0174	0.0087	0.2791	-0.0088	0.1654	-31.343	42.618	-37.565
3	2.4374	0.7105	-0.5453	2.7126	-0.873	3.9475	-0.0945	0.0732	0.2573	0.0421	0.0762	-0.1648	-0.1888	0.0233	0.0183	0.1357	-0.0577	-0.0891	0.1803	-0.0545	0.1456	-34.427	42.542	-16.529
4	1.1837	0.0575	0.3318	1.3177	0.2542	1.5039	0.0237	0.0177	0.021	-0.0196	0.0431	-0.006	0.1024	0.1111	-0.0667	0.0537	-0.0146	-0.0322	0.09	-0.0113	0.0259	-47.383	23.64	-35.201
5	1.0358	-0.5325	0.1019	7.2574	-1.7419	2.6678	0.0196	-0.1073	0.0093	0.0392	0.0824	0.3178	-0.0231	0.0251	-0.102	0.0254	-0.0093	-0.0233	0.0921	-0.0054	0.0447	-64.087	19.77	-38.086
6	12.7706	6.8803	4.8619	4.3542	2.1316	3.3954	0.4296	-0.6212	0.0115	0.2563	-0.3961	-0.0766	0.2298	-0.2725	-0.0335	0.1552	-0.0316	-0.0111	0.1427	-0.008	0.024	-43.857	25.915	-15.418
7	6.6121	2.3865	2.5123	9.4275	-4.0526	9.6526	-0.4918	0.2467	1.063	-0.1855	0.095	-0.646	-1.1078	0.0446	0.3968	0.3177	-0.0538	-0.0755	0.2247	0.02	0.4602	-55.656	53.202	-37.895
8	1.6407	-0.4399	0.2394	4.2505	-1.2778	2.589	-0.0435	-0.1563	0.4286	0.0736	-0.1914	-0.2404	-0.3512	0.0061	0.2349	0.1633	0.0116	-0.112	0.115	-0.0299	0.1811	-66.728	45.879	-34.972
9	0.1634	0.1386	0.2544	5.3344	3.9385	7.215	0.0135	-0.1273	0.0607	0.4117	0.1536	-0.1052	0.0932	-0.2084	-0.1671	0.0819	0.0427	-0.0456	0.1931	-0.0229	0.1305	-75.97	39.403	-33.592
10	2.0929	0.7418	0.3461	4.1099	0.1691	0.4405	-0.0369	-0.2588	0.0177	0.441	-0.0323	0.2011	0.0183	-0.1551	0.0692	0.0706	0.0066	-0.0135	0.2699	-0.0189	0.1207	-79.263	29.526	-30.562
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57	4.5633	2.5779	4.1148	4.2242	6.1313	9.0756	-0.6889	0.0099	0.7774	-0.1275	-0.5708	0.9926	-0.3772	-0.5794	1.2597	0.3865	-0.1492	0.0997	0.4571	-0.2658	0.5214	-159.741	36.777	-32.966
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65	1.4709	-0.1039	-0.0227	1.4623	-0.3325	2.9016	-0.0127	0.1965	0.1869	-0.0547	0.0578	0.275	-0.0121	-0.6663	-0.0451	0.0621	-0.0069	0.0198	0.2567	0.0313	0.099	-154.459	35.249	-75.047
66	1.2114	-0.0812	-0.3698	0.6297	-0.5747	2.6921	0.0268	-0.0075	-0.0801	0.0386	-0.001	-0.0102	0.3568	-0.1679	-0.0257	0.1108	-0.0526	0.015	0.0549	-0.0292	0.0515	-142.016	24.739	-64.271
67	11.7906	2.3422	0.1471	4.6747	-3.628	8.0697	0.048	0.7796	0.6223	-0.144	0.4349	0.194	-0.4751	-0.4814	-0.4829	0.3567	0.0658	0.0746	0.2455	0.0522	0.1999	-131.445	33.026	-90.592
68	23.0014	0.7293	-5.4584	6.0708	0.646	1.7072	-0.4294	1.05	1.2389	-1.2115	0.3003	0.1026	0.0806	-0.547	0.1291	0.7202	-0.0348	0.1121	0.6222	-0.197	0.6705	-129.855	31.452	-99.869
69	6.3411	2.6891	-0.2867	5.2674	0.1092	5.2086	-0.1156	0.6775	-0.072	-0.6937	0.1788	-0.0493	0.1096	-0.0693	-0.0632	0.2283	-0.0223	0.0475	0.2227	-0.0059	0.0503	-125.801	25.944	-89.03
70	1.988	0.2514	-0.8111	2.5813	-0.6147	4.0867	-0.0056	0.2168	-0.3107	-0.1574	0.1133	-0.2049	0.2945	0.0715	-0.1077	0.0893	0.0101	0.0345	0.0865	-0.0704	0.1167	-121.755	19.582	-76.947
71	2.7285	-0.3511	-0.1585	2.849	0.6031	3.7363	-0.1099	-0.2608	-0.4218	0.0424	-0.0007	-0.2599	0.5741	0.4496	0.1106	0.134	0.0876	0.015	0.119	0.0301	0.2723	-119.165	11.796	-61.039
72	4.5196	-4.3561	12.8589	4.3173	-12.5592	36.8368	0.8738	-0.029	-0.7192	-0.3014	0.4462	0.4057	1.3604	-0.2577	-1.3201	1.0812	0.3904	-0.7341	0.6502	-0.0609	1.8465	-120.692	4.467	-51.353

