登録情報 データベース : PDB / ID : 5a5f 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル CRYSTAL STRUCTURE OF MURD LIGASE FROM ESCHERICHIA COLI IN COMPLEX WITH UMA AND ADP 要素UDP-N-ACETYLMURAMOYLALANINE--D-GLUTAMATE LIGASE 詳細 キーワード LIGASE / PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS / ADP-FORMING ENZYME / CELL WALL / CELL SHAPE / CELL CYCLE / NUCLEOTIDE-BINDING / ATP- BINDING / CELL DIVISION / LIGAND / CONFORMATION機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine-D-glutamate ligase / UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase activity / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / regulation of cell shape / cell division / ATP binding / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Mur ligase MurD-like, N-terminal domain / UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase MurD / Mur ligase, C-terminal domain / Mur-like, catalytic domain / Mur ligase, C-terminal / Mur ligase, glutamate ligase domain / Mur ligase, C-terminal domain superfamily / Mur ligase, central / Mur-like, catalytic domain superfamily / Mur ligase middle domain ... Mur ligase MurD-like, N-terminal domain / UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase MurD / Mur ligase, C-terminal domain / Mur-like, catalytic domain / Mur ligase, C-terminal / Mur ligase, glutamate ligase domain / Mur ligase, C-terminal domain superfamily / Mur ligase, central / Mur-like, catalytic domain superfamily / Mur ligase middle domain / UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase / Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / MALONATE ION / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-N-ACETYLMURAMOYL-L-ALANINE / UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli K-12 (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.9 Å 詳細データ登録者 Sink, R. / Kotnik, M. / Zega, A. / Barreteau, H. / Gobec, S. / Blanot, D. / Dessen, A. / Contreras-Martel, C. 引用ジャーナル : PLoS ONE / 年 : 2016タイトル : Crystallographic Study of Peptidoglycan Biosynthesis Enzyme MurD: Domain Movement Revisited.著者 : Sink, R. / Kotnik, M. / Zega, A. / Barreteau, H. / Gobec, S. / Blanot, D. / Dessen, A. / Contreras-Martel, C. 履歴 登録 2015年6月17日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年4月13日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2018年2月28日 Group : Database references / Source and taxonomy / カテゴリ : citation / entity_src_genItem : _citation.journal_abbrev / _citation.page_first ... _citation.journal_abbrev / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _entity_src_gen.gene_src_strain / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain 改定 1.2 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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