登録情報 | データベース: PDB / ID: 4xio |
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タイトル | Crystal structure of apo NanB sialidase from streptococcus pneumoniae at pH 8.0 with MPD as the cryoprotectant |
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要素 | Sialidase B |
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キーワード | HYDROLASE / intramolecular trans-sialidase / glycosidase / drug design / neuraminidase / allosteric inhibitor / serendipitous allosteric sites / crystallization artefacts |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
ganglioside catabolic process / oligosaccharide catabolic process / exo-alpha-(2->3)-sialidase activity / exo-alpha-(2->6)-sialidase activity / exo-alpha-(2->8)-sialidase activity / exo-alpha-sialidase / intracellular membrane-bounded organelle / membrane / cytoplasm類似検索 - 分子機能 BNR repeat / BNR/Asp-box repeat / Intramolecular trans-sialidase; domain 3 / Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 / Trans-sialidase, domain 3 / Glycoside hydrolase, family 33, N-terminal / Sialidase, N-terminal domain / BNR repeat-like domain / Sialidase family / Sialidase ...BNR repeat / BNR/Asp-box repeat / Intramolecular trans-sialidase; domain 3 / Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 / Trans-sialidase, domain 3 / Glycoside hydrolase, family 33, N-terminal / Sialidase, N-terminal domain / BNR repeat-like domain / Sialidase family / Sialidase / Neuraminidase - #10 / Sialidase superfamily / 6 Propeller / Neuraminidase / Jelly Rolls - #200 / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / Beta Barrel / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Streptococcus pneumoniae TIGR4 (肺炎レンサ球菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.8 Å |
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データ登録者 | Brear, P. |
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資金援助 | 英国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Biotechnology and Biological Sciences Research Council | | 英国 | SULSA | | 英国 |
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引用 | ジャーナル: To be published タイトル: `The Hunt for Serendipitous Allosteric Sites: Discovery of a novel allosteric inhibitor of the bacterial sialidase NanB 著者: Rogers, G.W. / Brear, P. / Yang, L. / Chen, A.S. / Mitchell, J.B.O. / Taylor, G.L. / Westwood, N.J. |
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履歴 | 登録 | 2015年1月7日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2016年1月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 2.0 | 2017年8月30日 | Group: Advisory / Atomic model / Author supporting evidence カテゴリ: atom_site / pdbx_audit_support / pdbx_distant_solvent_atoms Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_seq_id / _pdbx_distant_solvent_atoms.neighbor_macromolecule_distance |
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改定 2.1 | 2024年1月10日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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