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	26 - 124
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	125 - 136
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	137 - 195
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	196 - 333
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	334 - 381
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	382 - 401
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	28 - 54
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	55 - 114
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	115 - 131
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	132 - 176
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	177 - 209
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	210 - 220
13	X-RAY DIFFRACTION	13	C	26 - 125
14	X-RAY DIFFRACTION	14	C	126 - 152
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	153 - 177
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	178 - 198
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	199 - 370
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	371 - 401
19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	28 - 54
20	X-RAY DIFFRACTION	20	D	55 - 68
21	X-RAY DIFFRACTION	21	D	69 - 86
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	87 - 129
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	130 - 188
24	X-RAY DIFFRACTION	24	D	189 - 220
25	X-RAY DIFFRACTION	25	E	26 - 65
26	X-RAY DIFFRACTION	26	E	66 - 157
27	X-RAY DIFFRACTION	27	E	158 - 204
28	X-RAY DIFFRACTION	28	E	205 - 354
29	X-RAY DIFFRACTION	29	E	355 - 381
30	X-RAY DIFFRACTION	30	E	382 - 401
31	X-RAY DIFFRACTION	31	F	28 - 53
32	X-RAY DIFFRACTION	32	F	54 - 86
33	X-RAY DIFFRACTION	33	F	87 - 142
34	X-RAY DIFFRACTION	34	F	143 - 154
35	X-RAY DIFFRACTION	35	F	155 - 209
36	X-RAY DIFFRACTION	36	F	210 - 220
37	X-RAY DIFFRACTION	37	G	26 - 118
38	X-RAY DIFFRACTION	38	G	119 - 147
39	X-RAY DIFFRACTION	39	G	148 - 187
40	X-RAY DIFFRACTION	40	G	188 - 333
41	X-RAY DIFFRACTION	41	G	334 - 375
42	X-RAY DIFFRACTION	42	G	376 - 399
43	X-RAY DIFFRACTION	43	H	28 - 54
44	X-RAY DIFFRACTION	44	H	55 - 68
45	X-RAY DIFFRACTION	45	H	69 - 86
46	X-RAY DIFFRACTION	46	H	87 - 189
47	X-RAY DIFFRACTION	47	H	190 - 213
48	X-RAY DIFFRACTION	48	H	214 - 220
49	X-RAY DIFFRACTION	49	I	26 - 70
50	X-RAY DIFFRACTION	50	I	71 - 152
51	X-RAY DIFFRACTION	51	I	153 - 193
52	X-RAY DIFFRACTION	52	I	194 - 321
53	X-RAY DIFFRACTION	53	I	322 - 382
54	X-RAY DIFFRACTION	54	I	383 - 401
55	X-RAY DIFFRACTION	55	J	28 - 50
56	X-RAY DIFFRACTION	56	J	51 - 60
57	X-RAY DIFFRACTION	57	J	61 - 76
58	X-RAY DIFFRACTION	58	J	77 - 145
59	X-RAY DIFFRACTION	59	J	146 - 209
60	X-RAY DIFFRACTION	60	J	210 - 220
61	X-RAY DIFFRACTION	61	K	26 - 59
62	X-RAY DIFFRACTION	62	K	60 - 125
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69	X-RAY DIFFRACTION	69	L	55 - 87
70	X-RAY DIFFRACTION	70	L	88 - 143
71	X-RAY DIFFRACTION	71	L	144 - 214
72	X-RAY DIFFRACTION	72	L	215 - 220

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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